Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0J3

LARP7, La-related protein 7, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP7Q4G0J3 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.293e-64■■■■■ 178.9
LARP7Q4G0J3 SLC39A11-201ENST00000255559 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.33e-64■■■■■ 178.9
LARP7Q4G0J3 SLC39A11-213ENST00000582769 567 ntTSL 512.37□□□□□ -0.433e-64■■■■■ 178.9
LARP7Q4G0J3 RN7SKP180-201ENST00000363913 330 ntBASIC10.15□□□□□ -0.783e-64■■■■■ 178.9
LARP7Q4G0J3 ENPP1-203ENST00000486853 732 ntTSL 228.94■■■□□ 2.221e-19■■■■■ 178
LARP7Q4G0J3 ENPP1-204ENST00000513998 3107 ntTSL 520.75■□□□□ 0.911e-19■■■■■ 178
LARP7Q4G0J3 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.571e-19■■■■■ 178
LARP7Q4G0J3 RN7SKP245-201ENST00000364025 320 ntBASIC11.7□□□□□ -0.541e-19■■■■■ 178
LARP7Q4G0J3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.22e-15■■■■■ 177.8
LARP7Q4G0J3 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC5.53□□□□□ -1.526e-8■■■■■ 163.3
LARP7Q4G0J3 RN7SKP189-201ENST00000365042 330 ntBASIC6.67□□□□□ -1.343e-22■■■■■ 152.1
LARP7Q4G0J3 U3.18-201ENST00000390880 216 ntBASIC8.83□□□□□ -13e-10■■■■■ 151.7
LARP7Q4G0J3 LINC02001-201ENST00000592381 1298 ntTSL 214.44□□□□□ -0.11e-323■■■■■ 150.2
LARP7Q4G0J3 LINC02001-202ENST00000638682 1504 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.741e-323■■■■■ 150.2
LARP7Q4G0J3 RN7SKP112-201ENST00000411213 318 ntBASIC8.7□□□□□ -1.025e-16■■■■■ 148.9
LARP7Q4G0J3 CKB-206ENST00000553994 746 ntTSL 228.34■■■□□ 2.134e-12■■■■■ 139.7
LARP7Q4G0J3 CKB-205ENST00000553878 856 ntTSL 228.34■■■□□ 2.134e-12■■■■■ 139.7
LARP7Q4G0J3 CKB-214ENST00000555770 816 ntTSL 425.9■■□□□ 1.744e-12■■■■■ 139.7
LARP7Q4G0J3 CKB-208ENST00000554426 775 ntTSL 525.87■■□□□ 1.734e-12■■■■■ 139.7
LARP7Q4G0J3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.124e-12■■■■■ 139.7
LARP7Q4G0J3 CKB-209ENST00000554705 803 ntTSL 218.68■□□□□ 0.584e-12■■■■■ 139.7
LARP7Q4G0J3 CKB-213ENST00000555659 755 ntTSL 218.53■□□□□ 0.564e-12■■■■■ 139.7
LARP7Q4G0J3 CKB-204ENST00000553652 1239 ntTSL 516.78■□□□□ 0.284e-12■■■■■ 139.7
LARP7Q4G0J3 CKB-216ENST00000557530 523 ntTSL 412.8□□□□□ -0.364e-12■■■■■ 139.7
LARP7Q4G0J3 RN7SKP146-201ENST00000410242 334 ntBASIC6.6□□□□□ -1.359e-13■■■■■ 135.3
LARP7Q4G0J3 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.33e-12■■■■■ 132.9
LARP7Q4G0J3 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.083e-12■■■■■ 132.9
LARP7Q4G0J3 RN7SKP268-201ENST00000411107 316 ntBASIC6.84□□□□□ -1.313e-12■■■■■ 132.9
LARP7Q4G0J3 RPL37-202ENST00000504562 505 ntTSL 210.93□□□□□ -0.668e-14■■■■■ 129.6
LARP7Q4G0J3 RPL37-205ENST00000509877 637 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.168e-14■■■■■ 129.6
LARP7Q4G0J3 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.188e-14■■■■■ 129.6
LARP7Q4G0J3 RPL37-203ENST00000507642 425 ntTSL 37.21□□□□□ -1.268e-14■■■■■ 129.6
LARP7Q4G0J3 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC2.99□□□□□ -1.938e-14■■■■■ 129.6
LARP7Q4G0J3 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC4.7□□□□□ -1.663e-21■■■■■ 127.4
LARP7Q4G0J3 RN7SKP281-201ENST00000410472 352 ntBASIC6.12□□□□□ -1.433e-9■■■■■ 127
LARP7Q4G0J3 ZNF277-202ENST00000361946 1736 ntTSL 1 (best)15.54■□□□□ 0.086e-12■■■■■ 125.9
LARP7Q4G0J3 ZNF277-207ENST00000457808 891 ntTSL 514.54□□□□□ -0.086e-12■■■■■ 125.9
LARP7Q4G0J3 ZNF277-201ENST00000361822 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.346e-12■■■■■ 125.9
LARP7Q4G0J3 ZNF277-205ENST00000425229 617 ntTSL 312.66□□□□□ -0.386e-12■■■■■ 125.9
LARP7Q4G0J3 ZNF277-203ENST00000421043 2218 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.526e-12■■■■■ 125.9
LARP7Q4G0J3 ZNF277-206ENST00000450657 1075 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.76e-12■■■■■ 125.9
LARP7Q4G0J3 RN7SKP187-201ENST00000365536 330 ntBASIC6.43□□□□□ -1.386e-12■■■■■ 125.9
LARP7Q4G0J3 7SK.1-201ENST00000365328 331 ntBASIC12.72□□□□□ -0.371e-323■■■■■ 123.9
LARP7Q4G0J3 RN7SK-201ENST00000636484 328 ntBASIC11.75□□□□□ -0.531e-323■■■■■ 123.9
LARP7Q4G0J3 RN7SKP169-201ENST00000411124 291 ntBASIC8.51□□□□□ -1.051e-18■■■■■ 123.2
LARP7Q4G0J3 Z98949.3-201ENST00000436423 472 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.241e-18■■■■■ 123.2
LARP7Q4G0J3 RN7SKP93-201ENST00000363838 309 ntBASIC8.54□□□□□ -1.043e-11■■■■■ 121.8
LARP7Q4G0J3 RN7SKP108-201ENST00000411367 328 ntBASIC6.91□□□□□ -1.31e-36■■■■■ 119.1
LARP7Q4G0J3 TEX14-202ENST00000349033 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.654e-15■■■■■ 117.5
LARP7Q4G0J3 TEX14-201ENST00000240361 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.114e-15■■■■■ 117.5
LARP7Q4G0J3 TEX14-205ENST00000582740 4834 ntTSL 1 (best)7.67□□□□□ -1.184e-15■■■■■ 117.5
LARP7Q4G0J3 TEX14-203ENST00000389934 4927 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.214e-15■■■■■ 117.5
LARP7Q4G0J3 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC4.18□□□□□ -1.744e-15■■■■■ 117.5
LARP7Q4G0J3 PLS1-202ENST00000457734 3706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.897e-10■■■■■ 117.2
LARP7Q4G0J3 PLS1-207ENST00000476044 1038 ntTSL 58.59□□□□□ -1.037e-10■■■■■ 117.2
LARP7Q4G0J3 RN7SKP25-201ENST00000362449 308 ntBASIC8.31□□□□□ -1.087e-10■■■■■ 117.2
LARP7Q4G0J3 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.427e-10■■■■■ 117.2
LARP7Q4G0J3 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.787e-10■■■■■ 117.2
LARP7Q4G0J3 PTCD3-201ENST00000254630 6734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.924e-81■■■■■ 116.8
LARP7Q4G0J3 SNORD94-201ENST00000386037 137 ntBASIC6.64□□□□□ -1.354e-81■■■■■ 116.8
LARP7Q4G0J3 PTCD3-216ENST00000487043 1054 ntTSL 36.22□□□□□ -1.414e-81■■■■■ 116.8
LARP7Q4G0J3 RN7SKP250-201ENST00000363924 321 ntBASIC6.47□□□□□ -1.373e-11■■■■■ 116.7
LARP7Q4G0J3 CKAP5-212ENST00000533413 3084 ntTSL 1 (best)6.07□□□□□ -1.441e-82■■■■■ 113.7
LARP7Q4G0J3 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.511e-82■■■■■ 113.7
LARP7Q4G0J3 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.591e-82■■■■■ 113.7
LARP7Q4G0J3 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.781e-82■■■■■ 113.7
LARP7Q4G0J3 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC2.9□□□□□ -1.951e-82■■■■■ 113.7
LARP7Q4G0J3 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.041e-15■■■■■ 113.5
LARP7Q4G0J3 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.081e-15■■■■■ 113.5
LARP7Q4G0J3 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.11e-15■■■■■ 113.5
LARP7Q4G0J3 NMNAT3-208ENST00000509291 763 ntTSL 513.21□□□□□ -0.291e-15■■■■■ 113.5
LARP7Q4G0J3 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.331e-15■■■■■ 113.5
LARP7Q4G0J3 NMNAT3-205ENST00000506254 2454 ntTSL 1 (best)12.83□□□□□ -0.361e-15■■■■■ 113.5
LARP7Q4G0J3 NMNAT3-212ENST00000511444 873 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.41e-15■■■■■ 113.5
LARP7Q4G0J3 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC5.49□□□□□ -1.531e-15■■■■■ 113.5
LARP7Q4G0J3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.747e-14■■■■■ 113
LARP7Q4G0J3 RN7SKP173-201ENST00000362821 315 ntBASIC8.13□□□□□ -1.117e-14■■■■■ 113
LARP7Q4G0J3 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.341e-13■■■■■ 110.8
LARP7Q4G0J3 LINC00470-211ENST00000584492 1281 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.581e-13■■■■■ 110.8
LARP7Q4G0J3 LINC00470-203ENST00000577867 1211 ntTSL 1 (best)10.84□□□□□ -0.671e-13■■■■■ 110.8
LARP7Q4G0J3 LINC00470-201ENST00000412816 2031 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.881e-13■■■■■ 110.8
LARP7Q4G0J3 RN7SKP72-201ENST00000362327 292 ntBASIC8.89□□□□□ -0.991e-13■■■■■ 110.8
LARP7Q4G0J3 LINC00470-204ENST00000578835 674 ntTSL 28.63□□□□□ -1.031e-13■■■■■ 110.8
LARP7Q4G0J3 LINC00470-206ENST00000581212 721 ntTSL 1 (best)7.56□□□□□ -1.21e-13■■■■■ 110.8
LARP7Q4G0J3 LINC00470-209ENST00000582862 424 ntTSL 1 (best)7.56□□□□□ -1.21e-13■■■■■ 110.8
LARP7Q4G0J3 LINC00470-207ENST00000581430 556 ntTSL 57.24□□□□□ -1.251e-13■■■■■ 110.8
LARP7Q4G0J3 LINC00470-202ENST00000577403 251 ntTSL 1 (best)4.97□□□□□ -1.611e-13■■■■■ 110.8
LARP7Q4G0J3 RN7SKP8-201ENST00000411037 358 ntBASIC10.28□□□□□ -0.761e-78■■■■■ 110.4
LARP7Q4G0J3 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC14.26□□□□□ -0.132e-33■■■■■ 109.7
LARP7Q4G0J3 AC067930.1-201ENST00000517300 291 ntBASIC9.58□□□□□ -0.882e-33■■■■■ 109.7
LARP7Q4G0J3 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC5.65□□□□□ -1.59e-34■■■■■ 109.2
LARP7Q4G0J3 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC4.39□□□□□ -1.713e-12■■■■■ 106.8
LARP7Q4G0J3 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC6.03□□□□□ -1.443e-9■■■■■ 104.2
LARP7Q4G0J3 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC5.2□□□□□ -1.584e-17■■■■■ 102.7
LARP7Q4G0J3 ETV6-203ENST00000541426 572 ntTSL 416.92■□□□□ 0.37e-9■■■■■ 101.6
LARP7Q4G0J3 ETV6-204ENST00000544715 733 ntTSL 316.59■□□□□ 0.257e-9■■■■■ 101.6
LARP7Q4G0J3 MIR663AHG-224ENST00000601119 750 ntTSL 512.86□□□□□ -0.357e-9■■■■■ 101.6
LARP7Q4G0J3 MIR663AHG-226ENST00000601901 644 ntTSL 512.33□□□□□ -0.447e-9■■■■■ 101.6
LARP7Q4G0J3 MIR663AHG-204ENST00000594130 628 ntTSL 511.96□□□□□ -0.497e-9■■■■■ 101.6
LARP7Q4G0J3 MIR663AHG-234ENST00000609687 697 ntTSL 511.71□□□□□ -0.537e-9■■■■■ 101.6
Retrieved 100 of 2,094 protein–RNA pairs in 71 ms