Protein–RNA interactions for Protein: Q12004

TFB4, General transcription and DNA repair factor IIH subunit TFB4, yeastyeast

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TFB4Q12004 DAL1YIR027C 1383 nt12.43□□□□□ -0.42
TFB4Q12004 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt12.41□□□□□ -0.42
TFB4Q12004 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt12.39□□□□□ -0.43
TFB4Q12004 SRN2YLR119W 642 nt12.39□□□□□ -0.43
TFB4Q12004 FIS1YIL065C 468 nt12.38□□□□□ -0.43
TFB4Q12004 YBL100CYBL100C 315 nt12.38□□□□□ -0.43
TFB4Q12004 YLR281CYLR281C 468 nt12.34□□□□□ -0.43
TFB4Q12004 Q0144Q0144 330 nt12.31□□□□□ -0.44
TFB4Q12004 YLR122CYLR122C 378 nt12.31□□□□□ -0.44
TFB4Q12004 FPR4YLR449W 1179 nt12.31□□□□□ -0.44
TFB4Q12004 TRM9YML014W 840 nt12.3□□□□□ -0.44
TFB4Q12004 PHO4YFR034C 939 nt12.29□□□□□ -0.44
TFB4Q12004 CLB6YGR109C 1143 nt12.29□□□□□ -0.44
TFB4Q12004 SSA4YER103W 1929 nt12.28□□□□□ -0.44
TFB4Q12004 PUS2YGL063W 1113 nt12.27□□□□□ -0.45
TFB4Q12004 VAR1Q0140 1197 nt12.27□□□□□ -0.45
TFB4Q12004 ABZ2YMR289W 1125 nt12.26□□□□□ -0.45
TFB4Q12004 FUN26YAL022C 1554 nt12.25□□□□□ -0.45
TFB4Q12004 SEM1YDR363W-A 270 nt12.24□□□□□ -0.45
TFB4Q12004 WHI5YOR083W 888 nt12.24□□□□□ -0.45
TFB4Q12004 SPT5YML010W 3192 nt12.19□□□□□ -0.46
TFB4Q12004 CCT6YDR188W 1641 nt12.19□□□□□ -0.46
TFB4Q12004 BDF1YLR399C 2061 nt12.08□□□□□ -0.48
TFB4Q12004 ARP10YDR106W 855 nt12.08□□□□□ -0.48
TFB4Q12004 IMP2'YIL154C 1041 nt12.08□□□□□ -0.48
TFB4Q12004 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.07□□□□□ -0.48
TFB4Q12004 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.07□□□□□ -0.48
TFB4Q12004 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.05□□□□□ -0.48
TFB4Q12004 DSK2YMR276W 1122 nt12.02□□□□□ -0.49
TFB4Q12004 ALF1YNL148C 765 nt12.02□□□□□ -0.49
TFB4Q12004 TOM20YGR082W 552 nt12.01□□□□□ -0.49
TFB4Q12004 YPS1YLR120C 1710 nt11.97□□□□□ -0.49
TFB4Q12004 YDR095CYDR095C 411 nt11.97□□□□□ -0.49
TFB4Q12004 YPR011CYPR011C 981 nt11.95□□□□□ -0.5
TFB4Q12004 FMP45YDL222C 930 nt11.93□□□□□ -0.5
TFB4Q12004 LCP5YER127W 1074 nt11.93□□□□□ -0.5
TFB4Q12004 MEP2YNL142W 1500 nt11.91□□□□□ -0.5
TFB4Q12004 YLR236CYLR236C 324 nt11.91□□□□□ -0.5
TFB4Q12004 YCH1YGR203W 447 nt11.88□□□□□ -0.51
TFB4Q12004 SIS1YNL007C 1059 nt11.88□□□□□ -0.51
TFB4Q12004 URH1YDR400W 1023 nt11.86□□□□□ -0.51
TFB4Q12004 TAT1YBR069C 1860 nt11.85□□□□□ -0.51
TFB4Q12004 UTP6YDR449C 1323 nt11.85□□□□□ -0.51
TFB4Q12004 UME6YDR207C 2511 nt11.82□□□□□ -0.52
TFB4Q12004 PET20YPL159C 762 nt11.82□□□□□ -0.52
TFB4Q12004 MRPL8YJL063C 717 nt11.81□□□□□ -0.52
TFB4Q12004 AI5_BETAQ0075 1065 nt11.8□□□□□ -0.52
TFB4Q12004 YJL152WYJL152W 360 nt11.8□□□□□ -0.52
TFB4Q12004 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.79□□□□□ -0.52
TFB4Q12004 ERV46YAL042W 1248 nt11.78□□□□□ -0.52
TFB4Q12004 YCR099CYCR099C 468 nt11.76□□□□□ -0.53
TFB4Q12004 IDH1YNL037C 1083 nt11.76□□□□□ -0.53
TFB4Q12004 RPP2AYOL039W 321 nt11.74□□□□□ -0.53
TFB4Q12004 TIR4YOR009W 1464 nt11.7□□□□□ -0.54
TFB4Q12004 LPX1YOR084W 1164 nt11.69□□□□□ -0.54
TFB4Q12004 HMT1YBR034C 1047 nt11.69□□□□□ -0.54
TFB4Q12004 YMR090WYMR090W 684 nt11.68□□□□□ -0.54
TFB4Q12004 DCW1YKL046C 1350 nt11.67□□□□□ -0.54
TFB4Q12004 snR78snR78 87 nt11.66□□□□□ -0.54
TFB4Q12004 YJL118WYJL118W 660 nt11.66□□□□□ -0.54
TFB4Q12004 SKG1YKR100C 1068 nt11.66□□□□□ -0.54
TFB4Q12004 PTP1YDL230W 1008 nt11.65□□□□□ -0.54
TFB4Q12004 YKR040CYKR040C 504 nt11.64□□□□□ -0.55
TFB4Q12004 YPL071CYPL071C 471 nt11.64□□□□□ -0.55
TFB4Q12004 AI3Q0060 1248 nt11.63□□□□□ -0.55
TFB4Q12004 PET9YBL030C 957 nt11.63□□□□□ -0.55
TFB4Q12004 ADO1YJR105W 1023 nt11.62□□□□□ -0.55
TFB4Q12004 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt11.61□□□□□ -0.55
TFB4Q12004 CAC2YML102W 1407 nt11.6□□□□□ -0.55
TFB4Q12004 YDR433WYDR433W 441 nt11.6□□□□□ -0.55
TFB4Q12004 GBP2YCL011C 1284 nt11.59□□□□□ -0.55
TFB4Q12004 ART5YGR068C 1761 nt11.58□□□□□ -0.56
TFB4Q12004 EMI2YDR516C 1503 nt11.57□□□□□ -0.56
TFB4Q12004 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.55□□□□□ -0.56
TFB4Q12004 YEL076CYEL076C 651 nt11.55□□□□□ -0.56
TFB4Q12004 YLR464WYLR464W 651 nt11.55□□□□□ -0.56
TFB4Q12004 YMR057CYMR057C 372 nt11.55□□□□□ -0.56
TFB4Q12004 SPP1YPL138C 1062 nt11.55□□□□□ -0.56
TFB4Q12004 YHM2YMR241W 945 nt11.54□□□□□ -0.56
TFB4Q12004 YNR068CYNR068C 819 nt11.54□□□□□ -0.56
TFB4Q12004 RTG1YOL067C 534 nt11.53□□□□□ -0.56
TFB4Q12004 GFD2YCL036W 1701 nt11.52□□□□□ -0.56
TFB4Q12004 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.5□□□□□ -0.57
TFB4Q12004 MXR2YCL033C 507 nt11.47□□□□□ -0.57
TFB4Q12004 TCD2YKL027W 1344 nt11.45□□□□□ -0.58
TFB4Q12004 YBR220CYBR220C 1683 nt11.44□□□□□ -0.58
TFB4Q12004 YDL221WYDL221W 552 nt11.44□□□□□ -0.58
TFB4Q12004 YJR154WYJR154W 1041 nt11.39□□□□□ -0.59
TFB4Q12004 URE2YNL229C 1065 nt11.38□□□□□ -0.59
TFB4Q12004 SDH1YKL148C 1923 nt11.37□□□□□ -0.59
TFB4Q12004 Q0142Q0142 177 nt11.34□□□□□ -0.59
TFB4Q12004 DED1YOR204W 1815 nt11.34□□□□□ -0.59
TFB4Q12004 RRD1YIL153W 1182 nt11.33□□□□□ -0.6
TFB4Q12004 HUA1YGR268C 597 nt11.32□□□□□ -0.6
TFB4Q12004 FRD1YEL047C 1413 nt11.32□□□□□ -0.6
TFB4Q12004 UBX6YJL048C 1191 nt11.3□□□□□ -0.6
TFB4Q12004 YPL168WYPL168W 1293 nt11.3□□□□□ -0.6
TFB4Q12004 IRC15YPL017C 1500 nt11.3□□□□□ -0.6
TFB4Q12004 CUE1YMR264W 612 nt11.29□□□□□ -0.6
TFB4Q12004 SOR2YDL246C 1074 nt11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 27.6 ms