Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM54Q9BYV2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM54Q9BYV2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM54Q9BYV2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM54Q9BYV2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM54Q9BYV2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM54Q9BYV2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM54Q9BYV2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM54Q9BYV2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM54Q9BYV2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM54Q9BYV2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM54Q9BYV2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM54Q9BYV2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM54Q9BYV2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM54Q9BYV2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM54Q9BYV2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM54Q9BYV2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM54Q9BYV2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM54Q9BYV2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TRIM54Q9BYV2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TRIM54Q9BYV2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TRIM54Q9BYV2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM54Q9BYV2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM54Q9BYV2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM54Q9BYV2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM54Q9BYV2 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM54Q9BYV2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM54Q9BYV2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM54Q9BYV2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM54Q9BYV2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM54Q9BYV2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM54Q9BYV2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM54Q9BYV2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM54Q9BYV2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM54Q9BYV2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM54Q9BYV2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM54Q9BYV2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM54Q9BYV2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM54Q9BYV2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM54Q9BYV2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM54Q9BYV2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM54Q9BYV2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM54Q9BYV2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM54Q9BYV2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM54Q9BYV2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM54Q9BYV2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM54Q9BYV2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM54Q9BYV2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM54Q9BYV2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM54Q9BYV2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM54Q9BYV2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM54Q9BYV2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM54Q9BYV2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM54Q9BYV2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM54Q9BYV2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM54Q9BYV2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM54Q9BYV2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM54Q9BYV2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM54Q9BYV2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM54Q9BYV2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM54Q9BYV2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM54Q9BYV2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM54Q9BYV2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM54Q9BYV2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM54Q9BYV2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM54Q9BYV2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM54Q9BYV2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM54Q9BYV2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM54Q9BYV2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM54Q9BYV2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM54Q9BYV2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM54Q9BYV2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIM54Q9BYV2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIM54Q9BYV2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIM54Q9BYV2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM54Q9BYV2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM54Q9BYV2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM54Q9BYV2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM54Q9BYV2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM54Q9BYV2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM54Q9BYV2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM54Q9BYV2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM54Q9BYV2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM54Q9BYV2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM54Q9BYV2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM54Q9BYV2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM54Q9BYV2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM54Q9BYV2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM54Q9BYV2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM54Q9BYV2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM54Q9BYV2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM54Q9BYV2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM54Q9BYV2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM54Q9BYV2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM54Q9BYV2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM54Q9BYV2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM54Q9BYV2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM54Q9BYV2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM54Q9BYV2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM54Q9BYV2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms