Protein–RNA interactions for Protein: Q92786

PROX1, Prospero homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX1Q92786 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PROX1Q92786 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PROX1Q92786 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PROX1Q92786 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PROX1Q92786 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PROX1Q92786 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PROX1Q92786 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PROX1Q92786 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PROX1Q92786 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PROX1Q92786 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PROX1Q92786 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PROX1Q92786 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PROX1Q92786 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PROX1Q92786 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PROX1Q92786 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PROX1Q92786 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PROX1Q92786 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PROX1Q92786 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PROX1Q92786 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PROX1Q92786 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PROX1Q92786 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PROX1Q92786 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PROX1Q92786 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PROX1Q92786 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PROX1Q92786 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PROX1Q92786 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PROX1Q92786 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
PROX1Q92786 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PROX1Q92786 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PROX1Q92786 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PROX1Q92786 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PROX1Q92786 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PROX1Q92786 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PROX1Q92786 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PROX1Q92786 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PROX1Q92786 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PROX1Q92786 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PROX1Q92786 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PROX1Q92786 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PROX1Q92786 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PROX1Q92786 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PROX1Q92786 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PROX1Q92786 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PROX1Q92786 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PROX1Q92786 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PROX1Q92786 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PROX1Q92786 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PROX1Q92786 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PROX1Q92786 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PROX1Q92786 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PROX1Q92786 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PROX1Q92786 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PROX1Q92786 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PROX1Q92786 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PROX1Q92786 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PROX1Q92786 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PROX1Q92786 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PROX1Q92786 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PROX1Q92786 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PROX1Q92786 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PROX1Q92786 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PROX1Q92786 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PROX1Q92786 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PROX1Q92786 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PROX1Q92786 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PROX1Q92786 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PROX1Q92786 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PROX1Q92786 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PROX1Q92786 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PROX1Q92786 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PROX1Q92786 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PROX1Q92786 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PROX1Q92786 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PROX1Q92786 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PROX1Q92786 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PROX1Q92786 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PROX1Q92786 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PROX1Q92786 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PROX1Q92786 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PROX1Q92786 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PROX1Q92786 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PROX1Q92786 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PROX1Q92786 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PROX1Q92786 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PROX1Q92786 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PROX1Q92786 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PROX1Q92786 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PROX1Q92786 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PROX1Q92786 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PROX1Q92786 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PROX1Q92786 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PROX1Q92786 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PROX1Q92786 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PROX1Q92786 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PROX1Q92786 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PROX1Q92786 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PROX1Q92786 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PROX1Q92786 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PROX1Q92786 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PROX1Q92786 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms