Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM9

URM1, Ubiquitin-related modifier 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
URM1Q9BTM9 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
URM1Q9BTM9 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
URM1Q9BTM9 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
URM1Q9BTM9 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
URM1Q9BTM9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
URM1Q9BTM9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
URM1Q9BTM9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
URM1Q9BTM9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
URM1Q9BTM9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
URM1Q9BTM9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
URM1Q9BTM9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
URM1Q9BTM9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
URM1Q9BTM9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
URM1Q9BTM9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
URM1Q9BTM9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
URM1Q9BTM9 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
URM1Q9BTM9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
URM1Q9BTM9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
URM1Q9BTM9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
URM1Q9BTM9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
URM1Q9BTM9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
URM1Q9BTM9 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
URM1Q9BTM9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
URM1Q9BTM9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
URM1Q9BTM9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
URM1Q9BTM9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
URM1Q9BTM9 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
URM1Q9BTM9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
URM1Q9BTM9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
URM1Q9BTM9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
URM1Q9BTM9 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
URM1Q9BTM9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
URM1Q9BTM9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
URM1Q9BTM9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
URM1Q9BTM9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
URM1Q9BTM9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
URM1Q9BTM9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
URM1Q9BTM9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
URM1Q9BTM9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
URM1Q9BTM9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
URM1Q9BTM9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
URM1Q9BTM9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
URM1Q9BTM9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
URM1Q9BTM9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
URM1Q9BTM9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
URM1Q9BTM9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
URM1Q9BTM9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
URM1Q9BTM9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
URM1Q9BTM9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
URM1Q9BTM9 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
URM1Q9BTM9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
URM1Q9BTM9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
URM1Q9BTM9 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
URM1Q9BTM9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
URM1Q9BTM9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
URM1Q9BTM9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
URM1Q9BTM9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
URM1Q9BTM9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
URM1Q9BTM9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
URM1Q9BTM9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
URM1Q9BTM9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
URM1Q9BTM9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
URM1Q9BTM9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
URM1Q9BTM9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
URM1Q9BTM9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
URM1Q9BTM9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
URM1Q9BTM9 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
URM1Q9BTM9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
URM1Q9BTM9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
URM1Q9BTM9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
URM1Q9BTM9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
URM1Q9BTM9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
URM1Q9BTM9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
URM1Q9BTM9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
URM1Q9BTM9 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
URM1Q9BTM9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
URM1Q9BTM9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
URM1Q9BTM9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
URM1Q9BTM9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
URM1Q9BTM9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
URM1Q9BTM9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
URM1Q9BTM9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
URM1Q9BTM9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
URM1Q9BTM9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
URM1Q9BTM9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
URM1Q9BTM9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
URM1Q9BTM9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
URM1Q9BTM9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
URM1Q9BTM9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
URM1Q9BTM9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
URM1Q9BTM9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
URM1Q9BTM9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
URM1Q9BTM9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
URM1Q9BTM9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
URM1Q9BTM9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
URM1Q9BTM9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
URM1Q9BTM9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
URM1Q9BTM9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
URM1Q9BTM9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
URM1Q9BTM9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms