Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4I3

TRABD, TraB domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRABDQ9H4I3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRABDQ9H4I3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
TRABDQ9H4I3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRABDQ9H4I3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRABDQ9H4I3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRABDQ9H4I3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRABDQ9H4I3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRABDQ9H4I3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRABDQ9H4I3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRABDQ9H4I3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
TRABDQ9H4I3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRABDQ9H4I3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRABDQ9H4I3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRABDQ9H4I3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TRABDQ9H4I3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TRABDQ9H4I3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRABDQ9H4I3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRABDQ9H4I3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRABDQ9H4I3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRABDQ9H4I3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRABDQ9H4I3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRABDQ9H4I3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRABDQ9H4I3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRABDQ9H4I3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRABDQ9H4I3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRABDQ9H4I3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRABDQ9H4I3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRABDQ9H4I3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
TRABDQ9H4I3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRABDQ9H4I3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRABDQ9H4I3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRABDQ9H4I3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRABDQ9H4I3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRABDQ9H4I3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRABDQ9H4I3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRABDQ9H4I3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRABDQ9H4I3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRABDQ9H4I3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRABDQ9H4I3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRABDQ9H4I3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
TRABDQ9H4I3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRABDQ9H4I3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TRABDQ9H4I3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRABDQ9H4I3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRABDQ9H4I3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRABDQ9H4I3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRABDQ9H4I3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRABDQ9H4I3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRABDQ9H4I3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRABDQ9H4I3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRABDQ9H4I3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRABDQ9H4I3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRABDQ9H4I3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRABDQ9H4I3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRABDQ9H4I3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRABDQ9H4I3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRABDQ9H4I3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRABDQ9H4I3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRABDQ9H4I3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRABDQ9H4I3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRABDQ9H4I3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRABDQ9H4I3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRABDQ9H4I3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRABDQ9H4I3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRABDQ9H4I3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRABDQ9H4I3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRABDQ9H4I3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRABDQ9H4I3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRABDQ9H4I3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TRABDQ9H4I3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRABDQ9H4I3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRABDQ9H4I3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRABDQ9H4I3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRABDQ9H4I3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRABDQ9H4I3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRABDQ9H4I3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRABDQ9H4I3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRABDQ9H4I3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRABDQ9H4I3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRABDQ9H4I3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TRABDQ9H4I3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRABDQ9H4I3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRABDQ9H4I3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRABDQ9H4I3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRABDQ9H4I3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRABDQ9H4I3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRABDQ9H4I3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRABDQ9H4I3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
TRABDQ9H4I3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRABDQ9H4I3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRABDQ9H4I3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRABDQ9H4I3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRABDQ9H4I3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRABDQ9H4I3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRABDQ9H4I3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRABDQ9H4I3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRABDQ9H4I3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
TRABDQ9H4I3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRABDQ9H4I3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRABDQ9H4I3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms