Protein–RNA interactions for Protein: Q92565

RAPGEF5, Rap guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF5Q92565 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RAPGEF5Q92565 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
RAPGEF5Q92565 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RAPGEF5Q92565 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RAPGEF5Q92565 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RAPGEF5Q92565 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RAPGEF5Q92565 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RAPGEF5Q92565 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RAPGEF5Q92565 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RAPGEF5Q92565 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RAPGEF5Q92565 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RAPGEF5Q92565 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RAPGEF5Q92565 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RAPGEF5Q92565 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RAPGEF5Q92565 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
RAPGEF5Q92565 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RAPGEF5Q92565 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RAPGEF5Q92565 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RAPGEF5Q92565 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RAPGEF5Q92565 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RAPGEF5Q92565 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RAPGEF5Q92565 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RAPGEF5Q92565 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
RAPGEF5Q92565 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RAPGEF5Q92565 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RAPGEF5Q92565 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RAPGEF5Q92565 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RAPGEF5Q92565 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RAPGEF5Q92565 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RAPGEF5Q92565 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RAPGEF5Q92565 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RAPGEF5Q92565 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RAPGEF5Q92565 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RAPGEF5Q92565 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RAPGEF5Q92565 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RAPGEF5Q92565 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RAPGEF5Q92565 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
RAPGEF5Q92565 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RAPGEF5Q92565 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RAPGEF5Q92565 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RAPGEF5Q92565 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RAPGEF5Q92565 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RAPGEF5Q92565 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RAPGEF5Q92565 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RAPGEF5Q92565 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RAPGEF5Q92565 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RAPGEF5Q92565 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RAPGEF5Q92565 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RAPGEF5Q92565 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RAPGEF5Q92565 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RAPGEF5Q92565 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RAPGEF5Q92565 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RAPGEF5Q92565 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RAPGEF5Q92565 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
RAPGEF5Q92565 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RAPGEF5Q92565 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RAPGEF5Q92565 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RAPGEF5Q92565 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RAPGEF5Q92565 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RAPGEF5Q92565 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RAPGEF5Q92565 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RAPGEF5Q92565 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RAPGEF5Q92565 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RAPGEF5Q92565 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RAPGEF5Q92565 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RAPGEF5Q92565 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RAPGEF5Q92565 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RAPGEF5Q92565 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RAPGEF5Q92565 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RAPGEF5Q92565 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RAPGEF5Q92565 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RAPGEF5Q92565 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RAPGEF5Q92565 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RAPGEF5Q92565 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RAPGEF5Q92565 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RAPGEF5Q92565 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RAPGEF5Q92565 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RAPGEF5Q92565 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RAPGEF5Q92565 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RAPGEF5Q92565 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RAPGEF5Q92565 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RAPGEF5Q92565 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RAPGEF5Q92565 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RAPGEF5Q92565 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RAPGEF5Q92565 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RAPGEF5Q92565 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RAPGEF5Q92565 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RAPGEF5Q92565 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RAPGEF5Q92565 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RAPGEF5Q92565 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RAPGEF5Q92565 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RAPGEF5Q92565 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RAPGEF5Q92565 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RAPGEF5Q92565 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RAPGEF5Q92565 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RAPGEF5Q92565 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RAPGEF5Q92565 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RAPGEF5Q92565 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RAPGEF5Q92565 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RAPGEF5Q92565 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms