Protein–RNA interactions for Protein: Q6VMQ6

ATF7IP, Activating transcription factor 7-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7IPQ6VMQ6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
ATF7IPQ6VMQ6 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
ATF7IPQ6VMQ6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
ATF7IPQ6VMQ6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
ATF7IPQ6VMQ6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.46
ATF7IPQ6VMQ6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
ATF7IPQ6VMQ6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
ATF7IPQ6VMQ6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC36.58■■■■□ 3.45
ATF7IPQ6VMQ6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
ATF7IPQ6VMQ6 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
ATF7IPQ6VMQ6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
ATF7IPQ6VMQ6 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
ATF7IPQ6VMQ6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
ATF7IPQ6VMQ6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
ATF7IPQ6VMQ6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
ATF7IPQ6VMQ6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
ATF7IPQ6VMQ6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
ATF7IPQ6VMQ6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
ATF7IPQ6VMQ6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
ATF7IPQ6VMQ6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
ATF7IPQ6VMQ6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
ATF7IPQ6VMQ6 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
ATF7IPQ6VMQ6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
ATF7IPQ6VMQ6 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
ATF7IPQ6VMQ6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
ATF7IPQ6VMQ6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
ATF7IPQ6VMQ6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
ATF7IPQ6VMQ6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
ATF7IPQ6VMQ6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
ATF7IPQ6VMQ6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
ATF7IPQ6VMQ6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
ATF7IPQ6VMQ6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.41
ATF7IPQ6VMQ6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
ATF7IPQ6VMQ6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
ATF7IPQ6VMQ6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
ATF7IPQ6VMQ6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
ATF7IPQ6VMQ6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
ATF7IPQ6VMQ6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
ATF7IPQ6VMQ6 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
ATF7IPQ6VMQ6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
ATF7IPQ6VMQ6 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
ATF7IPQ6VMQ6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
ATF7IPQ6VMQ6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
ATF7IPQ6VMQ6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
ATF7IPQ6VMQ6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
ATF7IPQ6VMQ6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
ATF7IPQ6VMQ6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
ATF7IPQ6VMQ6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
ATF7IPQ6VMQ6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
ATF7IPQ6VMQ6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
ATF7IPQ6VMQ6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
ATF7IPQ6VMQ6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
ATF7IPQ6VMQ6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
ATF7IPQ6VMQ6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
ATF7IPQ6VMQ6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
ATF7IPQ6VMQ6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
ATF7IPQ6VMQ6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
ATF7IPQ6VMQ6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
ATF7IPQ6VMQ6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
ATF7IPQ6VMQ6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
ATF7IPQ6VMQ6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
ATF7IPQ6VMQ6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
ATF7IPQ6VMQ6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
ATF7IPQ6VMQ6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
ATF7IPQ6VMQ6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
ATF7IPQ6VMQ6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
ATF7IPQ6VMQ6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
ATF7IPQ6VMQ6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
ATF7IPQ6VMQ6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
ATF7IPQ6VMQ6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
ATF7IPQ6VMQ6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
ATF7IPQ6VMQ6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
ATF7IPQ6VMQ6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
ATF7IPQ6VMQ6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
ATF7IPQ6VMQ6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
ATF7IPQ6VMQ6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
ATF7IPQ6VMQ6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
ATF7IPQ6VMQ6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
ATF7IPQ6VMQ6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
ATF7IPQ6VMQ6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
ATF7IPQ6VMQ6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
ATF7IPQ6VMQ6 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
ATF7IPQ6VMQ6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
ATF7IPQ6VMQ6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
ATF7IPQ6VMQ6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
ATF7IPQ6VMQ6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
ATF7IPQ6VMQ6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
ATF7IPQ6VMQ6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
ATF7IPQ6VMQ6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
ATF7IPQ6VMQ6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
ATF7IPQ6VMQ6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
ATF7IPQ6VMQ6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
ATF7IPQ6VMQ6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
ATF7IPQ6VMQ6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
ATF7IPQ6VMQ6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
ATF7IPQ6VMQ6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
ATF7IPQ6VMQ6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
ATF7IPQ6VMQ6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
ATF7IPQ6VMQ6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
ATF7IPQ6VMQ6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms