Protein–RNA interactions for Protein: Q08412

CUE5, Ubiquitin-binding protein CUE5, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CUE5Q08412 YOR139CYOR139C 393 nt12.52□□□□□ -0.41
CUE5Q08412 YOL037CYOL037C 354 nt12.5□□□□□ -0.41
CUE5Q08412 YBR220CYBR220C 1683 nt12.49□□□□□ -0.41
CUE5Q08412 GFD2YCL036W 1701 nt12.48□□□□□ -0.41
CUE5Q08412 NPL3YDR432W 1245 nt12.46□□□□□ -0.41
CUE5Q08412 BDF1YLR399C 2061 nt12.46□□□□□ -0.42
CUE5Q08412 IRC15YPL017C 1500 nt12.44□□□□□ -0.42
CUE5Q08412 SDH1YKL148C 1923 nt12.44□□□□□ -0.42
CUE5Q08412 TIR4YOR009W 1464 nt12.42□□□□□ -0.42
CUE5Q08412 PET9YBL030C 957 nt12.41□□□□□ -0.42
CUE5Q08412 RTS2YOR077W 699 nt12.4□□□□□ -0.42
CUE5Q08412 GIS3YLR094C 1509 nt12.37□□□□□ -0.43
CUE5Q08412 YJL152WYJL152W 360 nt12.35□□□□□ -0.43
CUE5Q08412 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.35□□□□□ -0.43
CUE5Q08412 SCC4YER147C 1875 nt12.35□□□□□ -0.43
CUE5Q08412 YCH1YGR203W 447 nt12.34□□□□□ -0.43
CUE5Q08412 YMR057CYMR057C 372 nt12.33□□□□□ -0.44
CUE5Q08412 TAT1YBR069C 1860 nt12.29□□□□□ -0.44
CUE5Q08412 WHI5YOR083W 888 nt12.26□□□□□ -0.45
CUE5Q08412 YLR281CYLR281C 468 nt12.24□□□□□ -0.45
CUE5Q08412 CUE1YMR264W 612 nt12.23□□□□□ -0.45
CUE5Q08412 FPS1YLL043W 2010 nt12.16□□□□□ -0.46
CUE5Q08412 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.15□□□□□ -0.46
CUE5Q08412 YIL100WYIL100W 354 nt12.1□□□□□ -0.47
CUE5Q08412 PUS2YGL063W 1113 nt12.08□□□□□ -0.48
CUE5Q08412 YSC84YHR016C 1407 nt12.08□□□□□ -0.48
CUE5Q08412 YLR236CYLR236C 324 nt12.07□□□□□ -0.48
CUE5Q08412 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.04□□□□□ -0.48
CUE5Q08412 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.04□□□□□ -0.48
CUE5Q08412 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.04□□□□□ -0.48
CUE5Q08412 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.04□□□□□ -0.48
CUE5Q08412 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.04□□□□□ -0.48
CUE5Q08412 SEC11YIR022W 504 nt12.04□□□□□ -0.48
CUE5Q08412 RRT12YCR045C 1476 nt12.02□□□□□ -0.48
CUE5Q08412 IDH1YNL037C 1083 nt12.02□□□□□ -0.49
CUE5Q08412 MOT3YMR070W 1473 nt12.02□□□□□ -0.49
CUE5Q08412 PCH2YBR186W 1695 nt12.01□□□□□ -0.49
CUE5Q08412 YHL050CYHL050C 2094 nt12.01□□□□□ -0.49
CUE5Q08412 YNL195CYNL195C 786 nt12□□□□□ -0.49
CUE5Q08412 GBP2YCL011C 1284 nt11.98□□□□□ -0.49
CUE5Q08412 DSK2YMR276W 1122 nt11.96□□□□□ -0.49
CUE5Q08412 GUT2YIL155C 1950 nt11.95□□□□□ -0.5
CUE5Q08412 IMP2'YIL154C 1041 nt11.94□□□□□ -0.5
CUE5Q08412 YPR011CYPR011C 981 nt11.92□□□□□ -0.5
CUE5Q08412 RRD1YIL153W 1182 nt11.89□□□□□ -0.51
CUE5Q08412 TCD2YKL027W 1344 nt11.86□□□□□ -0.51
CUE5Q08412 YDR433WYDR433W 441 nt11.85□□□□□ -0.51
CUE5Q08412 DED1YOR204W 1815 nt11.82□□□□□ -0.52
CUE5Q08412 MXR2YCL033C 507 nt11.8□□□□□ -0.52
CUE5Q08412 FMP45YDL222C 930 nt11.79□□□□□ -0.52
CUE5Q08412 LPX1YOR084W 1164 nt11.77□□□□□ -0.53
CUE5Q08412 PIB2YGL023C 1908 nt11.76□□□□□ -0.53
CUE5Q08412 RTF1YGL244W 1677 nt11.75□□□□□ -0.53
CUE5Q08412 FMT1YBL013W 1206 nt11.74□□□□□ -0.53
CUE5Q08412 FMP52YER004W 696 nt11.73□□□□□ -0.53
CUE5Q08412 ERV46YAL042W 1248 nt11.72□□□□□ -0.53
CUE5Q08412 PAC11YDR488C 1602 nt11.71□□□□□ -0.54
CUE5Q08412 BOP3YNL042W 1191 nt11.7□□□□□ -0.54
CUE5Q08412 YKR040CYKR040C 504 nt11.68□□□□□ -0.54
CUE5Q08412 CWP1YKL096W 720 nt11.67□□□□□ -0.54
CUE5Q08412 PCM1YEL058W 1674 nt11.67□□□□□ -0.54
CUE5Q08412 ADH2YMR303C 1047 nt11.66□□□□□ -0.54
CUE5Q08412 LCB1YMR296C 1677 nt11.62□□□□□ -0.55
CUE5Q08412 YCL042WYCL042W 360 nt11.62□□□□□ -0.55
CUE5Q08412 NCP1YHR042W 2076 nt11.62□□□□□ -0.55
CUE5Q08412 SNF6YHL025W 999 nt11.59□□□□□ -0.55
CUE5Q08412 SIM1YIL123W 1431 nt11.59□□□□□ -0.55
CUE5Q08412 SOR2YDL246C 1074 nt11.58□□□□□ -0.56
CUE5Q08412 SOR1YJR159W 1074 nt11.58□□□□□ -0.56
CUE5Q08412 FRD1YEL047C 1413 nt11.57□□□□□ -0.56
CUE5Q08412 PTK1YKL198C 1989 nt11.56□□□□□ -0.56
CUE5Q08412 BIO4YNR057C 714 nt11.49□□□□□ -0.57
CUE5Q08412 SPP1YPL138C 1062 nt11.47□□□□□ -0.57
CUE5Q08412 NVJ2YPR091C 2313 nt11.47□□□□□ -0.57
CUE5Q08412 YIH1YCR059C 777 nt11.42□□□□□ -0.58
CUE5Q08412 RNQ1YCL028W 1218 nt11.39□□□□□ -0.59
CUE5Q08412 YFL054CYFL054C 1941 nt11.39□□□□□ -0.59
CUE5Q08412 PTH1YHR189W 573 nt11.37□□□□□ -0.59
CUE5Q08412 YLL053CYLL053C 459 nt11.37□□□□□ -0.59
CUE5Q08412 LYS4YDR234W 2082 nt11.37□□□□□ -0.59
CUE5Q08412 DIC1YLR348C 897 nt11.36□□□□□ -0.59
CUE5Q08412 ERF2YLR246W 1080 nt11.31□□□□□ -0.6
CUE5Q08412 CRR1YLR213C 1269 nt11.28□□□□□ -0.6
CUE5Q08412 FTR1YER145C 1215 nt11.27□□□□□ -0.61
CUE5Q08412 YLR235CYLR235C 399 nt11.26□□□□□ -0.61
CUE5Q08412 ATF2YGR177C 1608 nt11.26□□□□□ -0.61
CUE5Q08412 YJL225CYJL225C 5277 nt11.26□□□□□ -0.61
CUE5Q08412 SPT8YLR055C 1809 nt11.25□□□□□ -0.61
CUE5Q08412 GAL1YBR020W 1587 nt11.24□□□□□ -0.61
CUE5Q08412 TRM5YHR070W 1500 nt11.23□□□□□ -0.61
CUE5Q08412 YFL067WYFL067W 528 nt11.2□□□□□ -0.62
CUE5Q08412 TIM23YNR017W 669 nt11.2□□□□□ -0.62
CUE5Q08412 HEM12YDR047W 1089 nt11.19□□□□□ -0.62
CUE5Q08412 MIC10YCL057C-A 294 nt11.19□□□□□ -0.62
CUE5Q08412 YLR179CYLR179C 606 nt11.18□□□□□ -0.62
CUE5Q08412 DDR2YOL052C-A 186 nt11.18□□□□□ -0.62
CUE5Q08412 YKL030WYKL030W 606 nt11.17□□□□□ -0.62
CUE5Q08412 SNG1YGR197C 1644 nt11.16□□□□□ -0.62
CUE5Q08412 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt11.13□□□□□ -0.63
CUE5Q08412 AQY1YPR192W 918 nt11.12□□□□□ -0.63
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