Protein–RNA interactions for Protein: Q9H270

VPS11, Vacuolar protein sorting-associated protein 11 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS11Q9H270 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
VPS11Q9H270 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
VPS11Q9H270 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
VPS11Q9H270 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
VPS11Q9H270 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
VPS11Q9H270 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
VPS11Q9H270 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
VPS11Q9H270 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
VPS11Q9H270 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
VPS11Q9H270 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
VPS11Q9H270 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
VPS11Q9H270 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
VPS11Q9H270 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
VPS11Q9H270 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
VPS11Q9H270 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
VPS11Q9H270 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
VPS11Q9H270 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
VPS11Q9H270 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
VPS11Q9H270 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
VPS11Q9H270 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
VPS11Q9H270 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
VPS11Q9H270 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
VPS11Q9H270 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
VPS11Q9H270 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
VPS11Q9H270 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
VPS11Q9H270 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
VPS11Q9H270 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
VPS11Q9H270 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
VPS11Q9H270 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
VPS11Q9H270 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
VPS11Q9H270 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
VPS11Q9H270 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
VPS11Q9H270 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
VPS11Q9H270 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
VPS11Q9H270 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
VPS11Q9H270 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
VPS11Q9H270 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
VPS11Q9H270 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
VPS11Q9H270 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
VPS11Q9H270 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
VPS11Q9H270 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
VPS11Q9H270 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
VPS11Q9H270 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
VPS11Q9H270 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
VPS11Q9H270 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
VPS11Q9H270 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
VPS11Q9H270 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
VPS11Q9H270 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
VPS11Q9H270 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
VPS11Q9H270 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
VPS11Q9H270 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
VPS11Q9H270 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
VPS11Q9H270 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
VPS11Q9H270 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
VPS11Q9H270 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
VPS11Q9H270 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
VPS11Q9H270 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
VPS11Q9H270 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
VPS11Q9H270 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
VPS11Q9H270 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
VPS11Q9H270 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
VPS11Q9H270 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
VPS11Q9H270 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
VPS11Q9H270 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
VPS11Q9H270 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
VPS11Q9H270 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
VPS11Q9H270 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
VPS11Q9H270 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
VPS11Q9H270 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
VPS11Q9H270 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VPS11Q9H270 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VPS11Q9H270 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VPS11Q9H270 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
VPS11Q9H270 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
VPS11Q9H270 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
VPS11Q9H270 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VPS11Q9H270 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
VPS11Q9H270 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
VPS11Q9H270 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
VPS11Q9H270 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
VPS11Q9H270 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VPS11Q9H270 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
VPS11Q9H270 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VPS11Q9H270 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VPS11Q9H270 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VPS11Q9H270 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
VPS11Q9H270 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VPS11Q9H270 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VPS11Q9H270 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
VPS11Q9H270 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VPS11Q9H270 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
VPS11Q9H270 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
VPS11Q9H270 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VPS11Q9H270 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VPS11Q9H270 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
VPS11Q9H270 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VPS11Q9H270 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
VPS11Q9H270 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
VPS11Q9H270 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
VPS11Q9H270 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms