Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIGD2AQ9BW72 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIGD2AQ9BW72 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIGD2AQ9BW72 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIGD2AQ9BW72 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIGD2AQ9BW72 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIGD2AQ9BW72 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIGD2AQ9BW72 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIGD2AQ9BW72 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIGD2AQ9BW72 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIGD2AQ9BW72 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIGD2AQ9BW72 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HIGD2AQ9BW72 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIGD2AQ9BW72 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIGD2AQ9BW72 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIGD2AQ9BW72 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIGD2AQ9BW72 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HIGD2AQ9BW72 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIGD2AQ9BW72 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIGD2AQ9BW72 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIGD2AQ9BW72 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIGD2AQ9BW72 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIGD2AQ9BW72 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIGD2AQ9BW72 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIGD2AQ9BW72 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIGD2AQ9BW72 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIGD2AQ9BW72 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIGD2AQ9BW72 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIGD2AQ9BW72 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HIGD2AQ9BW72 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIGD2AQ9BW72 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIGD2AQ9BW72 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIGD2AQ9BW72 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIGD2AQ9BW72 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIGD2AQ9BW72 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIGD2AQ9BW72 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIGD2AQ9BW72 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIGD2AQ9BW72 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIGD2AQ9BW72 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIGD2AQ9BW72 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIGD2AQ9BW72 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIGD2AQ9BW72 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIGD2AQ9BW72 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIGD2AQ9BW72 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HIGD2AQ9BW72 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HIGD2AQ9BW72 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HIGD2AQ9BW72 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HIGD2AQ9BW72 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HIGD2AQ9BW72 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HIGD2AQ9BW72 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HIGD2AQ9BW72 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HIGD2AQ9BW72 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HIGD2AQ9BW72 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HIGD2AQ9BW72 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIGD2AQ9BW72 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIGD2AQ9BW72 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIGD2AQ9BW72 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIGD2AQ9BW72 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HIGD2AQ9BW72 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HIGD2AQ9BW72 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HIGD2AQ9BW72 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIGD2AQ9BW72 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIGD2AQ9BW72 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIGD2AQ9BW72 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIGD2AQ9BW72 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HIGD2AQ9BW72 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HIGD2AQ9BW72 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HIGD2AQ9BW72 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HIGD2AQ9BW72 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HIGD2AQ9BW72 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HIGD2AQ9BW72 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HIGD2AQ9BW72 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HIGD2AQ9BW72 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIGD2AQ9BW72 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIGD2AQ9BW72 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIGD2AQ9BW72 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIGD2AQ9BW72 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIGD2AQ9BW72 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIGD2AQ9BW72 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIGD2AQ9BW72 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIGD2AQ9BW72 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIGD2AQ9BW72 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIGD2AQ9BW72 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIGD2AQ9BW72 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIGD2AQ9BW72 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIGD2AQ9BW72 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIGD2AQ9BW72 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIGD2AQ9BW72 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIGD2AQ9BW72 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIGD2AQ9BW72 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIGD2AQ9BW72 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIGD2AQ9BW72 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIGD2AQ9BW72 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIGD2AQ9BW72 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIGD2AQ9BW72 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIGD2AQ9BW72 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIGD2AQ9BW72 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIGD2AQ9BW72 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIGD2AQ9BW72 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIGD2AQ9BW72 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms