Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCGF3Q3KNV8 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCGF3Q3KNV8 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PCGF3Q3KNV8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCGF3Q3KNV8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCGF3Q3KNV8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCGF3Q3KNV8 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PCGF3Q3KNV8 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCGF3Q3KNV8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCGF3Q3KNV8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCGF3Q3KNV8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCGF3Q3KNV8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCGF3Q3KNV8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCGF3Q3KNV8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCGF3Q3KNV8 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCGF3Q3KNV8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCGF3Q3KNV8 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCGF3Q3KNV8 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCGF3Q3KNV8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCGF3Q3KNV8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCGF3Q3KNV8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCGF3Q3KNV8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCGF3Q3KNV8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCGF3Q3KNV8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCGF3Q3KNV8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCGF3Q3KNV8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCGF3Q3KNV8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCGF3Q3KNV8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCGF3Q3KNV8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCGF3Q3KNV8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCGF3Q3KNV8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCGF3Q3KNV8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCGF3Q3KNV8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCGF3Q3KNV8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCGF3Q3KNV8 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCGF3Q3KNV8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCGF3Q3KNV8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCGF3Q3KNV8 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCGF3Q3KNV8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PCGF3Q3KNV8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCGF3Q3KNV8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCGF3Q3KNV8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCGF3Q3KNV8 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCGF3Q3KNV8 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCGF3Q3KNV8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCGF3Q3KNV8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCGF3Q3KNV8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCGF3Q3KNV8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCGF3Q3KNV8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCGF3Q3KNV8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCGF3Q3KNV8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCGF3Q3KNV8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCGF3Q3KNV8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCGF3Q3KNV8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PCGF3Q3KNV8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCGF3Q3KNV8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCGF3Q3KNV8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCGF3Q3KNV8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCGF3Q3KNV8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCGF3Q3KNV8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCGF3Q3KNV8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCGF3Q3KNV8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCGF3Q3KNV8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCGF3Q3KNV8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCGF3Q3KNV8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCGF3Q3KNV8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCGF3Q3KNV8 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PCGF3Q3KNV8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCGF3Q3KNV8 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCGF3Q3KNV8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCGF3Q3KNV8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCGF3Q3KNV8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCGF3Q3KNV8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCGF3Q3KNV8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCGF3Q3KNV8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCGF3Q3KNV8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCGF3Q3KNV8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCGF3Q3KNV8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PCGF3Q3KNV8 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCGF3Q3KNV8 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCGF3Q3KNV8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCGF3Q3KNV8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCGF3Q3KNV8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCGF3Q3KNV8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCGF3Q3KNV8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCGF3Q3KNV8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCGF3Q3KNV8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCGF3Q3KNV8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCGF3Q3KNV8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCGF3Q3KNV8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCGF3Q3KNV8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCGF3Q3KNV8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCGF3Q3KNV8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCGF3Q3KNV8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCGF3Q3KNV8 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCGF3Q3KNV8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCGF3Q3KNV8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCGF3Q3KNV8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCGF3Q3KNV8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCGF3Q3KNV8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms