Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4H3

HDDC2, HD domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC2Q7Z4H3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HDDC2Q7Z4H3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HDDC2Q7Z4H3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HDDC2Q7Z4H3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HDDC2Q7Z4H3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDDC2Q7Z4H3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HDDC2Q7Z4H3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HDDC2Q7Z4H3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HDDC2Q7Z4H3 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HDDC2Q7Z4H3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDDC2Q7Z4H3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HDDC2Q7Z4H3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
HDDC2Q7Z4H3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HDDC2Q7Z4H3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HDDC2Q7Z4H3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HDDC2Q7Z4H3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDDC2Q7Z4H3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDDC2Q7Z4H3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HDDC2Q7Z4H3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HDDC2Q7Z4H3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HDDC2Q7Z4H3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HDDC2Q7Z4H3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HDDC2Q7Z4H3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDDC2Q7Z4H3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
HDDC2Q7Z4H3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HDDC2Q7Z4H3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HDDC2Q7Z4H3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HDDC2Q7Z4H3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HDDC2Q7Z4H3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HDDC2Q7Z4H3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HDDC2Q7Z4H3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
HDDC2Q7Z4H3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HDDC2Q7Z4H3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HDDC2Q7Z4H3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HDDC2Q7Z4H3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDDC2Q7Z4H3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDDC2Q7Z4H3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HDDC2Q7Z4H3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HDDC2Q7Z4H3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDDC2Q7Z4H3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HDDC2Q7Z4H3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HDDC2Q7Z4H3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HDDC2Q7Z4H3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDDC2Q7Z4H3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HDDC2Q7Z4H3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HDDC2Q7Z4H3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HDDC2Q7Z4H3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDDC2Q7Z4H3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDDC2Q7Z4H3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDDC2Q7Z4H3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDDC2Q7Z4H3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDDC2Q7Z4H3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDDC2Q7Z4H3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDDC2Q7Z4H3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDDC2Q7Z4H3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDDC2Q7Z4H3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDDC2Q7Z4H3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDDC2Q7Z4H3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDDC2Q7Z4H3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDDC2Q7Z4H3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDDC2Q7Z4H3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDDC2Q7Z4H3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDDC2Q7Z4H3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
HDDC2Q7Z4H3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HDDC2Q7Z4H3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HDDC2Q7Z4H3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDDC2Q7Z4H3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDDC2Q7Z4H3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDDC2Q7Z4H3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDDC2Q7Z4H3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDDC2Q7Z4H3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDDC2Q7Z4H3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDDC2Q7Z4H3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HDDC2Q7Z4H3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDDC2Q7Z4H3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDDC2Q7Z4H3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDDC2Q7Z4H3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDDC2Q7Z4H3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDDC2Q7Z4H3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDDC2Q7Z4H3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDDC2Q7Z4H3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HDDC2Q7Z4H3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDDC2Q7Z4H3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDDC2Q7Z4H3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDDC2Q7Z4H3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDDC2Q7Z4H3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDDC2Q7Z4H3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDDC2Q7Z4H3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDDC2Q7Z4H3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDDC2Q7Z4H3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HDDC2Q7Z4H3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HDDC2Q7Z4H3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDDC2Q7Z4H3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDDC2Q7Z4H3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDDC2Q7Z4H3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDDC2Q7Z4H3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDDC2Q7Z4H3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDDC2Q7Z4H3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDDC2Q7Z4H3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDDC2Q7Z4H3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms