Protein–RNA interactions for Protein: Q12158

MCD1, Sister chromatid cohesion protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MCD1Q12158 DCW1YKL046C 1350 nt12.05□□□□□ -0.48
MCD1Q12158 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.01□□□□□ -0.49
MCD1Q12158 BDF1YLR399C 2061 nt12□□□□□ -0.49
MCD1Q12158 PAC11YDR488C 1602 nt12□□□□□ -0.49
MCD1Q12158 EMI2YDR516C 1503 nt11.98□□□□□ -0.49
MCD1Q12158 PTP1YDL230W 1008 nt11.98□□□□□ -0.49
MCD1Q12158 YJL152WYJL152W 360 nt11.98□□□□□ -0.49
MCD1Q12158 WHI5YOR083W 888 nt11.98□□□□□ -0.49
MCD1Q12158 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.97□□□□□ -0.49
MCD1Q12158 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.97□□□□□ -0.49
MCD1Q12158 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.97□□□□□ -0.49
MCD1Q12158 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.97□□□□□ -0.49
MCD1Q12158 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.97□□□□□ -0.49
MCD1Q12158 YCH1YGR203W 447 nt11.97□□□□□ -0.49
MCD1Q12158 YLR281CYLR281C 468 nt11.97□□□□□ -0.49
MCD1Q12158 ART5YGR068C 1761 nt11.92□□□□□ -0.5
MCD1Q12158 PET9YBL030C 957 nt11.92□□□□□ -0.5
MCD1Q12158 CAC2YML102W 1407 nt11.9□□□□□ -0.5
MCD1Q12158 YDL221WYDL221W 552 nt11.88□□□□□ -0.51
MCD1Q12158 PUS2YGL063W 1113 nt11.88□□□□□ -0.51
MCD1Q12158 TIR4YOR009W 1464 nt11.87□□□□□ -0.51
MCD1Q12158 GFD2YCL036W 1701 nt11.86□□□□□ -0.51
MCD1Q12158 IMP2'YIL154C 1041 nt11.84□□□□□ -0.51
MCD1Q12158 TAT1YBR069C 1860 nt11.83□□□□□ -0.52
MCD1Q12158 NVJ2YPR091C 2313 nt11.8□□□□□ -0.52
MCD1Q12158 YMR057CYMR057C 372 nt11.79□□□□□ -0.52
MCD1Q12158 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.79□□□□□ -0.52
MCD1Q12158 IDH1YNL037C 1083 nt11.77□□□□□ -0.53
MCD1Q12158 DSK2YMR276W 1122 nt11.75□□□□□ -0.53
MCD1Q12158 RTS2YOR077W 699 nt11.75□□□□□ -0.53
MCD1Q12158 SDH1YKL148C 1923 nt11.73□□□□□ -0.53
MCD1Q12158 YBR220CYBR220C 1683 nt11.72□□□□□ -0.53
MCD1Q12158 IRC15YPL017C 1500 nt11.72□□□□□ -0.53
MCD1Q12158 SCC4YER147C 1875 nt11.68□□□□□ -0.54
MCD1Q12158 CUE1YMR264W 612 nt11.67□□□□□ -0.54
MCD1Q12158 GIS3YLR094C 1509 nt11.66□□□□□ -0.54
MCD1Q12158 YLR236CYLR236C 324 nt11.65□□□□□ -0.54
MCD1Q12158 YIL100WYIL100W 354 nt11.64□□□□□ -0.55
MCD1Q12158 GBP2YCL011C 1284 nt11.63□□□□□ -0.55
MCD1Q12158 FMP45YDL222C 930 nt11.58□□□□□ -0.56
MCD1Q12158 YDR433WYDR433W 441 nt11.56□□□□□ -0.56
MCD1Q12158 TCD2YKL027W 1344 nt11.55□□□□□ -0.56
MCD1Q12158 YNL195CYNL195C 786 nt11.54□□□□□ -0.56
MCD1Q12158 YPR011CYPR011C 981 nt11.49□□□□□ -0.57
MCD1Q12158 YGR139WYGR139W 339 nt11.45□□□□□ -0.58
MCD1Q12158 ERV46YAL042W 1248 nt11.45□□□□□ -0.58
MCD1Q12158 SEC11YIR022W 504 nt11.42□□□□□ -0.58
MCD1Q12158 YKR040CYKR040C 504 nt11.41□□□□□ -0.58
MCD1Q12158 LPX1YOR084W 1164 nt11.41□□□□□ -0.58
MCD1Q12158 PCH2YBR186W 1695 nt11.38□□□□□ -0.59
MCD1Q12158 YSC84YHR016C 1407 nt11.37□□□□□ -0.59
MCD1Q12158 FMP52YER004W 696 nt11.37□□□□□ -0.59
MCD1Q12158 RRD1YIL153W 1182 nt11.36□□□□□ -0.59
MCD1Q12158 MXR2YCL033C 507 nt11.35□□□□□ -0.59
MCD1Q12158 GUT2YIL155C 1950 nt11.34□□□□□ -0.59
MCD1Q12158 YCL042WYCL042W 360 nt11.34□□□□□ -0.59
MCD1Q12158 DED1YOR204W 1815 nt11.3□□□□□ -0.6
MCD1Q12158 RRT12YCR045C 1476 nt11.29□□□□□ -0.6
MCD1Q12158 MRPL8YJL063C 717 nt11.27□□□□□ -0.61
MCD1Q12158 YHL050CYHL050C 2094 nt11.23□□□□□ -0.61
MCD1Q12158 CWP1YKL096W 720 nt11.22□□□□□ -0.61
MCD1Q12158 YJL225CYJL225C 5277 nt11.22□□□□□ -0.61
MCD1Q12158 SOR2YDL246C 1074 nt11.21□□□□□ -0.61
MCD1Q12158 SOR1YJR159W 1074 nt11.21□□□□□ -0.61
MCD1Q12158 FMT1YBL013W 1206 nt11.19□□□□□ -0.62
MCD1Q12158 SNF6YHL025W 999 nt11.18□□□□□ -0.62
MCD1Q12158 PCM1YEL058W 1674 nt11.17□□□□□ -0.62
MCD1Q12158 FRD1YEL047C 1413 nt11.17□□□□□ -0.62
MCD1Q12158 PIB2YGL023C 1908 nt11.16□□□□□ -0.62
MCD1Q12158 ADH2YMR303C 1047 nt11.15□□□□□ -0.62
MCD1Q12158 ADO1YJR105W 1023 nt11.12□□□□□ -0.63
MCD1Q12158 SPP1YPL138C 1062 nt11.12□□□□□ -0.63
MCD1Q12158 SIM1YIL123W 1431 nt11.08□□□□□ -0.64
MCD1Q12158 RTF1YGL244W 1677 nt11.08□□□□□ -0.64
MCD1Q12158 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.07□□□□□ -0.64
MCD1Q12158 YEL076CYEL076C 651 nt11.07□□□□□ -0.64
MCD1Q12158 YLR235CYLR235C 399 nt11.07□□□□□ -0.64
MCD1Q12158 YLR464WYLR464W 651 nt11.07□□□□□ -0.64
MCD1Q12158 BOP3YNL042W 1191 nt11.07□□□□□ -0.64
MCD1Q12158 RTG1YOL067C 534 nt11.04□□□□□ -0.64
MCD1Q12158 PTH1YHR189W 573 nt11.01□□□□□ -0.65
MCD1Q12158 RPM1RPM1 483 nt11□□□□□ -0.65
MCD1Q12158 RNQ1YCL028W 1218 nt11□□□□□ -0.65
MCD1Q12158 DIC1YLR348C 897 nt10.99□□□□□ -0.65
MCD1Q12158 YIH1YCR059C 777 nt10.98□□□□□ -0.65
MCD1Q12158 BIO4YNR057C 714 nt10.97□□□□□ -0.65
MCD1Q12158 LCB1YMR296C 1677 nt10.96□□□□□ -0.65
MCD1Q12158 YKL030WYKL030W 606 nt10.95□□□□□ -0.66
MCD1Q12158 PTK1YKL198C 1989 nt10.92□□□□□ -0.66
MCD1Q12158 UME6YDR207C 2511 nt10.91□□□□□ -0.66
MCD1Q12158 TIM23YNR017W 669 nt10.91□□□□□ -0.66
MCD1Q12158 YLL053CYLL053C 459 nt10.9□□□□□ -0.66
MCD1Q12158 ERF2YLR246W 1080 nt10.9□□□□□ -0.66
MCD1Q12158 HUA1YGR268C 597 nt10.89□□□□□ -0.67
MCD1Q12158 YLR179CYLR179C 606 nt10.87□□□□□ -0.67
MCD1Q12158 NCP1YHR042W 2076 nt10.87□□□□□ -0.67
MCD1Q12158 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.87□□□□□ -0.67
MCD1Q12158 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.87□□□□□ -0.67
MCD1Q12158 AQY1YPR192W 918 nt10.86□□□□□ -0.67
MCD1Q12158 FTR1YER145C 1215 nt10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 8.5 ms