Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0J3

LARP7, La-related protein 7, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP7Q4G0J3 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.293e-64■■■■■ 178.9
LARP7Q4G0J3 SLC39A11-201ENST00000255559 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.33e-64■■■■■ 178.9
LARP7Q4G0J3 SLC39A11-213ENST00000582769 567 ntTSL 512.37□□□□□ -0.433e-64■■■■■ 178.9
LARP7Q4G0J3 RN7SKP180-201ENST00000363913 330 ntBASIC10.15□□□□□ -0.783e-64■■■■■ 178.9
LARP7Q4G0J3 ENPP1-203ENST00000486853 732 ntTSL 228.94■■■□□ 2.221e-19■■■■■ 178
LARP7Q4G0J3 ENPP1-204ENST00000513998 3107 ntTSL 520.75■□□□□ 0.911e-19■■■■■ 178
LARP7Q4G0J3 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.571e-19■■■■■ 178
LARP7Q4G0J3 RN7SKP245-201ENST00000364025 320 ntBASIC11.7□□□□□ -0.541e-19■■■■■ 178
LARP7Q4G0J3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.22e-15■■■■■ 177.8
LARP7Q4G0J3 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC5.53□□□□□ -1.526e-8■■■■■ 163.3
LARP7Q4G0J3 RN7SKP189-201ENST00000365042 330 ntBASIC6.67□□□□□ -1.343e-22■■■■■ 152.1
LARP7Q4G0J3 U3.18-201ENST00000390880 216 ntBASIC8.83□□□□□ -13e-10■■■■■ 151.7
LARP7Q4G0J3 LINC02001-201ENST00000592381 1298 ntTSL 214.44□□□□□ -0.11e-323■■■■■ 150.2
LARP7Q4G0J3 LINC02001-202ENST00000638682 1504 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.741e-323■■■■■ 150.2
LARP7Q4G0J3 RN7SKP112-201ENST00000411213 318 ntBASIC8.7□□□□□ -1.025e-16■■■■■ 148.9
LARP7Q4G0J3 CKB-206ENST00000553994 746 ntTSL 228.34■■■□□ 2.134e-12■■■■■ 139.7
LARP7Q4G0J3 CKB-205ENST00000553878 856 ntTSL 228.34■■■□□ 2.134e-12■■■■■ 139.7
LARP7Q4G0J3 CKB-214ENST00000555770 816 ntTSL 425.9■■□□□ 1.744e-12■■■■■ 139.7
LARP7Q4G0J3 CKB-208ENST00000554426 775 ntTSL 525.87■■□□□ 1.734e-12■■■■■ 139.7
LARP7Q4G0J3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.124e-12■■■■■ 139.7
LARP7Q4G0J3 CKB-209ENST00000554705 803 ntTSL 218.68■□□□□ 0.584e-12■■■■■ 139.7
LARP7Q4G0J3 CKB-213ENST00000555659 755 ntTSL 218.53■□□□□ 0.564e-12■■■■■ 139.7
LARP7Q4G0J3 CKB-204ENST00000553652 1239 ntTSL 516.78■□□□□ 0.284e-12■■■■■ 139.7
LARP7Q4G0J3 CKB-216ENST00000557530 523 ntTSL 412.8□□□□□ -0.364e-12■■■■■ 139.7
LARP7Q4G0J3 RN7SKP146-201ENST00000410242 334 ntBASIC6.6□□□□□ -1.359e-13■■■■■ 135.3
LARP7Q4G0J3 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.33e-12■■■■■ 132.9
LARP7Q4G0J3 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.083e-12■■■■■ 132.9
LARP7Q4G0J3 RN7SKP268-201ENST00000411107 316 ntBASIC6.84□□□□□ -1.313e-12■■■■■ 132.9
LARP7Q4G0J3 RPL37-202ENST00000504562 505 ntTSL 210.93□□□□□ -0.668e-14■■■■■ 129.6
LARP7Q4G0J3 RPL37-205ENST00000509877 637 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.168e-14■■■■■ 129.6
LARP7Q4G0J3 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.188e-14■■■■■ 129.6
LARP7Q4G0J3 RPL37-203ENST00000507642 425 ntTSL 37.21□□□□□ -1.268e-14■■■■■ 129.6
LARP7Q4G0J3 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC2.99□□□□□ -1.938e-14■■■■■ 129.6
LARP7Q4G0J3 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC4.7□□□□□ -1.663e-21■■■■■ 127.4
LARP7Q4G0J3 RN7SKP281-201ENST00000410472 352 ntBASIC6.12□□□□□ -1.433e-9■■■■■ 127
LARP7Q4G0J3 ZNF277-202ENST00000361946 1736 ntTSL 1 (best)15.54■□□□□ 0.086e-12■■■■■ 125.9
LARP7Q4G0J3 ZNF277-207ENST00000457808 891 ntTSL 514.54□□□□□ -0.086e-12■■■■■ 125.9
LARP7Q4G0J3 ZNF277-201ENST00000361822 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.346e-12■■■■■ 125.9
LARP7Q4G0J3 ZNF277-205ENST00000425229 617 ntTSL 312.66□□□□□ -0.386e-12■■■■■ 125.9
LARP7Q4G0J3 ZNF277-203ENST00000421043 2218 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.526e-12■■■■■ 125.9
LARP7Q4G0J3 ZNF277-206ENST00000450657 1075 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.76e-12■■■■■ 125.9
LARP7Q4G0J3 RN7SKP187-201ENST00000365536 330 ntBASIC6.43□□□□□ -1.386e-12■■■■■ 125.9
LARP7Q4G0J3 7SK.1-201ENST00000365328 331 ntBASIC12.72□□□□□ -0.371e-323■■■■■ 123.9
LARP7Q4G0J3 RN7SK-201ENST00000636484 328 ntBASIC11.75□□□□□ -0.531e-323■■■■■ 123.9
LARP7Q4G0J3 RN7SKP169-201ENST00000411124 291 ntBASIC8.51□□□□□ -1.051e-18■■■■■ 123.2
LARP7Q4G0J3 Z98949.3-201ENST00000436423 472 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.241e-18■■■■■ 123.2
LARP7Q4G0J3 RN7SKP93-201ENST00000363838 309 ntBASIC8.54□□□□□ -1.043e-11■■■■■ 121.8
LARP7Q4G0J3 RN7SKP108-201ENST00000411367 328 ntBASIC6.91□□□□□ -1.31e-36■■■■■ 119.1
LARP7Q4G0J3 TEX14-202ENST00000349033 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.654e-15■■■■■ 117.5
LARP7Q4G0J3 TEX14-201ENST00000240361 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.114e-15■■■■■ 117.5
LARP7Q4G0J3 TEX14-205ENST00000582740 4834 ntTSL 1 (best)7.67□□□□□ -1.184e-15■■■■■ 117.5
LARP7Q4G0J3 TEX14-203ENST00000389934 4927 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.214e-15■■■■■ 117.5
LARP7Q4G0J3 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC4.18□□□□□ -1.744e-15■■■■■ 117.5
LARP7Q4G0J3 PLS1-202ENST00000457734 3706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.897e-10■■■■■ 117.2
LARP7Q4G0J3 PLS1-207ENST00000476044 1038 ntTSL 58.59□□□□□ -1.037e-10■■■■■ 117.2
LARP7Q4G0J3 RN7SKP25-201ENST00000362449 308 ntBASIC8.31□□□□□ -1.087e-10■■■■■ 117.2
LARP7Q4G0J3 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.427e-10■■■■■ 117.2
LARP7Q4G0J3 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.787e-10■■■■■ 117.2
LARP7Q4G0J3 PTCD3-201ENST00000254630 6734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.924e-81■■■■■ 116.8
LARP7Q4G0J3 SNORD94-201ENST00000386037 137 ntBASIC6.64□□□□□ -1.354e-81■■■■■ 116.8
LARP7Q4G0J3 PTCD3-216ENST00000487043 1054 ntTSL 36.22□□□□□ -1.414e-81■■■■■ 116.8
LARP7Q4G0J3 RN7SKP250-201ENST00000363924 321 ntBASIC6.47□□□□□ -1.373e-11■■■■■ 116.7
LARP7Q4G0J3 CKAP5-212ENST00000533413 3084 ntTSL 1 (best)6.07□□□□□ -1.441e-82■■■■■ 113.7
LARP7Q4G0J3 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.511e-82■■■■■ 113.7
LARP7Q4G0J3 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.591e-82■■■■■ 113.7
LARP7Q4G0J3 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.781e-82■■■■■ 113.7
LARP7Q4G0J3 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC2.9□□□□□ -1.951e-82■■■■■ 113.7
LARP7Q4G0J3 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.041e-15■■■■■ 113.5
LARP7Q4G0J3 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.081e-15■■■■■ 113.5
LARP7Q4G0J3 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.11e-15■■■■■ 113.5
LARP7Q4G0J3 NMNAT3-208ENST00000509291 763 ntTSL 513.21□□□□□ -0.291e-15■■■■■ 113.5
LARP7Q4G0J3 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.331e-15■■■■■ 113.5
LARP7Q4G0J3 NMNAT3-205ENST00000506254 2454 ntTSL 1 (best)12.83□□□□□ -0.361e-15■■■■■ 113.5
LARP7Q4G0J3 NMNAT3-212ENST00000511444 873 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.41e-15■■■■■ 113.5
LARP7Q4G0J3 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC5.49□□□□□ -1.531e-15■■■■■ 113.5
LARP7Q4G0J3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.747e-14■■■■■ 113
LARP7Q4G0J3 RN7SKP173-201ENST00000362821 315 ntBASIC8.13□□□□□ -1.117e-14■■■■■ 113
LARP7Q4G0J3 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.341e-13■■■■■ 110.8
LARP7Q4G0J3 LINC00470-211ENST00000584492 1281 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.581e-13■■■■■ 110.8
LARP7Q4G0J3 LINC00470-203ENST00000577867 1211 ntTSL 1 (best)10.84□□□□□ -0.671e-13■■■■■ 110.8
LARP7Q4G0J3 LINC00470-201ENST00000412816 2031 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.881e-13■■■■■ 110.8
LARP7Q4G0J3 RN7SKP72-201ENST00000362327 292 ntBASIC8.89□□□□□ -0.991e-13■■■■■ 110.8
LARP7Q4G0J3 LINC00470-204ENST00000578835 674 ntTSL 28.63□□□□□ -1.031e-13■■■■■ 110.8
LARP7Q4G0J3 LINC00470-206ENST00000581212 721 ntTSL 1 (best)7.56□□□□□ -1.21e-13■■■■■ 110.8
LARP7Q4G0J3 LINC00470-209ENST00000582862 424 ntTSL 1 (best)7.56□□□□□ -1.21e-13■■■■■ 110.8
LARP7Q4G0J3 LINC00470-207ENST00000581430 556 ntTSL 57.24□□□□□ -1.251e-13■■■■■ 110.8
LARP7Q4G0J3 LINC00470-202ENST00000577403 251 ntTSL 1 (best)4.97□□□□□ -1.611e-13■■■■■ 110.8
LARP7Q4G0J3 RN7SKP8-201ENST00000411037 358 ntBASIC10.28□□□□□ -0.761e-78■■■■■ 110.4
LARP7Q4G0J3 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC14.26□□□□□ -0.132e-33■■■■■ 109.7
LARP7Q4G0J3 AC067930.1-201ENST00000517300 291 ntBASIC9.58□□□□□ -0.882e-33■■■■■ 109.7
LARP7Q4G0J3 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC5.65□□□□□ -1.59e-34■■■■■ 109.2
LARP7Q4G0J3 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC4.39□□□□□ -1.713e-12■■■■■ 106.8
LARP7Q4G0J3 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC6.03□□□□□ -1.443e-9■■■■■ 104.2
LARP7Q4G0J3 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC5.2□□□□□ -1.584e-17■■■■■ 102.7
LARP7Q4G0J3 ETV6-203ENST00000541426 572 ntTSL 416.92■□□□□ 0.37e-9■■■■■ 101.6
LARP7Q4G0J3 ETV6-204ENST00000544715 733 ntTSL 316.59■□□□□ 0.257e-9■■■■■ 101.6
LARP7Q4G0J3 MIR663AHG-224ENST00000601119 750 ntTSL 512.86□□□□□ -0.357e-9■■■■■ 101.6
LARP7Q4G0J3 MIR663AHG-226ENST00000601901 644 ntTSL 512.33□□□□□ -0.447e-9■■■■■ 101.6
LARP7Q4G0J3 MIR663AHG-204ENST00000594130 628 ntTSL 511.96□□□□□ -0.497e-9■■■■■ 101.6
LARP7Q4G0J3 MIR663AHG-234ENST00000609687 697 ntTSL 511.71□□□□□ -0.537e-9■■■■■ 101.6
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