Protein–RNA interactions for Protein: Q6AZZ1

TRIM68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM68Q6AZZ1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TRIM68Q6AZZ1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TRIM68Q6AZZ1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TRIM68Q6AZZ1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TRIM68Q6AZZ1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TRIM68Q6AZZ1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TRIM68Q6AZZ1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TRIM68Q6AZZ1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TRIM68Q6AZZ1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
TRIM68Q6AZZ1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TRIM68Q6AZZ1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TRIM68Q6AZZ1 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TRIM68Q6AZZ1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TRIM68Q6AZZ1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TRIM68Q6AZZ1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TRIM68Q6AZZ1 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TRIM68Q6AZZ1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TRIM68Q6AZZ1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRIM68Q6AZZ1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TRIM68Q6AZZ1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TRIM68Q6AZZ1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TRIM68Q6AZZ1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TRIM68Q6AZZ1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TRIM68Q6AZZ1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TRIM68Q6AZZ1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TRIM68Q6AZZ1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TRIM68Q6AZZ1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TRIM68Q6AZZ1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
TRIM68Q6AZZ1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRIM68Q6AZZ1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TRIM68Q6AZZ1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRIM68Q6AZZ1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRIM68Q6AZZ1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRIM68Q6AZZ1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRIM68Q6AZZ1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRIM68Q6AZZ1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRIM68Q6AZZ1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRIM68Q6AZZ1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRIM68Q6AZZ1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TRIM68Q6AZZ1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TRIM68Q6AZZ1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
TRIM68Q6AZZ1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRIM68Q6AZZ1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRIM68Q6AZZ1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TRIM68Q6AZZ1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TRIM68Q6AZZ1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TRIM68Q6AZZ1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRIM68Q6AZZ1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRIM68Q6AZZ1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRIM68Q6AZZ1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRIM68Q6AZZ1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRIM68Q6AZZ1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRIM68Q6AZZ1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRIM68Q6AZZ1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRIM68Q6AZZ1 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRIM68Q6AZZ1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRIM68Q6AZZ1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRIM68Q6AZZ1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRIM68Q6AZZ1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRIM68Q6AZZ1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRIM68Q6AZZ1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRIM68Q6AZZ1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRIM68Q6AZZ1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRIM68Q6AZZ1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRIM68Q6AZZ1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
TRIM68Q6AZZ1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRIM68Q6AZZ1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRIM68Q6AZZ1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
TRIM68Q6AZZ1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRIM68Q6AZZ1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRIM68Q6AZZ1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
TRIM68Q6AZZ1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TRIM68Q6AZZ1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
TRIM68Q6AZZ1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRIM68Q6AZZ1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRIM68Q6AZZ1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRIM68Q6AZZ1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRIM68Q6AZZ1 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIM68Q6AZZ1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRIM68Q6AZZ1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRIM68Q6AZZ1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRIM68Q6AZZ1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRIM68Q6AZZ1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRIM68Q6AZZ1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRIM68Q6AZZ1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRIM68Q6AZZ1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRIM68Q6AZZ1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRIM68Q6AZZ1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIM68Q6AZZ1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIM68Q6AZZ1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIM68Q6AZZ1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIM68Q6AZZ1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIM68Q6AZZ1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM68Q6AZZ1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIM68Q6AZZ1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TRIM68Q6AZZ1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRIM68Q6AZZ1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM68Q6AZZ1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM68Q6AZZ1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIM68Q6AZZ1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms