Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CAPN12Q6ZSI9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CAPN12Q6ZSI9 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CAPN12Q6ZSI9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CAPN12Q6ZSI9 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CAPN12Q6ZSI9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CAPN12Q6ZSI9 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CAPN12Q6ZSI9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CAPN12Q6ZSI9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CAPN12Q6ZSI9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CAPN12Q6ZSI9 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CAPN12Q6ZSI9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CAPN12Q6ZSI9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CAPN12Q6ZSI9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CAPN12Q6ZSI9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CAPN12Q6ZSI9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CAPN12Q6ZSI9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CAPN12Q6ZSI9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CAPN12Q6ZSI9 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CAPN12Q6ZSI9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CAPN12Q6ZSI9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CAPN12Q6ZSI9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CAPN12Q6ZSI9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CAPN12Q6ZSI9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CAPN12Q6ZSI9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CAPN12Q6ZSI9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CAPN12Q6ZSI9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CAPN12Q6ZSI9 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CAPN12Q6ZSI9 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CAPN12Q6ZSI9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CAPN12Q6ZSI9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CAPN12Q6ZSI9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CAPN12Q6ZSI9 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CAPN12Q6ZSI9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CAPN12Q6ZSI9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CAPN12Q6ZSI9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CAPN12Q6ZSI9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CAPN12Q6ZSI9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CAPN12Q6ZSI9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CAPN12Q6ZSI9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CAPN12Q6ZSI9 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CAPN12Q6ZSI9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CAPN12Q6ZSI9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CAPN12Q6ZSI9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CAPN12Q6ZSI9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CAPN12Q6ZSI9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CAPN12Q6ZSI9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CAPN12Q6ZSI9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CAPN12Q6ZSI9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CAPN12Q6ZSI9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CAPN12Q6ZSI9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CAPN12Q6ZSI9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CAPN12Q6ZSI9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CAPN12Q6ZSI9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CAPN12Q6ZSI9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CAPN12Q6ZSI9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CAPN12Q6ZSI9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CAPN12Q6ZSI9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CAPN12Q6ZSI9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CAPN12Q6ZSI9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CAPN12Q6ZSI9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CAPN12Q6ZSI9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CAPN12Q6ZSI9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CAPN12Q6ZSI9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CAPN12Q6ZSI9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CAPN12Q6ZSI9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CAPN12Q6ZSI9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CAPN12Q6ZSI9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CAPN12Q6ZSI9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CAPN12Q6ZSI9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CAPN12Q6ZSI9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CAPN12Q6ZSI9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CAPN12Q6ZSI9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CAPN12Q6ZSI9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CAPN12Q6ZSI9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CAPN12Q6ZSI9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CAPN12Q6ZSI9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CAPN12Q6ZSI9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CAPN12Q6ZSI9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CAPN12Q6ZSI9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CAPN12Q6ZSI9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CAPN12Q6ZSI9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CAPN12Q6ZSI9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CAPN12Q6ZSI9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CAPN12Q6ZSI9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CAPN12Q6ZSI9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CAPN12Q6ZSI9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CAPN12Q6ZSI9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CAPN12Q6ZSI9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CAPN12Q6ZSI9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CAPN12Q6ZSI9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CAPN12Q6ZSI9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CAPN12Q6ZSI9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CAPN12Q6ZSI9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CAPN12Q6ZSI9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CAPN12Q6ZSI9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CAPN12Q6ZSI9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CAPN12Q6ZSI9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CAPN12Q6ZSI9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CAPN12Q6ZSI9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms