Protein–RNA interactions for Protein: Q12127

CCW12, Covalently-linked cell wall protein 12, yeastyeast

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CCW12Q12127 ART5YGR068C 1761 nt9.36□□□□□ -0.91
CCW12Q12127 SDH1YKL148C 1923 nt9.35□□□□□ -0.91
CCW12Q12127 GFD2YCL036W 1701 nt9.34□□□□□ -0.92
CCW12Q12127 YOL037CYOL037C 354 nt9.33□□□□□ -0.92
CCW12Q12127 PET9YBL030C 957 nt9.32□□□□□ -0.92
CCW12Q12127 YCH1YGR203W 447 nt9.31□□□□□ -0.92
CCW12Q12127 IRC15YPL017C 1500 nt9.31□□□□□ -0.92
CCW12Q12127 SCC4YER147C 1875 nt9.3□□□□□ -0.92
CCW12Q12127 NPL3YDR432W 1245 nt9.28□□□□□ -0.92
CCW12Q12127 RTS2YOR077W 699 nt9.27□□□□□ -0.93
CCW12Q12127 TIR4YOR009W 1464 nt9.27□□□□□ -0.93
CCW12Q12127 GIS3YLR094C 1509 nt9.26□□□□□ -0.93
CCW12Q12127 TAT1YBR069C 1860 nt9.25□□□□□ -0.93
CCW12Q12127 YJL152WYJL152W 360 nt9.24□□□□□ -0.93
CCW12Q12127 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt9.23□□□□□ -0.93
CCW12Q12127 YMR057CYMR057C 372 nt9.22□□□□□ -0.93
CCW12Q12127 YOR139CYOR139C 393 nt9.22□□□□□ -0.93
CCW12Q12127 CUE1YMR264W 612 nt9.18□□□□□ -0.94
CCW12Q12127 YIL100WYIL100W 354 nt9.13□□□□□ -0.95
CCW12Q12127 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt9.13□□□□□ -0.95
CCW12Q12127 SEC11YIR022W 504 nt9.12□□□□□ -0.95
CCW12Q12127 WHI5YOR083W 888 nt9.12□□□□□ -0.95
CCW12Q12127 YLR236CYLR236C 324 nt9.1□□□□□ -0.95
CCW12Q12127 YLR281CYLR281C 468 nt9.09□□□□□ -0.95
CCW12Q12127 YNL195CYNL195C 786 nt9.09□□□□□ -0.95
CCW12Q12127 FPS1YLL043W 2010 nt9.08□□□□□ -0.96
CCW12Q12127 YSC84YHR016C 1407 nt9.07□□□□□ -0.96
CCW12Q12127 PCH2YBR186W 1695 nt9.06□□□□□ -0.96
CCW12Q12127 IDH1YNL037C 1083 nt9.01□□□□□ -0.97
CCW12Q12127 GUT2YIL155C 1950 nt9□□□□□ -0.97
CCW12Q12127 RRT12YCR045C 1476 nt9□□□□□ -0.97
CCW12Q12127 YJL225CYJL225C 5277 nt8.99□□□□□ -0.97
CCW12Q12127 YHL050CYHL050C 2094 nt8.99□□□□□ -0.97
CCW12Q12127 PUS2YGL063W 1113 nt8.97□□□□□ -0.97
CCW12Q12127 IMP2'YIL154C 1041 nt8.95□□□□□ -0.98
CCW12Q12127 GBP2YCL011C 1284 nt8.95□□□□□ -0.98
CCW12Q12127 DSK2YMR276W 1122 nt8.91□□□□□ -0.98
CCW12Q12127 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt8.9□□□□□ -0.98
CCW12Q12127 IMT4tM(CAU)E 72 nt8.9□□□□□ -0.98
CCW12Q12127 IMT3tM(CAU)J3 72 nt8.9□□□□□ -0.98
CCW12Q12127 IMT1tM(CAU)O1 72 nt8.9□□□□□ -0.98
CCW12Q12127 IMT2tM(CAU)P 72 nt8.9□□□□□ -0.98
CCW12Q12127 RDN37-1RDN37-1 5354 nt8.89□□□□□ -0.99
CCW12Q12127 RDN37-2RDN37-2 5354 nt8.89□□□□□ -0.99
CCW12Q12127 TCD2YKL027W 1344 nt8.88□□□□□ -0.99
CCW12Q12127 RTF1YGL244W 1677 nt8.86□□□□□ -0.99
CCW12Q12127 YDR433WYDR433W 441 nt8.84□□□□□ -0.99
CCW12Q12127 RRD1YIL153W 1182 nt8.84□□□□□ -0.99
CCW12Q12127 BOP3YNL042W 1191 nt8.84□□□□□ -0.99
CCW12Q12127 FMP52YER004W 696 nt8.81□□□□□ -1
CCW12Q12127 PIB2YGL023C 1908 nt8.8□□□□□ -1
CCW12Q12127 DED1YOR204W 1815 nt8.78□□□□□ -1
CCW12Q12127 YPR011CYPR011C 981 nt8.77□□□□□ -1.01
CCW12Q12127 FMP45YDL222C 930 nt8.76□□□□□ -1.01
CCW12Q12127 MXR2YCL033C 507 nt8.74□□□□□ -1.01
CCW12Q12127 PCM1YEL058W 1674 nt8.73□□□□□ -1.01
CCW12Q12127 ERV46YAL042W 1248 nt8.72□□□□□ -1.01
CCW12Q12127 CWP1YKL096W 720 nt8.72□□□□□ -1.01
CCW12Q12127 FMT1YBL013W 1206 nt8.71□□□□□ -1.02
CCW12Q12127 LPX1YOR084W 1164 nt8.71□□□□□ -1.02
CCW12Q12127 YCL042WYCL042W 360 nt8.71□□□□□ -1.02
CCW12Q12127 YKR040CYKR040C 504 nt8.7□□□□□ -1.02
CCW12Q12127 SIM1YIL123W 1431 nt8.7□□□□□ -1.02
CCW12Q12127 NCP1YHR042W 2076 nt8.69□□□□□ -1.02
CCW12Q12127 LCB1YMR296C 1677 nt8.69□□□□□ -1.02
CCW12Q12127 SNF6YHL025W 999 nt8.69□□□□□ -1.02
CCW12Q12127 ADH2YMR303C 1047 nt8.69□□□□□ -1.02
CCW12Q12127 PAC11YDR488C 1602 nt8.68□□□□□ -1.02
CCW12Q12127 PTK1YKL198C 1989 nt8.67□□□□□ -1.02
CCW12Q12127 SOR2YDL246C 1074 nt8.65□□□□□ -1.02
CCW12Q12127 SOR1YJR159W 1074 nt8.65□□□□□ -1.02
CCW12Q12127 BIO4YNR057C 714 nt8.6□□□□□ -1.03
CCW12Q12127 FRD1YEL047C 1413 nt8.6□□□□□ -1.03
CCW12Q12127 YFL054CYFL054C 1941 nt8.59□□□□□ -1.03
CCW12Q12127 YIH1YCR059C 777 nt8.54□□□□□ -1.04
CCW12Q12127 RNQ1YCL028W 1218 nt8.53□□□□□ -1.04
CCW12Q12127 ERF2YLR246W 1080 nt8.51□□□□□ -1.05
CCW12Q12127 YLL053CYLL053C 459 nt8.5□□□□□ -1.05
CCW12Q12127 LYS4YDR234W 2082 nt8.49□□□□□ -1.05
CCW12Q12127 SPT8YLR055C 1809 nt8.48□□□□□ -1.05
CCW12Q12127 DIC1YLR348C 897 nt8.48□□□□□ -1.05
CCW12Q12127 MOT3YMR070W 1473 nt8.47□□□□□ -1.05
CCW12Q12127 CRR1YLR213C 1269 nt8.45□□□□□ -1.06
CCW12Q12127 PTH1YHR189W 573 nt8.44□□□□□ -1.06
CCW12Q12127 SPP1YPL138C 1062 nt8.44□□□□□ -1.06
CCW12Q12127 FTR1YER145C 1215 nt8.43□□□□□ -1.06
CCW12Q12127 YFL067WYFL067W 528 nt8.43□□□□□ -1.06
CCW12Q12127 YLR235CYLR235C 399 nt8.43□□□□□ -1.06
CCW12Q12127 HEM12YDR047W 1089 nt8.41□□□□□ -1.06
CCW12Q12127 ATF2YGR177C 1608 nt8.4□□□□□ -1.06
CCW12Q12127 DDR2YOL052C-A 186 nt8.4□□□□□ -1.06
CCW12Q12127 GAL1YBR020W 1587 nt8.39□□□□□ -1.07
CCW12Q12127 TRM5YHR070W 1500 nt8.39□□□□□ -1.07
CCW12Q12127 TIM23YNR017W 669 nt8.37□□□□□ -1.07
CCW12Q12127 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt8.36□□□□□ -1.07
CCW12Q12127 YLR179CYLR179C 606 nt8.36□□□□□ -1.07
CCW12Q12127 AQY1YPR192W 918 nt8.36□□□□□ -1.07
CCW12Q12127 SNG1YGR197C 1644 nt8.36□□□□□ -1.07
CCW12Q12127 SWE1YJL187C 2460 nt8.35□□□□□ -1.07
CCW12Q12127 MIC10YCL057C-A 294 nt8.35□□□□□ -1.07
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