Protein–RNA interactions for Protein: Q12027

YDL176W, Uncharacterized protein YDL176W, yeastyeast

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YDL176WQ12027 PTP1YDL230W 1008 nt11.36□□□□□ -0.59
YDL176WQ12027 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.36□□□□□ -0.59
YDL176WQ12027 RPP2AYOL039W 321 nt11.36□□□□□ -0.59
YDL176WQ12027 CAC2YML102W 1407 nt11.35□□□□□ -0.59
YDL176WQ12027 LSM3YLR438C-A 270 nt11.35□□□□□ -0.59
YDL176WQ12027 YDL221WYDL221W 552 nt11.33□□□□□ -0.6
YDL176WQ12027 ARO7YPR060C 771 nt11.29□□□□□ -0.6
YDL176WQ12027 SDH1YKL148C 1923 nt11.28□□□□□ -0.6
YDL176WQ12027 CCT6YDR188W 1641 nt11.27□□□□□ -0.6
YDL176WQ12027 RKM5YLR137W 1104 nt11.26□□□□□ -0.61
YDL176WQ12027 YOR139CYOR139C 393 nt11.26□□□□□ -0.61
YDL176WQ12027 SIS1YNL007C 1059 nt11.23□□□□□ -0.61
YDL176WQ12027 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.21□□□□□ -0.61
YDL176WQ12027 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.21□□□□□ -0.61
YDL176WQ12027 Q0017Q0017 162 nt11.19□□□□□ -0.62
YDL176WQ12027 IRC15YPL017C 1500 nt11.17□□□□□ -0.62
YDL176WQ12027 Q0144Q0144 330 nt11.16□□□□□ -0.62
YDL176WQ12027 SCC4YER147C 1875 nt11.16□□□□□ -0.62
YDL176WQ12027 Q0142Q0142 177 nt11.14□□□□□ -0.63
YDL176WQ12027 FPS1YLL043W 2010 nt11.12□□□□□ -0.63
YDL176WQ12027 NPL3YDR432W 1245 nt11.11□□□□□ -0.63
YDL176WQ12027 YOL037CYOL037C 354 nt11.11□□□□□ -0.63
YDL176WQ12027 ART5YGR068C 1761 nt11.11□□□□□ -0.63
YDL176WQ12027 GIS3YLR094C 1509 nt11.09□□□□□ -0.63
YDL176WQ12027 GFD2YCL036W 1701 nt11.09□□□□□ -0.63
YDL176WQ12027 BUR6YER159C 429 nt11.04□□□□□ -0.64
YDL176WQ12027 REG2YBR050C 1017 nt11.04□□□□□ -0.64
YDL176WQ12027 PCH2YBR186W 1695 nt11.03□□□□□ -0.64
YDL176WQ12027 NVJ2YPR091C 2313 nt11.03□□□□□ -0.64
YDL176WQ12027 PAC11YDR488C 1602 nt11.02□□□□□ -0.64
YDL176WQ12027 BMT5YIL096C 1011 nt11.02□□□□□ -0.65
YDL176WQ12027 SEC11YIR022W 504 nt11.02□□□□□ -0.65
YDL176WQ12027 RTS2YOR077W 699 nt11.02□□□□□ -0.65
YDL176WQ12027 PET9YBL030C 957 nt11.01□□□□□ -0.65
YDL176WQ12027 SEM1YDR363W-A 270 nt10.98□□□□□ -0.65
YDL176WQ12027 GUT2YIL155C 1950 nt10.97□□□□□ -0.65
YDL176WQ12027 YSC84YHR016C 1407 nt10.94□□□□□ -0.66
YDL176WQ12027 TIR4YOR009W 1464 nt10.93□□□□□ -0.66
YDL176WQ12027 YCH1YGR203W 447 nt10.92□□□□□ -0.66
YDL176WQ12027 CUE1YMR264W 612 nt10.91□□□□□ -0.66
YDL176WQ12027 YLR281CYLR281C 468 nt10.9□□□□□ -0.66
YDL176WQ12027 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt10.89□□□□□ -0.67
YDL176WQ12027 YMR057CYMR057C 372 nt10.87□□□□□ -0.67
YDL176WQ12027 WHI5YOR083W 888 nt10.87□□□□□ -0.67
YDL176WQ12027 YHL050CYHL050C 2094 nt10.87□□□□□ -0.67
YDL176WQ12027 RRT12YCR045C 1476 nt10.84□□□□□ -0.67
YDL176WQ12027 Q0010Q0010 387 nt10.83□□□□□ -0.68
YDL176WQ12027 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt10.81□□□□□ -0.68
YDL176WQ12027 IMT4tM(CAU)E 72 nt10.81□□□□□ -0.68
YDL176WQ12027 IMT3tM(CAU)J3 72 nt10.81□□□□□ -0.68
YDL176WQ12027 IMT1tM(CAU)O1 72 nt10.81□□□□□ -0.68
YDL176WQ12027 IMT2tM(CAU)P 72 nt10.81□□□□□ -0.68
YDL176WQ12027 PIB2YGL023C 1908 nt10.8□□□□□ -0.68
YDL176WQ12027 YJL152WYJL152W 360 nt10.79□□□□□ -0.68
YDL176WQ12027 YIL100WYIL100W 354 nt10.78□□□□□ -0.68
YDL176WQ12027 YNL195CYNL195C 786 nt10.78□□□□□ -0.68
YDL176WQ12027 PUS2YGL063W 1113 nt10.76□□□□□ -0.69
YDL176WQ12027 Q0255Q0255 1419 nt10.75□□□□□ -0.69
YDL176WQ12027 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt10.74□□□□□ -0.69
YDL176WQ12027 RTF1YGL244W 1677 nt10.73□□□□□ -0.69
YDL176WQ12027 YLR236CYLR236C 324 nt10.72□□□□□ -0.69
YDL176WQ12027 SRN2YLR119W 642 nt10.71□□□□□ -0.69
YDL176WQ12027 BOP3YNL042W 1191 nt10.66□□□□□ -0.7
YDL176WQ12027 YPR011CYPR011C 981 nt10.65□□□□□ -0.7
YDL176WQ12027 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.65□□□□□ -0.7
YDL176WQ12027 AI5_BETAQ0075 1065 nt10.63□□□□□ -0.71
YDL176WQ12027 DSK2YMR276W 1122 nt10.63□□□□□ -0.71
YDL176WQ12027 AI3Q0060 1248 nt10.61□□□□□ -0.71
YDL176WQ12027 IMP2'YIL154C 1041 nt10.59□□□□□ -0.71
YDL176WQ12027 YOR169CYOR169C 465 nt10.59□□□□□ -0.71
YDL176WQ12027 PTK1YKL198C 1989 nt10.58□□□□□ -0.72
YDL176WQ12027 YCR099CYCR099C 468 nt10.57□□□□□ -0.72
YDL176WQ12027 IDH1YNL037C 1083 nt10.57□□□□□ -0.72
YDL176WQ12027 YGL188CYGL188C 174 nt10.56□□□□□ -0.72
YDL176WQ12027 NCP1YHR042W 2076 nt10.53□□□□□ -0.72
YDL176WQ12027 GBP2YCL011C 1284 nt10.52□□□□□ -0.73
YDL176WQ12027 FMP45YDL222C 930 nt10.48□□□□□ -0.73
YDL176WQ12027 ARP10YDR106W 855 nt10.48□□□□□ -0.73
YDL176WQ12027 RRD1YIL153W 1182 nt10.45□□□□□ -0.74
YDL176WQ12027 LPX1YOR084W 1164 nt10.45□□□□□ -0.74
YDL176WQ12027 YDR433WYDR433W 441 nt10.44□□□□□ -0.74
YDL176WQ12027 ARA2YMR041C 1008 nt10.44□□□□□ -0.74
YDL176WQ12027 DED1YOR204W 1815 nt10.44□□□□□ -0.74
YDL176WQ12027 ATP6Q0085 780 nt10.43□□□□□ -0.74
YDL176WQ12027 ERV46YAL042W 1248 nt10.43□□□□□ -0.74
YDL176WQ12027 LCB1YMR296C 1677 nt10.43□□□□□ -0.74
YDL176WQ12027 MXR2YCL033C 507 nt10.42□□□□□ -0.74
YDL176WQ12027 TCD2YKL027W 1344 nt10.39□□□□□ -0.75
YDL176WQ12027 PET20YPL159C 762 nt10.39□□□□□ -0.75
YDL176WQ12027 YFL054CYFL054C 1941 nt10.39□□□□□ -0.75
YDL176WQ12027 YKR040CYKR040C 504 nt10.35□□□□□ -0.75
YDL176WQ12027 FMT1YBL013W 1206 nt10.35□□□□□ -0.75
YDL176WQ12027 FMP52YER004W 696 nt10.32□□□□□ -0.76
YDL176WQ12027 AIR1YIL079C 1083 nt10.32□□□□□ -0.76
YDL176WQ12027 PCM1YEL058W 1674 nt10.3□□□□□ -0.76
YDL176WQ12027 SPT8YLR055C 1809 nt10.3□□□□□ -0.76
YDL176WQ12027 SIM1YIL123W 1431 nt10.28□□□□□ -0.76
YDL176WQ12027 SPP1YPL138C 1062 nt10.25□□□□□ -0.77
YDL176WQ12027 FRD1YEL047C 1413 nt10.24□□□□□ -0.77
YDL176WQ12027 SOR2YDL246C 1074 nt10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 8.6 ms