Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C2orf88Q9BSF0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C2orf88Q9BSF0 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C2orf88Q9BSF0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C2orf88Q9BSF0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C2orf88Q9BSF0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C2orf88Q9BSF0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C2orf88Q9BSF0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C2orf88Q9BSF0 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C2orf88Q9BSF0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C2orf88Q9BSF0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C2orf88Q9BSF0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C2orf88Q9BSF0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C2orf88Q9BSF0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C2orf88Q9BSF0 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C2orf88Q9BSF0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C2orf88Q9BSF0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C2orf88Q9BSF0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C2orf88Q9BSF0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C2orf88Q9BSF0 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C2orf88Q9BSF0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C2orf88Q9BSF0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C2orf88Q9BSF0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C2orf88Q9BSF0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C2orf88Q9BSF0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C2orf88Q9BSF0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C2orf88Q9BSF0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C2orf88Q9BSF0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C2orf88Q9BSF0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C2orf88Q9BSF0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C2orf88Q9BSF0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C2orf88Q9BSF0 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C2orf88Q9BSF0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C2orf88Q9BSF0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C2orf88Q9BSF0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C2orf88Q9BSF0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C2orf88Q9BSF0 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C2orf88Q9BSF0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C2orf88Q9BSF0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C2orf88Q9BSF0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C2orf88Q9BSF0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C2orf88Q9BSF0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C2orf88Q9BSF0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C2orf88Q9BSF0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C2orf88Q9BSF0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C2orf88Q9BSF0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C2orf88Q9BSF0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C2orf88Q9BSF0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C2orf88Q9BSF0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C2orf88Q9BSF0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C2orf88Q9BSF0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C2orf88Q9BSF0 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C2orf88Q9BSF0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C2orf88Q9BSF0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C2orf88Q9BSF0 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
C2orf88Q9BSF0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C2orf88Q9BSF0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C2orf88Q9BSF0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C2orf88Q9BSF0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C2orf88Q9BSF0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C2orf88Q9BSF0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C2orf88Q9BSF0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C2orf88Q9BSF0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C2orf88Q9BSF0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C2orf88Q9BSF0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C2orf88Q9BSF0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C2orf88Q9BSF0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C2orf88Q9BSF0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C2orf88Q9BSF0 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C2orf88Q9BSF0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C2orf88Q9BSF0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C2orf88Q9BSF0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C2orf88Q9BSF0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
C2orf88Q9BSF0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
C2orf88Q9BSF0 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
C2orf88Q9BSF0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
C2orf88Q9BSF0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
C2orf88Q9BSF0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
C2orf88Q9BSF0 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
C2orf88Q9BSF0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
C2orf88Q9BSF0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
C2orf88Q9BSF0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
C2orf88Q9BSF0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
C2orf88Q9BSF0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
C2orf88Q9BSF0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
C2orf88Q9BSF0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
C2orf88Q9BSF0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
C2orf88Q9BSF0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
C2orf88Q9BSF0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
C2orf88Q9BSF0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
C2orf88Q9BSF0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
C2orf88Q9BSF0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
C2orf88Q9BSF0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
C2orf88Q9BSF0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
C2orf88Q9BSF0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
C2orf88Q9BSF0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
C2orf88Q9BSF0 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C2orf88Q9BSF0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C2orf88Q9BSF0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
C2orf88Q9BSF0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms