Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDG4

SCRN3, Secernin-3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRN3Q0VDG4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCRN3Q0VDG4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCRN3Q0VDG4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCRN3Q0VDG4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCRN3Q0VDG4 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCRN3Q0VDG4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCRN3Q0VDG4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCRN3Q0VDG4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCRN3Q0VDG4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SCRN3Q0VDG4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCRN3Q0VDG4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCRN3Q0VDG4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCRN3Q0VDG4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCRN3Q0VDG4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCRN3Q0VDG4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCRN3Q0VDG4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCRN3Q0VDG4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCRN3Q0VDG4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCRN3Q0VDG4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCRN3Q0VDG4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCRN3Q0VDG4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCRN3Q0VDG4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCRN3Q0VDG4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCRN3Q0VDG4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCRN3Q0VDG4 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCRN3Q0VDG4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCRN3Q0VDG4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCRN3Q0VDG4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCRN3Q0VDG4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCRN3Q0VDG4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCRN3Q0VDG4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCRN3Q0VDG4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCRN3Q0VDG4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCRN3Q0VDG4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCRN3Q0VDG4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCRN3Q0VDG4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCRN3Q0VDG4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCRN3Q0VDG4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCRN3Q0VDG4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCRN3Q0VDG4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCRN3Q0VDG4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCRN3Q0VDG4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCRN3Q0VDG4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCRN3Q0VDG4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCRN3Q0VDG4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCRN3Q0VDG4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCRN3Q0VDG4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCRN3Q0VDG4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCRN3Q0VDG4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCRN3Q0VDG4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCRN3Q0VDG4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCRN3Q0VDG4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCRN3Q0VDG4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCRN3Q0VDG4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCRN3Q0VDG4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCRN3Q0VDG4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCRN3Q0VDG4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCRN3Q0VDG4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCRN3Q0VDG4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCRN3Q0VDG4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCRN3Q0VDG4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCRN3Q0VDG4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCRN3Q0VDG4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCRN3Q0VDG4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCRN3Q0VDG4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCRN3Q0VDG4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCRN3Q0VDG4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCRN3Q0VDG4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCRN3Q0VDG4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCRN3Q0VDG4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCRN3Q0VDG4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCRN3Q0VDG4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCRN3Q0VDG4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCRN3Q0VDG4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCRN3Q0VDG4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SCRN3Q0VDG4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCRN3Q0VDG4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCRN3Q0VDG4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SCRN3Q0VDG4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCRN3Q0VDG4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCRN3Q0VDG4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCRN3Q0VDG4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SCRN3Q0VDG4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCRN3Q0VDG4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCRN3Q0VDG4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCRN3Q0VDG4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCRN3Q0VDG4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCRN3Q0VDG4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCRN3Q0VDG4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCRN3Q0VDG4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCRN3Q0VDG4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCRN3Q0VDG4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCRN3Q0VDG4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCRN3Q0VDG4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCRN3Q0VDG4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCRN3Q0VDG4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCRN3Q0VDG4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCRN3Q0VDG4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCRN3Q0VDG4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCRN3Q0VDG4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms