Protein–RNA interactions for Protein: Q96P64

AGAP4, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP4Q96P64 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
AGAP4Q96P64 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
AGAP4Q96P64 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
AGAP4Q96P64 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
AGAP4Q96P64 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
AGAP4Q96P64 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
AGAP4Q96P64 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
AGAP4Q96P64 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
AGAP4Q96P64 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
AGAP4Q96P64 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AGAP4Q96P64 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AGAP4Q96P64 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
AGAP4Q96P64 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
AGAP4Q96P64 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
AGAP4Q96P64 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
AGAP4Q96P64 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
AGAP4Q96P64 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
AGAP4Q96P64 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
AGAP4Q96P64 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
AGAP4Q96P64 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
AGAP4Q96P64 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
AGAP4Q96P64 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
AGAP4Q96P64 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
AGAP4Q96P64 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
AGAP4Q96P64 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
AGAP4Q96P64 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
AGAP4Q96P64 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
AGAP4Q96P64 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
AGAP4Q96P64 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
AGAP4Q96P64 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
AGAP4Q96P64 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
AGAP4Q96P64 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
AGAP4Q96P64 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
AGAP4Q96P64 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
AGAP4Q96P64 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
AGAP4Q96P64 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
AGAP4Q96P64 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
AGAP4Q96P64 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
AGAP4Q96P64 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
AGAP4Q96P64 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
AGAP4Q96P64 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
AGAP4Q96P64 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
AGAP4Q96P64 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
AGAP4Q96P64 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
AGAP4Q96P64 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
AGAP4Q96P64 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
AGAP4Q96P64 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
AGAP4Q96P64 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
AGAP4Q96P64 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
AGAP4Q96P64 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
AGAP4Q96P64 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
AGAP4Q96P64 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
AGAP4Q96P64 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
AGAP4Q96P64 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
AGAP4Q96P64 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
AGAP4Q96P64 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
AGAP4Q96P64 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
AGAP4Q96P64 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
AGAP4Q96P64 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AGAP4Q96P64 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
AGAP4Q96P64 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
AGAP4Q96P64 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
AGAP4Q96P64 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
AGAP4Q96P64 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
AGAP4Q96P64 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
AGAP4Q96P64 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
AGAP4Q96P64 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
AGAP4Q96P64 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
AGAP4Q96P64 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
AGAP4Q96P64 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
AGAP4Q96P64 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
AGAP4Q96P64 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
AGAP4Q96P64 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
AGAP4Q96P64 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
AGAP4Q96P64 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
AGAP4Q96P64 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
AGAP4Q96P64 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
AGAP4Q96P64 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
AGAP4Q96P64 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
AGAP4Q96P64 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
AGAP4Q96P64 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
AGAP4Q96P64 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
AGAP4Q96P64 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
AGAP4Q96P64 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
AGAP4Q96P64 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
AGAP4Q96P64 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
AGAP4Q96P64 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
AGAP4Q96P64 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
AGAP4Q96P64 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
AGAP4Q96P64 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
AGAP4Q96P64 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
AGAP4Q96P64 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
AGAP4Q96P64 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
AGAP4Q96P64 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
AGAP4Q96P64 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
AGAP4Q96P64 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
AGAP4Q96P64 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
AGAP4Q96P64 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
AGAP4Q96P64 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
AGAP4Q96P64 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms