Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CREB3L3Q68CJ9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CREB3L3Q68CJ9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CREB3L3Q68CJ9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CREB3L3Q68CJ9 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CREB3L3Q68CJ9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CREB3L3Q68CJ9 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CREB3L3Q68CJ9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
CREB3L3Q68CJ9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CREB3L3Q68CJ9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CREB3L3Q68CJ9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CREB3L3Q68CJ9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CREB3L3Q68CJ9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CREB3L3Q68CJ9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CREB3L3Q68CJ9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CREB3L3Q68CJ9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CREB3L3Q68CJ9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CREB3L3Q68CJ9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CREB3L3Q68CJ9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CREB3L3Q68CJ9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CREB3L3Q68CJ9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CREB3L3Q68CJ9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
CREB3L3Q68CJ9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CREB3L3Q68CJ9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CREB3L3Q68CJ9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CREB3L3Q68CJ9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CREB3L3Q68CJ9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CREB3L3Q68CJ9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CREB3L3Q68CJ9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CREB3L3Q68CJ9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CREB3L3Q68CJ9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CREB3L3Q68CJ9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CREB3L3Q68CJ9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CREB3L3Q68CJ9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CREB3L3Q68CJ9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CREB3L3Q68CJ9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CREB3L3Q68CJ9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CREB3L3Q68CJ9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CREB3L3Q68CJ9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CREB3L3Q68CJ9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CREB3L3Q68CJ9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CREB3L3Q68CJ9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CREB3L3Q68CJ9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CREB3L3Q68CJ9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CREB3L3Q68CJ9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CREB3L3Q68CJ9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CREB3L3Q68CJ9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CREB3L3Q68CJ9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CREB3L3Q68CJ9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CREB3L3Q68CJ9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CREB3L3Q68CJ9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CREB3L3Q68CJ9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CREB3L3Q68CJ9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CREB3L3Q68CJ9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CREB3L3Q68CJ9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CREB3L3Q68CJ9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CREB3L3Q68CJ9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
CREB3L3Q68CJ9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CREB3L3Q68CJ9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CREB3L3Q68CJ9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CREB3L3Q68CJ9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CREB3L3Q68CJ9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CREB3L3Q68CJ9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CREB3L3Q68CJ9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CREB3L3Q68CJ9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CREB3L3Q68CJ9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CREB3L3Q68CJ9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CREB3L3Q68CJ9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CREB3L3Q68CJ9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
CREB3L3Q68CJ9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
CREB3L3Q68CJ9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
CREB3L3Q68CJ9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
CREB3L3Q68CJ9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CREB3L3Q68CJ9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CREB3L3Q68CJ9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CREB3L3Q68CJ9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CREB3L3Q68CJ9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
CREB3L3Q68CJ9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CREB3L3Q68CJ9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CREB3L3Q68CJ9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CREB3L3Q68CJ9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CREB3L3Q68CJ9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CREB3L3Q68CJ9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CREB3L3Q68CJ9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CREB3L3Q68CJ9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CREB3L3Q68CJ9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CREB3L3Q68CJ9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CREB3L3Q68CJ9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CREB3L3Q68CJ9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CREB3L3Q68CJ9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CREB3L3Q68CJ9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
CREB3L3Q68CJ9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CREB3L3Q68CJ9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CREB3L3Q68CJ9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CREB3L3Q68CJ9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CREB3L3Q68CJ9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CREB3L3Q68CJ9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CREB3L3Q68CJ9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CREB3L3Q68CJ9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CREB3L3Q68CJ9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.8 ms