Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZM3

GSX2, GS homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSX2Q9BZM3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GSX2Q9BZM3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GSX2Q9BZM3 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GSX2Q9BZM3 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GSX2Q9BZM3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GSX2Q9BZM3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GSX2Q9BZM3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GSX2Q9BZM3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GSX2Q9BZM3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GSX2Q9BZM3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GSX2Q9BZM3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GSX2Q9BZM3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GSX2Q9BZM3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GSX2Q9BZM3 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GSX2Q9BZM3 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GSX2Q9BZM3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GSX2Q9BZM3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GSX2Q9BZM3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GSX2Q9BZM3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GSX2Q9BZM3 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GSX2Q9BZM3 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GSX2Q9BZM3 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GSX2Q9BZM3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GSX2Q9BZM3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GSX2Q9BZM3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GSX2Q9BZM3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GSX2Q9BZM3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GSX2Q9BZM3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GSX2Q9BZM3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GSX2Q9BZM3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GSX2Q9BZM3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GSX2Q9BZM3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GSX2Q9BZM3 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GSX2Q9BZM3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GSX2Q9BZM3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GSX2Q9BZM3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GSX2Q9BZM3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GSX2Q9BZM3 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GSX2Q9BZM3 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GSX2Q9BZM3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GSX2Q9BZM3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GSX2Q9BZM3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GSX2Q9BZM3 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GSX2Q9BZM3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GSX2Q9BZM3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GSX2Q9BZM3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GSX2Q9BZM3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GSX2Q9BZM3 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GSX2Q9BZM3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GSX2Q9BZM3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GSX2Q9BZM3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GSX2Q9BZM3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GSX2Q9BZM3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GSX2Q9BZM3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GSX2Q9BZM3 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GSX2Q9BZM3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GSX2Q9BZM3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GSX2Q9BZM3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GSX2Q9BZM3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GSX2Q9BZM3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GSX2Q9BZM3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GSX2Q9BZM3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GSX2Q9BZM3 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GSX2Q9BZM3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GSX2Q9BZM3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GSX2Q9BZM3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GSX2Q9BZM3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GSX2Q9BZM3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GSX2Q9BZM3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GSX2Q9BZM3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GSX2Q9BZM3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GSX2Q9BZM3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GSX2Q9BZM3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GSX2Q9BZM3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GSX2Q9BZM3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GSX2Q9BZM3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GSX2Q9BZM3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GSX2Q9BZM3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GSX2Q9BZM3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GSX2Q9BZM3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GSX2Q9BZM3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GSX2Q9BZM3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GSX2Q9BZM3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GSX2Q9BZM3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GSX2Q9BZM3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GSX2Q9BZM3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GSX2Q9BZM3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GSX2Q9BZM3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GSX2Q9BZM3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GSX2Q9BZM3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GSX2Q9BZM3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GSX2Q9BZM3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GSX2Q9BZM3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GSX2Q9BZM3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GSX2Q9BZM3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GSX2Q9BZM3 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GSX2Q9BZM3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GSX2Q9BZM3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GSX2Q9BZM3 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GSX2Q9BZM3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms