Protein–RNA interactions for Protein: Q92499

DDX1, ATP-dependent RNA helicase DDX1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX1Q92499 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
DDX1Q92499 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
DDX1Q92499 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
DDX1Q92499 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
DDX1Q92499 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
DDX1Q92499 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
DDX1Q92499 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
DDX1Q92499 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
DDX1Q92499 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
DDX1Q92499 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
DDX1Q92499 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
DDX1Q92499 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
DDX1Q92499 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
DDX1Q92499 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
DDX1Q92499 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
DDX1Q92499 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
DDX1Q92499 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
DDX1Q92499 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
DDX1Q92499 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
DDX1Q92499 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
DDX1Q92499 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
DDX1Q92499 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
DDX1Q92499 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
DDX1Q92499 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
DDX1Q92499 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
DDX1Q92499 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
DDX1Q92499 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
DDX1Q92499 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
DDX1Q92499 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
DDX1Q92499 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
DDX1Q92499 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
DDX1Q92499 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
DDX1Q92499 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
DDX1Q92499 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
DDX1Q92499 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
DDX1Q92499 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
DDX1Q92499 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
DDX1Q92499 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
DDX1Q92499 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
DDX1Q92499 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
DDX1Q92499 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
DDX1Q92499 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
DDX1Q92499 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
DDX1Q92499 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
DDX1Q92499 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
DDX1Q92499 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
DDX1Q92499 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
DDX1Q92499 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
DDX1Q92499 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
DDX1Q92499 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
DDX1Q92499 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
DDX1Q92499 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
DDX1Q92499 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
DDX1Q92499 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
DDX1Q92499 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
DDX1Q92499 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
DDX1Q92499 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
DDX1Q92499 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
DDX1Q92499 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
DDX1Q92499 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
DDX1Q92499 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
DDX1Q92499 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
DDX1Q92499 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
DDX1Q92499 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
DDX1Q92499 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
DDX1Q92499 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
DDX1Q92499 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
DDX1Q92499 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
DDX1Q92499 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
DDX1Q92499 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
DDX1Q92499 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
DDX1Q92499 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
DDX1Q92499 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
DDX1Q92499 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
DDX1Q92499 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
DDX1Q92499 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
DDX1Q92499 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
DDX1Q92499 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
DDX1Q92499 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
DDX1Q92499 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
DDX1Q92499 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
DDX1Q92499 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
DDX1Q92499 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
DDX1Q92499 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
DDX1Q92499 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
DDX1Q92499 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
DDX1Q92499 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
DDX1Q92499 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
DDX1Q92499 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
DDX1Q92499 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
DDX1Q92499 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
DDX1Q92499 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
DDX1Q92499 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
DDX1Q92499 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
DDX1Q92499 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
DDX1Q92499 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
DDX1Q92499 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
DDX1Q92499 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
DDX1Q92499 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
DDX1Q92499 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms