Protein–RNA interactions for Protein: Q96L94

SNX22, Sorting nexin-22, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX22Q96L94 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX22Q96L94 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX22Q96L94 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX22Q96L94 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX22Q96L94 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX22Q96L94 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX22Q96L94 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX22Q96L94 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX22Q96L94 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX22Q96L94 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX22Q96L94 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX22Q96L94 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX22Q96L94 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX22Q96L94 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX22Q96L94 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX22Q96L94 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX22Q96L94 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX22Q96L94 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX22Q96L94 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX22Q96L94 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX22Q96L94 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX22Q96L94 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX22Q96L94 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX22Q96L94 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX22Q96L94 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX22Q96L94 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX22Q96L94 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX22Q96L94 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX22Q96L94 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX22Q96L94 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX22Q96L94 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX22Q96L94 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX22Q96L94 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX22Q96L94 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX22Q96L94 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX22Q96L94 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX22Q96L94 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX22Q96L94 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX22Q96L94 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX22Q96L94 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX22Q96L94 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX22Q96L94 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX22Q96L94 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX22Q96L94 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX22Q96L94 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX22Q96L94 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX22Q96L94 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX22Q96L94 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX22Q96L94 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX22Q96L94 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX22Q96L94 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX22Q96L94 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX22Q96L94 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX22Q96L94 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX22Q96L94 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX22Q96L94 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX22Q96L94 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX22Q96L94 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX22Q96L94 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX22Q96L94 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX22Q96L94 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX22Q96L94 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX22Q96L94 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX22Q96L94 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX22Q96L94 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX22Q96L94 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX22Q96L94 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX22Q96L94 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX22Q96L94 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX22Q96L94 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX22Q96L94 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX22Q96L94 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX22Q96L94 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX22Q96L94 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX22Q96L94 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX22Q96L94 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX22Q96L94 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX22Q96L94 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX22Q96L94 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX22Q96L94 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX22Q96L94 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX22Q96L94 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX22Q96L94 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX22Q96L94 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX22Q96L94 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX22Q96L94 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX22Q96L94 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX22Q96L94 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX22Q96L94 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX22Q96L94 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX22Q96L94 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX22Q96L94 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX22Q96L94 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SNX22Q96L94 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX22Q96L94 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX22Q96L94 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX22Q96L94 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX22Q96L94 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX22Q96L94 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX22Q96L94 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.5 ms