Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
NEUROD1Q13562 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
NEUROD1Q13562 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.21■■■■■ 4.35
NEUROD1Q13562 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC42.17■■■■■ 4.34
NEUROD1Q13562 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
NEUROD1Q13562 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC42.17■■■■■ 4.34
NEUROD1Q13562 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC42.17■■■■■ 4.34
NEUROD1Q13562 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
NEUROD1Q13562 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC42.13■■■■■ 4.33
NEUROD1Q13562 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC42.09■■■■■ 4.33
NEUROD1Q13562 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
NEUROD1Q13562 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
NEUROD1Q13562 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC42.03■■■■■ 4.32
NEUROD1Q13562 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
NEUROD1Q13562 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
NEUROD1Q13562 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.98■■■■■ 4.31
NEUROD1Q13562 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC41.92■■■■■ 4.3
NEUROD1Q13562 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC41.91■■■■■ 4.3
NEUROD1Q13562 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
NEUROD1Q13562 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC41.87■■■■■ 4.29
NEUROD1Q13562 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.87■■■■■ 4.29
NEUROD1Q13562 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
NEUROD1Q13562 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
NEUROD1Q13562 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC41.8■■■■■ 4.28
NEUROD1Q13562 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
NEUROD1Q13562 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
NEUROD1Q13562 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
NEUROD1Q13562 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC41.69■■■■■ 4.26
NEUROD1Q13562 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC41.68■■■■■ 4.26
NEUROD1Q13562 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC41.68■■■■■ 4.26
NEUROD1Q13562 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC41.67■■■■■ 4.26
NEUROD1Q13562 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
NEUROD1Q13562 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
NEUROD1Q13562 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
NEUROD1Q13562 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC41.65■■■■■ 4.26
NEUROD1Q13562 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
NEUROD1Q13562 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC41.65■■■■■ 4.26
NEUROD1Q13562 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC41.64■■■■■ 4.26
NEUROD1Q13562 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.63■■■■■ 4.25
NEUROD1Q13562 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
NEUROD1Q13562 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
NEUROD1Q13562 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.61■■■■■ 4.25
NEUROD1Q13562 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC41.6■■■■■ 4.25
NEUROD1Q13562 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
NEUROD1Q13562 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
NEUROD1Q13562 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.59■■■■■ 4.25
NEUROD1Q13562 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
NEUROD1Q13562 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
NEUROD1Q13562 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC41.57■■■■■ 4.25
NEUROD1Q13562 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC41.55■■■■■ 4.24
NEUROD1Q13562 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
NEUROD1Q13562 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
NEUROD1Q13562 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
NEUROD1Q13562 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC41.5■■■■■ 4.23
NEUROD1Q13562 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
NEUROD1Q13562 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC41.47■■■■■ 4.23
NEUROD1Q13562 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.23
NEUROD1Q13562 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
NEUROD1Q13562 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
NEUROD1Q13562 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
NEUROD1Q13562 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC41.38■■■■■ 4.22
NEUROD1Q13562 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC41.38■■■■■ 4.22
NEUROD1Q13562 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
NEUROD1Q13562 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
NEUROD1Q13562 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
NEUROD1Q13562 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC41.35■■■■■ 4.21
NEUROD1Q13562 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC41.34■■■■■ 4.21
NEUROD1Q13562 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
NEUROD1Q13562 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
NEUROD1Q13562 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
NEUROD1Q13562 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC41.31■■■■■ 4.2
NEUROD1Q13562 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
NEUROD1Q13562 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
NEUROD1Q13562 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
NEUROD1Q13562 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
NEUROD1Q13562 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.22■■■■■ 4.19
NEUROD1Q13562 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC41.22■■■■■ 4.19
NEUROD1Q13562 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
NEUROD1Q13562 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
NEUROD1Q13562 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
NEUROD1Q13562 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
NEUROD1Q13562 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
NEUROD1Q13562 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
NEUROD1Q13562 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.17■■■■■ 4.18
NEUROD1Q13562 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
NEUROD1Q13562 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
NEUROD1Q13562 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC41.13■■■■■ 4.17
NEUROD1Q13562 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC41.1■■■■■ 4.17
NEUROD1Q13562 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC41.09■■■■■ 4.17
NEUROD1Q13562 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC41.09■■■■■ 4.17
NEUROD1Q13562 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
NEUROD1Q13562 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
NEUROD1Q13562 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
NEUROD1Q13562 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.04■■■■■ 4.16
NEUROD1Q13562 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
NEUROD1Q13562 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
NEUROD1Q13562 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC40.99■■■■■ 4.15
NEUROD1Q13562 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC40.94■■■■■ 4.14
NEUROD1Q13562 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC40.94■■■■■ 4.14
NEUROD1Q13562 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC40.93■■■■■ 4.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms