Protein–RNA interactions for Protein: Q12489

YDL012C, Cysteine-rich and transmembrane domain-containing protein YDL012C, yeastyeast

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YDL012CQ12489 Q0182Q0182 405 nt7.46□□□□□ -1.22
YDL012CQ12489 GFD2YCL036W 1701 nt7.46□□□□□ -1.22
YDL012CQ12489 SUF2tP(AGG)C 72 nt7.45□□□□□ -1.22
YDL012CQ12489 SUF10tP(AGG)N 72 nt7.45□□□□□ -1.22
YDL012CQ12489 YHL050CYHL050C 2094 nt7.43□□□□□ -1.22
YDL012CQ12489 RTS2YOR077W 699 nt7.43□□□□□ -1.22
YDL012CQ12489 ART5YGR068C 1761 nt7.43□□□□□ -1.22
YDL012CQ12489 RTF1YGL244W 1677 nt7.42□□□□□ -1.22
YDL012CQ12489 LSM3YLR438C-A 270 nt7.42□□□□□ -1.22
YDL012CQ12489 WWM1YFL010C 636 nt7.4□□□□□ -1.22
YDL012CQ12489 PET9YBL030C 957 nt7.35□□□□□ -1.23
YDL012CQ12489 CUE1YMR264W 612 nt7.35□□□□□ -1.23
YDL012CQ12489 RRT12YCR045C 1476 nt7.35□□□□□ -1.23
YDL012CQ12489 BOP3YNL042W 1191 nt7.34□□□□□ -1.23
YDL012CQ12489 PTK1YKL198C 1989 nt7.3□□□□□ -1.24
YDL012CQ12489 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt7.3□□□□□ -1.24
YDL012CQ12489 YNL195CYNL195C 786 nt7.3□□□□□ -1.24
YDL012CQ12489 MOT3YMR070W 1473 nt7.3□□□□□ -1.24
YDL012CQ12489 YCH1YGR203W 447 nt7.29□□□□□ -1.24
YDL012CQ12489 TIR4YOR009W 1464 nt7.27□□□□□ -1.25
YDL012CQ12489 PST2YDR032C 597 nt7.25□□□□□ -1.25
YDL012CQ12489 YIL100WYIL100W 354 nt7.25□□□□□ -1.25
YDL012CQ12489 YGR021WYGR021W 873 nt7.24□□□□□ -1.25
YDL012CQ12489 NCP1YHR042W 2076 nt7.2□□□□□ -1.26
YDL012CQ12489 YMR057CYMR057C 372 nt7.2□□□□□ -1.26
YDL012CQ12489 HOM6YJR139C 1080 nt7.19□□□□□ -1.26
YDL012CQ12489 YLR236CYLR236C 324 nt7.17□□□□□ -1.26
YDL012CQ12489 UME6YDR207C 2511 nt7.14□□□□□ -1.27
YDL012CQ12489 YFL054CYFL054C 1941 nt7.14□□□□□ -1.27
YDL012CQ12489 YJL225CYJL225C 5277 nt7.14□□□□□ -1.27
YDL012CQ12489 BOR1YNL275W 1731 nt7.13□□□□□ -1.27
YDL012CQ12489 SPT8YLR055C 1809 nt7.13□□□□□ -1.27
YDL012CQ12489 MNP1YGL068W 585 nt7.11□□□□□ -1.27
YDL012CQ12489 RKM5YLR137W 1104 nt7.09□□□□□ -1.27
YDL012CQ12489 LCB1YMR296C 1677 nt7.07□□□□□ -1.28
YDL012CQ12489 SHU1YHL006C 453 nt7.07□□□□□ -1.28
YDL012CQ12489 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt7.07□□□□□ -1.28
YDL012CQ12489 NPL3YDR432W 1245 nt7.05□□□□□ -1.28
YDL012CQ12489 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt7.04□□□□□ -1.28
YDL012CQ12489 YJL152WYJL152W 360 nt7□□□□□ -1.29
YDL012CQ12489 SWE1YJL187C 2460 nt6.99□□□□□ -1.29
YDL012CQ12489 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt6.98□□□□□ -1.29
YDL012CQ12489 HSP60YLR259C 1719 nt6.96□□□□□ -1.29
YDL012CQ12489 LYS4YDR234W 2082 nt6.91□□□□□ -1.3
YDL012CQ12489 SIM1YIL123W 1431 nt6.89□□□□□ -1.31
YDL012CQ12489 MCH5YOR306C 1566 nt6.89□□□□□ -1.31
YDL012CQ12489 RRD1YIL153W 1182 nt6.88□□□□□ -1.31
YDL012CQ12489 FMP52YER004W 696 nt6.87□□□□□ -1.31
YDL012CQ12489 ALG12YNR030W 1656 nt6.86□□□□□ -1.31
YDL012CQ12489 GLK1YCL040W 1503 nt6.86□□□□□ -1.31
YDL012CQ12489 PCM1YEL058W 1674 nt6.85□□□□□ -1.31
YDL012CQ12489 BIO4YNR057C 714 nt6.83□□□□□ -1.32
YDL012CQ12489 YOL037CYOL037C 354 nt6.82□□□□□ -1.32
YDL012CQ12489 FUR4YBR021W 1902 nt6.81□□□□□ -1.32
YDL012CQ12489 DED1YOR204W 1815 nt6.8□□□□□ -1.32
YDL012CQ12489 RDN37-1RDN37-1 5354 nt6.78□□□□□ -1.32
YDL012CQ12489 RDN37-2RDN37-2 5354 nt6.78□□□□□ -1.32
YDL012CQ12489 SNF6YHL025W 999 nt6.76□□□□□ -1.33
YDL012CQ12489 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt6.76□□□□□ -1.33
YDL012CQ12489 CRR1YLR213C 1269 nt6.76□□□□□ -1.33
YDL012CQ12489 FMT1YBL013W 1206 nt6.76□□□□□ -1.33
YDL012CQ12489 IDH1YNL037C 1083 nt6.76□□□□□ -1.33
YDL012CQ12489 GBP2YCL011C 1284 nt6.76□□□□□ -1.33
YDL012CQ12489 TCD2YKL027W 1344 nt6.76□□□□□ -1.33
YDL012CQ12489 ERF2YLR246W 1080 nt6.75□□□□□ -1.33
YDL012CQ12489 YKL097CYKL097C 411 nt6.74□□□□□ -1.33
YDL012CQ12489 ADH2YMR303C 1047 nt6.74□□□□□ -1.33
YDL012CQ12489 CWP1YKL096W 720 nt6.73□□□□□ -1.33
YDL012CQ12489 DSK2YMR276W 1122 nt6.72□□□□□ -1.33
YDL012CQ12489 CCA1YER168C 1641 nt6.72□□□□□ -1.33
YDL012CQ12489 PRP4YPR178W 1398 nt6.71□□□□□ -1.33
YDL012CQ12489 AAC1YMR056C 930 nt6.71□□□□□ -1.34
YDL012CQ12489 WHI5YOR083W 888 nt6.71□□□□□ -1.34
YDL012CQ12489 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt6.7□□□□□ -1.34
YDL012CQ12489 YEL076CYEL076C 651 nt6.7□□□□□ -1.34
YDL012CQ12489 YLR464WYLR464W 651 nt6.7□□□□□ -1.34
YDL012CQ12489 NAR1YNL240C 1476 nt6.68□□□□□ -1.34
YDL012CQ12489 HEM12YDR047W 1089 nt6.68□□□□□ -1.34
YDL012CQ12489 MIC10YCL057C-A 294 nt6.68□□□□□ -1.34
YDL012CQ12489 DPS1YLL018C 1674 nt6.68□□□□□ -1.34
YDL012CQ12489 YIH1YCR059C 777 nt6.67□□□□□ -1.34
YDL012CQ12489 SOR2YDL246C 1074 nt6.67□□□□□ -1.34
YDL012CQ12489 SOR1YJR159W 1074 nt6.67□□□□□ -1.34
YDL012CQ12489 RAX1YOR301W 1308 nt6.67□□□□□ -1.34
YDL012CQ12489 YLR281CYLR281C 468 nt6.66□□□□□ -1.34
YDL012CQ12489 YLL053CYLL053C 459 nt6.64□□□□□ -1.35
YDL012CQ12489 ATF2YGR177C 1608 nt6.64□□□□□ -1.35
YDL012CQ12489 SNG1YGR197C 1644 nt6.63□□□□□ -1.35
YDL012CQ12489 BMT6YLR063W 1098 nt6.63□□□□□ -1.35
YDL012CQ12489 BIO5YNR056C 1686 nt6.62□□□□□ -1.35
YDL012CQ12489 YKR005CYKR005C 1578 nt6.61□□□□□ -1.35
YDL012CQ12489 RNQ1YCL028W 1218 nt6.61□□□□□ -1.35
YDL012CQ12489 SNF1YDR477W 1902 nt6.6□□□□□ -1.35
YDL012CQ12489 YCL042WYCL042W 360 nt6.6□□□□□ -1.35
YDL012CQ12489 YFL067WYFL067W 528 nt6.59□□□□□ -1.35
YDL012CQ12489 MXR2YCL033C 507 nt6.59□□□□□ -1.35
YDL012CQ12489 PBP1YGR178C 2169 nt6.58□□□□□ -1.36
YDL012CQ12489 WSC2YNL283C 1512 nt6.57□□□□□ -1.36
YDL012CQ12489 YDR433WYDR433W 441 nt6.57□□□□□ -1.36
YDL012CQ12489 FTR1YER145C 1215 nt6.57□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 21.6 ms