Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RBM39Q14498 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBM39Q14498 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBM39Q14498 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBM39Q14498 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBM39Q14498 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBM39Q14498 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBM39Q14498 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBM39Q14498 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBM39Q14498 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBM39Q14498 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBM39Q14498 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBM39Q14498 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBM39Q14498 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBM39Q14498 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBM39Q14498 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBM39Q14498 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBM39Q14498 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBM39Q14498 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBM39Q14498 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBM39Q14498 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBM39Q14498 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBM39Q14498 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RBM39Q14498 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBM39Q14498 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBM39Q14498 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBM39Q14498 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBM39Q14498 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBM39Q14498 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBM39Q14498 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBM39Q14498 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBM39Q14498 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBM39Q14498 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBM39Q14498 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBM39Q14498 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBM39Q14498 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBM39Q14498 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBM39Q14498 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RBM39Q14498 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RBM39Q14498 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RBM39Q14498 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RBM39Q14498 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBM39Q14498 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBM39Q14498 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RBM39Q14498 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RBM39Q14498 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RBM39Q14498 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RBM39Q14498 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBM39Q14498 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBM39Q14498 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBM39Q14498 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBM39Q14498 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBM39Q14498 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBM39Q14498 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBM39Q14498 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBM39Q14498 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBM39Q14498 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBM39Q14498 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBM39Q14498 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBM39Q14498 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBM39Q14498 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RBM39Q14498 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RBM39Q14498 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RBM39Q14498 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RBM39Q14498 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RBM39Q14498 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RBM39Q14498 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBM39Q14498 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RBM39Q14498 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBM39Q14498 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBM39Q14498 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RBM39Q14498 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RBM39Q14498 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RBM39Q14498 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RBM39Q14498 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RBM39Q14498 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RBM39Q14498 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBM39Q14498 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBM39Q14498 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RBM39Q14498 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBM39Q14498 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBM39Q14498 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBM39Q14498 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBM39Q14498 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBM39Q14498 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBM39Q14498 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBM39Q14498 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RBM39Q14498 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBM39Q14498 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBM39Q14498 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RBM39Q14498 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RBM39Q14498 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBM39Q14498 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBM39Q14498 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBM39Q14498 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBM39Q14498 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBM39Q14498 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBM39Q14498 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBM39Q14498 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBM39Q14498 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
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