Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRR1Q13601 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRR1Q13601 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRR1Q13601 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRR1Q13601 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRR1Q13601 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRR1Q13601 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRR1Q13601 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRR1Q13601 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRR1Q13601 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRR1Q13601 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRR1Q13601 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRR1Q13601 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRR1Q13601 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRR1Q13601 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRR1Q13601 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
KRR1Q13601 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
KRR1Q13601 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KRR1Q13601 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRR1Q13601 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRR1Q13601 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRR1Q13601 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRR1Q13601 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRR1Q13601 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRR1Q13601 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRR1Q13601 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRR1Q13601 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRR1Q13601 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRR1Q13601 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRR1Q13601 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRR1Q13601 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRR1Q13601 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRR1Q13601 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRR1Q13601 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRR1Q13601 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRR1Q13601 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRR1Q13601 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRR1Q13601 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRR1Q13601 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRR1Q13601 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRR1Q13601 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRR1Q13601 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRR1Q13601 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRR1Q13601 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
KRR1Q13601 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRR1Q13601 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRR1Q13601 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRR1Q13601 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRR1Q13601 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRR1Q13601 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRR1Q13601 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRR1Q13601 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRR1Q13601 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRR1Q13601 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRR1Q13601 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KRR1Q13601 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KRR1Q13601 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
KRR1Q13601 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRR1Q13601 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRR1Q13601 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRR1Q13601 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRR1Q13601 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
KRR1Q13601 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRR1Q13601 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRR1Q13601 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
KRR1Q13601 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRR1Q13601 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRR1Q13601 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRR1Q13601 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRR1Q13601 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRR1Q13601 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRR1Q13601 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRR1Q13601 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRR1Q13601 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRR1Q13601 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRR1Q13601 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRR1Q13601 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRR1Q13601 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRR1Q13601 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRR1Q13601 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRR1Q13601 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRR1Q13601 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRR1Q13601 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRR1Q13601 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRR1Q13601 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRR1Q13601 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRR1Q13601 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRR1Q13601 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRR1Q13601 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRR1Q13601 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRR1Q13601 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRR1Q13601 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRR1Q13601 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRR1Q13601 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRR1Q13601 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRR1Q13601 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRR1Q13601 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRR1Q13601 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRR1Q13601 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
KRR1Q13601 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
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