Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RETNLBQ9BQ08 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RETNLBQ9BQ08 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RETNLBQ9BQ08 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RETNLBQ9BQ08 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RETNLBQ9BQ08 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RETNLBQ9BQ08 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RETNLBQ9BQ08 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RETNLBQ9BQ08 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RETNLBQ9BQ08 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RETNLBQ9BQ08 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RETNLBQ9BQ08 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RETNLBQ9BQ08 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RETNLBQ9BQ08 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RETNLBQ9BQ08 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RETNLBQ9BQ08 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RETNLBQ9BQ08 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RETNLBQ9BQ08 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RETNLBQ9BQ08 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RETNLBQ9BQ08 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RETNLBQ9BQ08 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RETNLBQ9BQ08 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RETNLBQ9BQ08 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RETNLBQ9BQ08 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RETNLBQ9BQ08 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RETNLBQ9BQ08 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RETNLBQ9BQ08 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RETNLBQ9BQ08 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RETNLBQ9BQ08 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RETNLBQ9BQ08 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RETNLBQ9BQ08 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RETNLBQ9BQ08 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RETNLBQ9BQ08 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RETNLBQ9BQ08 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RETNLBQ9BQ08 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RETNLBQ9BQ08 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RETNLBQ9BQ08 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RETNLBQ9BQ08 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RETNLBQ9BQ08 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RETNLBQ9BQ08 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RETNLBQ9BQ08 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RETNLBQ9BQ08 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RETNLBQ9BQ08 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RETNLBQ9BQ08 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RETNLBQ9BQ08 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RETNLBQ9BQ08 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RETNLBQ9BQ08 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RETNLBQ9BQ08 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RETNLBQ9BQ08 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RETNLBQ9BQ08 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RETNLBQ9BQ08 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RETNLBQ9BQ08 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RETNLBQ9BQ08 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RETNLBQ9BQ08 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RETNLBQ9BQ08 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RETNLBQ9BQ08 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RETNLBQ9BQ08 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RETNLBQ9BQ08 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RETNLBQ9BQ08 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RETNLBQ9BQ08 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RETNLBQ9BQ08 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RETNLBQ9BQ08 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RETNLBQ9BQ08 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RETNLBQ9BQ08 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RETNLBQ9BQ08 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RETNLBQ9BQ08 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RETNLBQ9BQ08 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RETNLBQ9BQ08 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RETNLBQ9BQ08 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RETNLBQ9BQ08 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RETNLBQ9BQ08 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RETNLBQ9BQ08 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RETNLBQ9BQ08 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RETNLBQ9BQ08 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RETNLBQ9BQ08 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RETNLBQ9BQ08 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RETNLBQ9BQ08 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RETNLBQ9BQ08 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RETNLBQ9BQ08 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RETNLBQ9BQ08 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RETNLBQ9BQ08 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RETNLBQ9BQ08 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RETNLBQ9BQ08 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RETNLBQ9BQ08 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RETNLBQ9BQ08 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RETNLBQ9BQ08 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RETNLBQ9BQ08 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RETNLBQ9BQ08 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RETNLBQ9BQ08 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RETNLBQ9BQ08 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RETNLBQ9BQ08 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RETNLBQ9BQ08 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RETNLBQ9BQ08 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RETNLBQ9BQ08 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RETNLBQ9BQ08 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RETNLBQ9BQ08 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RETNLBQ9BQ08 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RETNLBQ9BQ08 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RETNLBQ9BQ08 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RETNLBQ9BQ08 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms