Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0F5

VPS26B, Vacuolar protein sorting-associated protein 26B, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS26BQ4G0F5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VPS26BQ4G0F5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
VPS26BQ4G0F5 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
VPS26BQ4G0F5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
VPS26BQ4G0F5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
VPS26BQ4G0F5 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
VPS26BQ4G0F5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
VPS26BQ4G0F5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VPS26BQ4G0F5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VPS26BQ4G0F5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VPS26BQ4G0F5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VPS26BQ4G0F5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VPS26BQ4G0F5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VPS26BQ4G0F5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VPS26BQ4G0F5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
VPS26BQ4G0F5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
VPS26BQ4G0F5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
VPS26BQ4G0F5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
VPS26BQ4G0F5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VPS26BQ4G0F5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VPS26BQ4G0F5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VPS26BQ4G0F5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VPS26BQ4G0F5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VPS26BQ4G0F5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VPS26BQ4G0F5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
VPS26BQ4G0F5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
VPS26BQ4G0F5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
VPS26BQ4G0F5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VPS26BQ4G0F5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VPS26BQ4G0F5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
VPS26BQ4G0F5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
VPS26BQ4G0F5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
VPS26BQ4G0F5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
VPS26BQ4G0F5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
VPS26BQ4G0F5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VPS26BQ4G0F5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VPS26BQ4G0F5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VPS26BQ4G0F5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VPS26BQ4G0F5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
VPS26BQ4G0F5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VPS26BQ4G0F5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VPS26BQ4G0F5 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
VPS26BQ4G0F5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VPS26BQ4G0F5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
VPS26BQ4G0F5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VPS26BQ4G0F5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VPS26BQ4G0F5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VPS26BQ4G0F5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VPS26BQ4G0F5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
VPS26BQ4G0F5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VPS26BQ4G0F5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VPS26BQ4G0F5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
VPS26BQ4G0F5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VPS26BQ4G0F5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VPS26BQ4G0F5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VPS26BQ4G0F5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VPS26BQ4G0F5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
VPS26BQ4G0F5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
VPS26BQ4G0F5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VPS26BQ4G0F5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VPS26BQ4G0F5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VPS26BQ4G0F5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VPS26BQ4G0F5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VPS26BQ4G0F5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VPS26BQ4G0F5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VPS26BQ4G0F5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VPS26BQ4G0F5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VPS26BQ4G0F5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VPS26BQ4G0F5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VPS26BQ4G0F5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VPS26BQ4G0F5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VPS26BQ4G0F5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VPS26BQ4G0F5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VPS26BQ4G0F5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VPS26BQ4G0F5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VPS26BQ4G0F5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VPS26BQ4G0F5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VPS26BQ4G0F5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
VPS26BQ4G0F5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VPS26BQ4G0F5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
VPS26BQ4G0F5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
VPS26BQ4G0F5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
VPS26BQ4G0F5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VPS26BQ4G0F5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VPS26BQ4G0F5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VPS26BQ4G0F5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
VPS26BQ4G0F5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
VPS26BQ4G0F5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
VPS26BQ4G0F5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
VPS26BQ4G0F5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VPS26BQ4G0F5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VPS26BQ4G0F5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VPS26BQ4G0F5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VPS26BQ4G0F5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VPS26BQ4G0F5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VPS26BQ4G0F5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VPS26BQ4G0F5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
VPS26BQ4G0F5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VPS26BQ4G0F5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VPS26BQ4G0F5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms