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Protein–RNA interactions for Protein: Q08904
RDR1, Protein RDR1, yeast
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546 aa
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
RDR1
Q08904
IMT3
tM(CAU)J3
72 nt
11.19
□□□□□ -0.62
RDR1
Q08904
IMT1
tM(CAU)O1
72 nt
11.19
□□□□□ -0.62
RDR1
Q08904
IMT2
tM(CAU)P
72 nt
11.19
□□□□□ -0.62
RDR1
Q08904
YLR281C
YLR281C
468 nt
11.18
□□□□□ -0.62
RDR1
Q08904
CAC2
YML102W
1407 nt
11.13
□□□□□ -0.63
RDR1
Q08904
WHI5
YOR083W
888 nt
11.13
□□□□□ -0.63
RDR1
Q08904
EMI2
YDR516C
1503 nt
11.13
□□□□□ -0.63
RDR1
Q08904
BDF1
YLR399C
2061 nt
11.12
□□□□□ -0.63
RDR1
Q08904
PUS2
YGL063W
1113 nt
11.1
□□□□□ -0.63
RDR1
Q08904
YLR154C-G
YLR154C-G
150 nt
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□□□□□ -0.64
RDR1
Q08904
ART5
YGR068C
1761 nt
11.04
□□□□□ -0.64
RDR1
Q08904
YDL221W
YDL221W
552 nt
11.04
□□□□□ -0.64
RDR1
Q08904
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YMR090W
684 nt
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□□□□□ -0.65
RDR1
Q08904
GFD2
YCL036W
1701 nt
11.01
□□□□□ -0.65
RDR1
Q08904
TIR4
YOR009W
1464 nt
11
□□□□□ -0.65
RDR1
Q08904
IMP2'
YIL154C
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□□□□□ -0.65
RDR1
Q08904
TAT1
YBR069C
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10.98
□□□□□ -0.65
RDR1
Q08904
IRC15
YPL017C
1500 nt
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□□□□□ -0.65
RDR1
Q08904
YBR220C
YBR220C
1683 nt
10.97
□□□□□ -0.65
RDR1
Q08904
PET9
YBL030C
957 nt
10.96
□□□□□ -0.65
RDR1
Q08904
YJL152W
YJL152W
360 nt
10.93
□□□□□ -0.66
RDR1
Q08904
DSK2
YMR276W
1122 nt
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RDR1
Q08904
SDH1
YKL148C
1923 nt
10.93
□□□□□ -0.66
RDR1
Q08904
YCH1
YGR203W
447 nt
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□□□□□ -0.66
RDR1
Q08904
PAC11
YDR488C
1602 nt
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□□□□□ -0.66
RDR1
Q08904
GIS3
YLR094C
1509 nt
10.89
□□□□□ -0.67
RDR1
Q08904
RTS2
YOR077W
699 nt
10.88
□□□□□ -0.67
RDR1
Q08904
YMR057C
YMR057C
372 nt
10.86
□□□□□ -0.67
RDR1
Q08904
SCC4
YER147C
1875 nt
10.85
□□□□□ -0.67
RDR1
Q08904
FMP45
YDL222C
930 nt
10.82
□□□□□ -0.68
RDR1
Q08904
IDH1
YNL037C
1083 nt
10.82
□□□□□ -0.68
RDR1
Q08904
YLR236C
YLR236C
324 nt
10.81
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RDR1
Q08904
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YPR011C
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10.79
□□□□□ -0.68
RDR1
Q08904
MOT3
YMR070W
1473 nt
10.79
□□□□□ -0.68
RDR1
Q08904
CUE1
YMR264W
612 nt
10.78
□□□□□ -0.68
RDR1
Q08904
FPS1
YLL043W
2010 nt
10.77
□□□□□ -0.68
RDR1
Q08904
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YCL048W-A
240 nt
10.71
□□□□□ -0.69
RDR1
Q08904
ERV46
YAL042W
1248 nt
10.68
□□□□□ -0.7
RDR1
Q08904
GBP2
YCL011C
1284 nt
10.68
□□□□□ -0.7
RDR1
Q08904
YJL225C
YJL225C
5277 nt
10.67
□□□□□ -0.7
RDR1
Q08904
YDR433W
YDR433W
441 nt
10.66
□□□□□ -0.7
RDR1
Q08904
LPX1
YOR084W
1164 nt
10.64
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RDR1
Q08904
YIL100W
YIL100W
354 nt
10.62
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RDR1
Q08904
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RDN37-1
5354 nt
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RDR1
Q08904
RDN37-2
RDN37-2
5354 nt
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RDR1
Q08904
YSC84
YHR016C
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RDR1
Q08904
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YKR040C
504 nt
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□□□□□ -0.71
RDR1
Q08904
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YHL050C
2094 nt
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□□□□□ -0.72
RDR1
Q08904
TCD2
YKL027W
1344 nt
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□□□□□ -0.72
RDR1
Q08904
SEC11
YIR022W
504 nt
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□□□□□ -0.72
RDR1
Q08904
RRT12
YCR045C
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□□□□□ -0.72
RDR1
Q08904
RRD1
YIL153W
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Q08904
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Q08904
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RDR1
Q08904
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YCL033C
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RDR1
Q08904
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YNL195C
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RDR1
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YPR091C
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Q08904
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YIL155C
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YJL063C
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Q08904
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Q08904
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RDR1
Q08904
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RDR1
Q08904
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RDR1
Q08904
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YCL042W
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RDR1
Q08904
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RDR1
Q08904
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RDR1
Q08904
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RDR1
Q08904
SOR1
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RDR1
Q08904
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YEL076C-A
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RDR1
Q08904
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RDR1
Q08904
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YLR464W
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10.32
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RDR1
Q08904
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YOL067C
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RDR1
Q08904
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RDR1
Q08904
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RDR1
Q08904
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RDR1
Q08904
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RDR1
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RDR1
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RDR1
Q08904
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YLR235C
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Q08904
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YKL030W
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RDR1
Q08904
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RDR1
Q08904
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YNR017W
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RDR1
Q08904
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YLL053C
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RDR1
Q08904
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YLR179C
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RDR1
Q08904
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Q08904
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YER145C
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RDR1
Q08904
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YLR213C
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9.98
□□□□□ -0.81
RDR1
Q08904
BOR1
YNL275W
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□□□□□ -0.81
RDR1
Q08904
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YDR094W
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9.95
□□□□□ -0.82
RDR1
Q08904
UBX6
YJL048C
1191 nt
9.95
□□□□□ -0.82
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