Protein–RNA interactions for Protein: Q12510

CMR1, DNA damage-binding protein CMR1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CMR1Q12510 YDL221WYDL221W 552 nt12.23□□□□□ -0.45
CMR1Q12510 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.21□□□□□ -0.45
CMR1Q12510 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.21□□□□□ -0.45
CMR1Q12510 YBR220CYBR220C 1683 nt12.2□□□□□ -0.46
CMR1Q12510 SIS1YNL007C 1059 nt12.18□□□□□ -0.46
CMR1Q12510 TAT1YBR069C 1860 nt12.16□□□□□ -0.46
CMR1Q12510 SDH1YKL148C 1923 nt12.13□□□□□ -0.47
CMR1Q12510 IRC15YPL017C 1500 nt12.06□□□□□ -0.48
CMR1Q12510 ART5YGR068C 1761 nt12.05□□□□□ -0.48
CMR1Q12510 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.05□□□□□ -0.48
CMR1Q12510 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.05□□□□□ -0.48
CMR1Q12510 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.05□□□□□ -0.48
CMR1Q12510 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.05□□□□□ -0.48
CMR1Q12510 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.05□□□□□ -0.48
CMR1Q12510 GFD2YCL036W 1701 nt12.04□□□□□ -0.48
CMR1Q12510 SCC4YER147C 1875 nt12.02□□□□□ -0.49
CMR1Q12510 YLR281CYLR281C 468 nt12□□□□□ -0.49
CMR1Q12510 RTS2YOR077W 699 nt11.99□□□□□ -0.49
CMR1Q12510 GIS3YLR094C 1509 nt11.98□□□□□ -0.49
CMR1Q12510 PUS2YGL063W 1113 nt11.98□□□□□ -0.49
CMR1Q12510 WHI5YOR083W 888 nt11.96□□□□□ -0.49
CMR1Q12510 PET9YBL030C 957 nt11.93□□□□□ -0.5
CMR1Q12510 NME1NME1 340 nt11.93□□□□□ -0.5
CMR1Q12510 TIR4YOR009W 1464 nt11.93□□□□□ -0.5
CMR1Q12510 YCH1YGR203W 447 nt11.87□□□□□ -0.51
CMR1Q12510 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.83□□□□□ -0.52
CMR1Q12510 YMR057CYMR057C 372 nt11.83□□□□□ -0.52
CMR1Q12510 YGR139WYGR139W 339 nt11.81□□□□□ -0.52
CMR1Q12510 CUE1YMR264W 612 nt11.81□□□□□ -0.52
CMR1Q12510 SEC11YIR022W 504 nt11.8□□□□□ -0.52
CMR1Q12510 PCH2YBR186W 1695 nt11.79□□□□□ -0.52
CMR1Q12510 YSC84YHR016C 1407 nt11.78□□□□□ -0.52
CMR1Q12510 YJL152WYJL152W 360 nt11.76□□□□□ -0.53
CMR1Q12510 DSK2YMR276W 1122 nt11.74□□□□□ -0.53
CMR1Q12510 GUT2YIL155C 1950 nt11.74□□□□□ -0.53
CMR1Q12510 IMP2'YIL154C 1041 nt11.72□□□□□ -0.53
CMR1Q12510 FPS1YLL043W 2010 nt11.71□□□□□ -0.53
CMR1Q12510 YIL100WYIL100W 354 nt11.7□□□□□ -0.54
CMR1Q12510 YHL050CYHL050C 2094 nt11.69□□□□□ -0.54
CMR1Q12510 FMP45YDL222C 930 nt11.69□□□□□ -0.54
CMR1Q12510 RRT12YCR045C 1476 nt11.66□□□□□ -0.54
CMR1Q12510 YLR236CYLR236C 324 nt11.65□□□□□ -0.54
CMR1Q12510 YNL195CYNL195C 786 nt11.64□□□□□ -0.55
CMR1Q12510 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.63□□□□□ -0.55
CMR1Q12510 YPR011CYPR011C 981 nt11.61□□□□□ -0.55
CMR1Q12510 IDH1YNL037C 1083 nt11.59□□□□□ -0.55
CMR1Q12510 PIB2YGL023C 1908 nt11.54□□□□□ -0.56
CMR1Q12510 RTF1YGL244W 1677 nt11.51□□□□□ -0.57
CMR1Q12510 YDR433WYDR433W 441 nt11.48□□□□□ -0.57
CMR1Q12510 LPX1YOR084W 1164 nt11.46□□□□□ -0.57
CMR1Q12510 GBP2YCL011C 1284 nt11.45□□□□□ -0.58
CMR1Q12510 PAC11YDR488C 1602 nt11.45□□□□□ -0.58
CMR1Q12510 BOP3YNL042W 1191 nt11.44□□□□□ -0.58
CMR1Q12510 ERV46YAL042W 1248 nt11.42□□□□□ -0.58
CMR1Q12510 RRD1YIL153W 1182 nt11.36□□□□□ -0.59
CMR1Q12510 YKR040CYKR040C 504 nt11.34□□□□□ -0.59
CMR1Q12510 NCP1YHR042W 2076 nt11.32□□□□□ -0.6
CMR1Q12510 MXR2YCL033C 507 nt11.32□□□□□ -0.6
CMR1Q12510 YJL225CYJL225C 5277 nt11.32□□□□□ -0.6
CMR1Q12510 PTK1YKL198C 1989 nt11.32□□□□□ -0.6
CMR1Q12510 TCD2YKL027W 1344 nt11.3□□□□□ -0.6
CMR1Q12510 DED1YOR204W 1815 nt11.29□□□□□ -0.6
CMR1Q12510 SPP1YPL138C 1062 nt11.28□□□□□ -0.6
CMR1Q12510 LCB1YMR296C 1677 nt11.27□□□□□ -0.6
CMR1Q12510 FMP52YER004W 696 nt11.26□□□□□ -0.61
CMR1Q12510 MRPL8YJL063C 717 nt11.25□□□□□ -0.61
CMR1Q12510 FMT1YBL013W 1206 nt11.2□□□□□ -0.62
CMR1Q12510 PCM1YEL058W 1674 nt11.2□□□□□ -0.62
CMR1Q12510 ADO1YJR105W 1023 nt11.17□□□□□ -0.62
CMR1Q12510 SIM1YIL123W 1431 nt11.16□□□□□ -0.62
CMR1Q12510 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.15□□□□□ -0.62
CMR1Q12510 YEL076CYEL076C 651 nt11.15□□□□□ -0.62
CMR1Q12510 CWP1YKL096W 720 nt11.15□□□□□ -0.62
CMR1Q12510 YLR464WYLR464W 651 nt11.15□□□□□ -0.62
CMR1Q12510 ADH2YMR303C 1047 nt11.15□□□□□ -0.62
CMR1Q12510 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11.15□□□□□ -0.63
CMR1Q12510 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11.15□□□□□ -0.63
CMR1Q12510 YFL054CYFL054C 1941 nt11.13□□□□□ -0.63
CMR1Q12510 SNF6YHL025W 999 nt11.12□□□□□ -0.63
CMR1Q12510 RTG1YOL067C 534 nt11.1□□□□□ -0.63
CMR1Q12510 YCL042WYCL042W 360 nt11.1□□□□□ -0.63
CMR1Q12510 BIO4YNR057C 714 nt11.08□□□□□ -0.64
CMR1Q12510 SOR2YDL246C 1074 nt11.07□□□□□ -0.64
CMR1Q12510 SOR1YJR159W 1074 nt11.07□□□□□ -0.64
CMR1Q12510 FRD1YEL047C 1413 nt11.07□□□□□ -0.64
CMR1Q12510 SPT8YLR055C 1809 nt11.03□□□□□ -0.64
CMR1Q12510 LYS4YDR234W 2082 nt11.02□□□□□ -0.65
CMR1Q12510 HUA1YGR268C 597 nt11□□□□□ -0.65
CMR1Q12510 PTH1YHR189W 573 nt11□□□□□ -0.65
CMR1Q12510 CSM2YIL132C 642 nt10.96□□□□□ -0.65
CMR1Q12510 YLR235CYLR235C 399 nt10.95□□□□□ -0.66
CMR1Q12510 YIH1YCR059C 777 nt10.94□□□□□ -0.66
CMR1Q12510 ERF2YLR246W 1080 nt10.92□□□□□ -0.66
CMR1Q12510 YKL030WYKL030W 606 nt10.91□□□□□ -0.66
CMR1Q12510 YLL053CYLL053C 459 nt10.9□□□□□ -0.66
CMR1Q12510 CRR1YLR213C 1269 nt10.9□□□□□ -0.66
CMR1Q12510 RNQ1YCL028W 1218 nt10.9□□□□□ -0.66
CMR1Q12510 NVJ2YPR091C 2313 nt10.87□□□□□ -0.67
CMR1Q12510 SWE1YJL187C 2460 nt10.87□□□□□ -0.67
CMR1Q12510 UBX6YJL048C 1191 nt10.84□□□□□ -0.67
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