Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHL12Q53G59 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHL12Q53G59 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KLHL12Q53G59 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KLHL12Q53G59 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KLHL12Q53G59 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KLHL12Q53G59 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KLHL12Q53G59 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KLHL12Q53G59 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KLHL12Q53G59 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KLHL12Q53G59 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KLHL12Q53G59 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KLHL12Q53G59 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KLHL12Q53G59 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KLHL12Q53G59 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KLHL12Q53G59 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KLHL12Q53G59 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KLHL12Q53G59 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KLHL12Q53G59 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KLHL12Q53G59 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHL12Q53G59 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHL12Q53G59 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHL12Q53G59 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KLHL12Q53G59 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KLHL12Q53G59 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KLHL12Q53G59 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KLHL12Q53G59 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KLHL12Q53G59 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KLHL12Q53G59 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KLHL12Q53G59 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KLHL12Q53G59 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KLHL12Q53G59 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KLHL12Q53G59 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
KLHL12Q53G59 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KLHL12Q53G59 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
KLHL12Q53G59 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KLHL12Q53G59 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLHL12Q53G59 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLHL12Q53G59 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHL12Q53G59 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHL12Q53G59 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHL12Q53G59 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHL12Q53G59 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHL12Q53G59 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHL12Q53G59 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL12Q53G59 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL12Q53G59 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KLHL12Q53G59 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KLHL12Q53G59 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL12Q53G59 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL12Q53G59 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL12Q53G59 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHL12Q53G59 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHL12Q53G59 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHL12Q53G59 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHL12Q53G59 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL12Q53G59 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLHL12Q53G59 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KLHL12Q53G59 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
KLHL12Q53G59 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHL12Q53G59 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHL12Q53G59 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHL12Q53G59 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHL12Q53G59 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHL12Q53G59 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHL12Q53G59 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHL12Q53G59 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHL12Q53G59 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHL12Q53G59 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHL12Q53G59 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL12Q53G59 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHL12Q53G59 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHL12Q53G59 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHL12Q53G59 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL12Q53G59 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL12Q53G59 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL12Q53G59 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL12Q53G59 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL12Q53G59 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL12Q53G59 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL12Q53G59 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHL12Q53G59 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHL12Q53G59 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL12Q53G59 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL12Q53G59 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL12Q53G59 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHL12Q53G59 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHL12Q53G59 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHL12Q53G59 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHL12Q53G59 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHL12Q53G59 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHL12Q53G59 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHL12Q53G59 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHL12Q53G59 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHL12Q53G59 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KLHL12Q53G59 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KLHL12Q53G59 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHL12Q53G59 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHL12Q53G59 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KLHL12Q53G59 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms