Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW18

C17orf50, Uncharacterized protein C17orf50, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf50Q8WW18 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C17orf50Q8WW18 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C17orf50Q8WW18 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C17orf50Q8WW18 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C17orf50Q8WW18 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C17orf50Q8WW18 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C17orf50Q8WW18 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
C17orf50Q8WW18 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C17orf50Q8WW18 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C17orf50Q8WW18 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C17orf50Q8WW18 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C17orf50Q8WW18 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C17orf50Q8WW18 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C17orf50Q8WW18 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C17orf50Q8WW18 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C17orf50Q8WW18 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C17orf50Q8WW18 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C17orf50Q8WW18 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C17orf50Q8WW18 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C17orf50Q8WW18 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C17orf50Q8WW18 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C17orf50Q8WW18 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C17orf50Q8WW18 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C17orf50Q8WW18 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C17orf50Q8WW18 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C17orf50Q8WW18 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C17orf50Q8WW18 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C17orf50Q8WW18 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C17orf50Q8WW18 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C17orf50Q8WW18 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
C17orf50Q8WW18 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C17orf50Q8WW18 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C17orf50Q8WW18 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C17orf50Q8WW18 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C17orf50Q8WW18 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C17orf50Q8WW18 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C17orf50Q8WW18 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C17orf50Q8WW18 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C17orf50Q8WW18 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C17orf50Q8WW18 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C17orf50Q8WW18 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C17orf50Q8WW18 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C17orf50Q8WW18 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C17orf50Q8WW18 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C17orf50Q8WW18 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C17orf50Q8WW18 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C17orf50Q8WW18 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C17orf50Q8WW18 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C17orf50Q8WW18 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C17orf50Q8WW18 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C17orf50Q8WW18 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C17orf50Q8WW18 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C17orf50Q8WW18 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C17orf50Q8WW18 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C17orf50Q8WW18 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C17orf50Q8WW18 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C17orf50Q8WW18 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C17orf50Q8WW18 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C17orf50Q8WW18 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C17orf50Q8WW18 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C17orf50Q8WW18 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C17orf50Q8WW18 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C17orf50Q8WW18 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C17orf50Q8WW18 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C17orf50Q8WW18 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C17orf50Q8WW18 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
C17orf50Q8WW18 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C17orf50Q8WW18 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C17orf50Q8WW18 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C17orf50Q8WW18 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C17orf50Q8WW18 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C17orf50Q8WW18 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C17orf50Q8WW18 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C17orf50Q8WW18 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
C17orf50Q8WW18 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C17orf50Q8WW18 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C17orf50Q8WW18 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C17orf50Q8WW18 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C17orf50Q8WW18 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C17orf50Q8WW18 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C17orf50Q8WW18 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C17orf50Q8WW18 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C17orf50Q8WW18 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C17orf50Q8WW18 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C17orf50Q8WW18 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C17orf50Q8WW18 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C17orf50Q8WW18 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C17orf50Q8WW18 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C17orf50Q8WW18 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C17orf50Q8WW18 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C17orf50Q8WW18 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C17orf50Q8WW18 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C17orf50Q8WW18 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C17orf50Q8WW18 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C17orf50Q8WW18 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C17orf50Q8WW18 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C17orf50Q8WW18 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C17orf50Q8WW18 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
C17orf50Q8WW18 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C17orf50Q8WW18 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms