Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRG1

VPS25, Vacuolar protein-sorting-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS25Q9BRG1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VPS25Q9BRG1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
VPS25Q9BRG1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VPS25Q9BRG1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VPS25Q9BRG1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VPS25Q9BRG1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS25Q9BRG1 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS25Q9BRG1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VPS25Q9BRG1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VPS25Q9BRG1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VPS25Q9BRG1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VPS25Q9BRG1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VPS25Q9BRG1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS25Q9BRG1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS25Q9BRG1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS25Q9BRG1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS25Q9BRG1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS25Q9BRG1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS25Q9BRG1 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VPS25Q9BRG1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VPS25Q9BRG1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VPS25Q9BRG1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VPS25Q9BRG1 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VPS25Q9BRG1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
VPS25Q9BRG1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VPS25Q9BRG1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VPS25Q9BRG1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS25Q9BRG1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS25Q9BRG1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS25Q9BRG1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VPS25Q9BRG1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
VPS25Q9BRG1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VPS25Q9BRG1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VPS25Q9BRG1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VPS25Q9BRG1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VPS25Q9BRG1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VPS25Q9BRG1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VPS25Q9BRG1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VPS25Q9BRG1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VPS25Q9BRG1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VPS25Q9BRG1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VPS25Q9BRG1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VPS25Q9BRG1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS25Q9BRG1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS25Q9BRG1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VPS25Q9BRG1 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VPS25Q9BRG1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS25Q9BRG1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS25Q9BRG1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS25Q9BRG1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS25Q9BRG1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS25Q9BRG1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS25Q9BRG1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS25Q9BRG1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VPS25Q9BRG1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VPS25Q9BRG1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VPS25Q9BRG1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VPS25Q9BRG1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VPS25Q9BRG1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
VPS25Q9BRG1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
VPS25Q9BRG1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VPS25Q9BRG1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VPS25Q9BRG1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VPS25Q9BRG1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VPS25Q9BRG1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VPS25Q9BRG1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VPS25Q9BRG1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
VPS25Q9BRG1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VPS25Q9BRG1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VPS25Q9BRG1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VPS25Q9BRG1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VPS25Q9BRG1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VPS25Q9BRG1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VPS25Q9BRG1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VPS25Q9BRG1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VPS25Q9BRG1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VPS25Q9BRG1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VPS25Q9BRG1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VPS25Q9BRG1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VPS25Q9BRG1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VPS25Q9BRG1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VPS25Q9BRG1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
VPS25Q9BRG1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
VPS25Q9BRG1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VPS25Q9BRG1 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
VPS25Q9BRG1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VPS25Q9BRG1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VPS25Q9BRG1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VPS25Q9BRG1 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
VPS25Q9BRG1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VPS25Q9BRG1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
VPS25Q9BRG1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
VPS25Q9BRG1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
VPS25Q9BRG1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VPS25Q9BRG1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VPS25Q9BRG1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VPS25Q9BRG1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
VPS25Q9BRG1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
VPS25Q9BRG1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VPS25Q9BRG1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms