Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
POP1Q99575 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.67
POP1Q99575 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
POP1Q99575 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
POP1Q99575 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
POP1Q99575 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
POP1Q99575 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC31.65■■■□□ 2.66
POP1Q99575 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
POP1Q99575 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
POP1Q99575 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
POP1Q99575 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
POP1Q99575 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
POP1Q99575 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
POP1Q99575 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
POP1Q99575 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
POP1Q99575 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
POP1Q99575 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
POP1Q99575 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
POP1Q99575 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
POP1Q99575 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
POP1Q99575 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
POP1Q99575 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
POP1Q99575 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
POP1Q99575 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
POP1Q99575 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.62
POP1Q99575 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
POP1Q99575 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
POP1Q99575 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
POP1Q99575 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
POP1Q99575 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
POP1Q99575 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
POP1Q99575 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
POP1Q99575 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
POP1Q99575 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
POP1Q99575 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.23■■■□□ 2.59
POP1Q99575 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
POP1Q99575 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
POP1Q99575 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
POP1Q99575 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
POP1Q99575 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
POP1Q99575 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
POP1Q99575 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
POP1Q99575 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
POP1Q99575 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
POP1Q99575 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
POP1Q99575 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
POP1Q99575 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
POP1Q99575 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
POP1Q99575 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
POP1Q99575 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
POP1Q99575 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
POP1Q99575 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
POP1Q99575 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
POP1Q99575 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
POP1Q99575 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
POP1Q99575 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
POP1Q99575 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
POP1Q99575 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
POP1Q99575 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
POP1Q99575 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
POP1Q99575 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
POP1Q99575 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
POP1Q99575 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
POP1Q99575 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
POP1Q99575 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
POP1Q99575 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
POP1Q99575 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
POP1Q99575 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
POP1Q99575 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
POP1Q99575 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
POP1Q99575 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
POP1Q99575 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
POP1Q99575 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
POP1Q99575 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
POP1Q99575 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
POP1Q99575 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
POP1Q99575 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
POP1Q99575 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
POP1Q99575 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
POP1Q99575 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
POP1Q99575 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
POP1Q99575 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
POP1Q99575 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
POP1Q99575 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
POP1Q99575 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
POP1Q99575 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
POP1Q99575 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
POP1Q99575 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
POP1Q99575 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
POP1Q99575 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.73■■■□□ 2.51
POP1Q99575 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
POP1Q99575 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
POP1Q99575 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
POP1Q99575 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
POP1Q99575 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
POP1Q99575 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
POP1Q99575 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
POP1Q99575 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
POP1Q99575 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
POP1Q99575 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms