Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS6

OTOP2, Otopetrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP2Q7RTS6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
OTOP2Q7RTS6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
OTOP2Q7RTS6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
OTOP2Q7RTS6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
OTOP2Q7RTS6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
OTOP2Q7RTS6 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
OTOP2Q7RTS6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
OTOP2Q7RTS6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
OTOP2Q7RTS6 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
OTOP2Q7RTS6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
OTOP2Q7RTS6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
OTOP2Q7RTS6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
OTOP2Q7RTS6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
OTOP2Q7RTS6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
OTOP2Q7RTS6 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
OTOP2Q7RTS6 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
OTOP2Q7RTS6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
OTOP2Q7RTS6 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
OTOP2Q7RTS6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
OTOP2Q7RTS6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
OTOP2Q7RTS6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
OTOP2Q7RTS6 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
OTOP2Q7RTS6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
OTOP2Q7RTS6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
OTOP2Q7RTS6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC31.89■■■□□ 2.7
OTOP2Q7RTS6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
OTOP2Q7RTS6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
OTOP2Q7RTS6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
OTOP2Q7RTS6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
OTOP2Q7RTS6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
OTOP2Q7RTS6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
OTOP2Q7RTS6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
OTOP2Q7RTS6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
OTOP2Q7RTS6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
OTOP2Q7RTS6 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
OTOP2Q7RTS6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
OTOP2Q7RTS6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
OTOP2Q7RTS6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
OTOP2Q7RTS6 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
OTOP2Q7RTS6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
OTOP2Q7RTS6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
OTOP2Q7RTS6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
OTOP2Q7RTS6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
OTOP2Q7RTS6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
OTOP2Q7RTS6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
OTOP2Q7RTS6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
OTOP2Q7RTS6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
OTOP2Q7RTS6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
OTOP2Q7RTS6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
OTOP2Q7RTS6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
OTOP2Q7RTS6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
OTOP2Q7RTS6 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
OTOP2Q7RTS6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
OTOP2Q7RTS6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
OTOP2Q7RTS6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
OTOP2Q7RTS6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
OTOP2Q7RTS6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
OTOP2Q7RTS6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
OTOP2Q7RTS6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
OTOP2Q7RTS6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
OTOP2Q7RTS6 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
OTOP2Q7RTS6 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
OTOP2Q7RTS6 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
OTOP2Q7RTS6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
OTOP2Q7RTS6 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
OTOP2Q7RTS6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
OTOP2Q7RTS6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
OTOP2Q7RTS6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
OTOP2Q7RTS6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
OTOP2Q7RTS6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC31.24■■■□□ 2.59
OTOP2Q7RTS6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
OTOP2Q7RTS6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
OTOP2Q7RTS6 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
OTOP2Q7RTS6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
OTOP2Q7RTS6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
OTOP2Q7RTS6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
OTOP2Q7RTS6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
OTOP2Q7RTS6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
OTOP2Q7RTS6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
OTOP2Q7RTS6 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
OTOP2Q7RTS6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
OTOP2Q7RTS6 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
OTOP2Q7RTS6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
OTOP2Q7RTS6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
OTOP2Q7RTS6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
OTOP2Q7RTS6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
OTOP2Q7RTS6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
OTOP2Q7RTS6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
OTOP2Q7RTS6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
OTOP2Q7RTS6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
OTOP2Q7RTS6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
OTOP2Q7RTS6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
OTOP2Q7RTS6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
OTOP2Q7RTS6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
OTOP2Q7RTS6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC31.02■■■□□ 2.56
OTOP2Q7RTS6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
OTOP2Q7RTS6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
OTOP2Q7RTS6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
OTOP2Q7RTS6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
OTOP2Q7RTS6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms