Protein–RNA interactions for Protein: Q06485

ATG33, Autophagy-related protein 33, yeastyeast

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG33Q06485 MET8YBR213W 825 nt9.6□□□□□ -0.87
ATG33Q06485 SUF2tP(AGG)C 72 nt9.59□□□□□ -0.87
ATG33Q06485 SUF10tP(AGG)N 72 nt9.59□□□□□ -0.87
ATG33Q06485 SIS1YNL007C 1059 nt9.59□□□□□ -0.87
ATG33Q06485 GIS3YLR094C 1509 nt9.59□□□□□ -0.87
ATG33Q06485 CCT6YDR188W 1641 nt9.58□□□□□ -0.88
ATG33Q06485 Q0010Q0010 387 nt9.56□□□□□ -0.88
ATG33Q06485 PST2YDR032C 597 nt9.55□□□□□ -0.88
ATG33Q06485 CLB6YGR109C 1143 nt9.55□□□□□ -0.88
ATG33Q06485 LSM3YLR438C-A 270 nt9.55□□□□□ -0.88
ATG33Q06485 WWM1YFL010C 636 nt9.54□□□□□ -0.88
ATG33Q06485 YSC84YHR016C 1407 nt9.53□□□□□ -0.88
ATG33Q06485 ART5YGR068C 1761 nt9.51□□□□□ -0.89
ATG33Q06485 RTS2YOR077W 699 nt9.5□□□□□ -0.89
ATG33Q06485 GFD2YCL036W 1701 nt9.49□□□□□ -0.89
ATG33Q06485 YJR154WYJR154W 1041 nt9.47□□□□□ -0.89
ATG33Q06485 YGR139WYGR139W 339 nt9.45□□□□□ -0.9
ATG33Q06485 PET9YBL030C 957 nt9.42□□□□□ -0.9
ATG33Q06485 YHL050CYHL050C 2094 nt9.41□□□□□ -0.9
ATG33Q06485 YGR021WYGR021W 873 nt9.41□□□□□ -0.9
ATG33Q06485 RTF1YGL244W 1677 nt9.4□□□□□ -0.9
ATG33Q06485 YNL195CYNL195C 786 nt9.4□□□□□ -0.9
ATG33Q06485 RRT12YCR045C 1476 nt9.4□□□□□ -0.91
ATG33Q06485 PIB2YGL023C 1908 nt9.39□□□□□ -0.91
ATG33Q06485 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt9.38□□□□□ -0.91
ATG33Q06485 CUE1YMR264W 612 nt9.37□□□□□ -0.91
ATG33Q06485 YCH1YGR203W 447 nt9.34□□□□□ -0.91
ATG33Q06485 BOP3YNL042W 1191 nt9.34□□□□□ -0.91
ATG33Q06485 UME6YDR207C 2511 nt9.33□□□□□ -0.92
ATG33Q06485 YIL100WYIL100W 354 nt9.32□□□□□ -0.92
ATG33Q06485 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt9.31□□□□□ -0.92
ATG33Q06485 YMR057CYMR057C 372 nt9.28□□□□□ -0.92
ATG33Q06485 TIR4YOR009W 1464 nt9.28□□□□□ -0.92
ATG33Q06485 SHU1YHL006C 453 nt9.25□□□□□ -0.93
ATG33Q06485 HOM6YJR139C 1080 nt9.25□□□□□ -0.93
ATG33Q06485 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt9.25□□□□□ -0.93
ATG33Q06485 PTK1YKL198C 1989 nt9.23□□□□□ -0.93
ATG33Q06485 YLR236CYLR236C 324 nt9.22□□□□□ -0.93
ATG33Q06485 BSP1YPR171W 1731 nt9.21□□□□□ -0.94
ATG33Q06485 MNP1YGL068W 585 nt9.16□□□□□ -0.94
ATG33Q06485 CSM2YIL132C 642 nt9.14□□□□□ -0.95
ATG33Q06485 RKM5YLR137W 1104 nt9.14□□□□□ -0.95
ATG33Q06485 YFL054CYFL054C 1941 nt9.12□□□□□ -0.95
ATG33Q06485 YJL152WYJL152W 360 nt9.12□□□□□ -0.95
ATG33Q06485 PAB1YER165W 1734 nt9.11□□□□□ -0.95
ATG33Q06485 YKL097CYKL097C 411 nt9.09□□□□□ -0.95
ATG33Q06485 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt9.09□□□□□ -0.95
ATG33Q06485 NCP1YHR042W 2076 nt9.08□□□□□ -0.96
ATG33Q06485 RSC4YKR008W 1878 nt9.06□□□□□ -0.96
ATG33Q06485 BOR1YNL275W 1731 nt9.06□□□□□ -0.96
ATG33Q06485 NPL3YDR432W 1245 nt9.02□□□□□ -0.97
ATG33Q06485 MAS1YLR163C 1389 nt9.01□□□□□ -0.97
ATG33Q06485 SPT8YLR055C 1809 nt9.01□□□□□ -0.97
ATG33Q06485 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt8.99□□□□□ -0.97
ATG33Q06485 LCB1YMR296C 1677 nt8.96□□□□□ -0.98
ATG33Q06485 YOL037CYOL037C 354 nt8.94□□□□□ -0.98
ATG33Q06485 RDN37-1RDN37-1 5354 nt8.92□□□□□ -0.98
ATG33Q06485 RDN37-2RDN37-2 5354 nt8.92□□□□□ -0.98
ATG33Q06485 SSN3YPL042C 1668 nt8.92□□□□□ -0.98
ATG33Q06485 YJL225CYJL225C 5277 nt8.91□□□□□ -0.98
ATG33Q06485 MCM5YLR274W 2328 nt8.88□□□□□ -0.99
ATG33Q06485 XDJ1YLR090W 1380 nt8.86□□□□□ -0.99
ATG33Q06485 SIM1YIL123W 1431 nt8.86□□□□□ -0.99
ATG33Q06485 SWE1YJL187C 2460 nt8.83□□□□□ -1
ATG33Q06485 HSP60YLR259C 1719 nt8.8□□□□□ -1
ATG33Q06485 YDR306CYDR306C 1437 nt8.8□□□□□ -1
ATG33Q06485 UBX6YJL048C 1191 nt8.78□□□□□ -1
ATG33Q06485 PCM1YEL058W 1674 nt8.78□□□□□ -1
ATG33Q06485 FMP52YER004W 696 nt8.77□□□□□ -1.01
ATG33Q06485 NAS6YGR232W 687 nt8.77□□□□□ -1.01
ATG33Q06485 RRD1YIL153W 1182 nt8.77□□□□□ -1.01
ATG33Q06485 IDH1YNL037C 1083 nt8.77□□□□□ -1.01
ATG33Q06485 WHI5YOR083W 888 nt8.76□□□□□ -1.01
ATG33Q06485 PUS7YOR243C 2031 nt8.76□□□□□ -1.01
ATG33Q06485 LYS4YDR234W 2082 nt8.76□□□□□ -1.01
ATG33Q06485 GBP2YCL011C 1284 nt8.75□□□□□ -1.01
ATG33Q06485 TCD2YKL027W 1344 nt8.72□□□□□ -1.01
ATG33Q06485 GLK1YCL040W 1503 nt8.71□□□□□ -1.01
ATG33Q06485 YPL041CYPL041C 624 nt8.71□□□□□ -1.02
ATG33Q06485 SNF6YHL025W 999 nt8.69□□□□□ -1.02
ATG33Q06485 YLR281CYLR281C 468 nt8.69□□□□□ -1.02
ATG33Q06485 BIO4YNR057C 714 nt8.69□□□□□ -1.02
ATG33Q06485 CWP1YKL096W 720 nt8.68□□□□□ -1.02
ATG33Q06485 PAU21YOR394W 495 nt8.67□□□□□ -1.02
ATG33Q06485 PAU22YPL282C 495 nt8.67□□□□□ -1.02
ATG33Q06485 DED1YOR204W 1815 nt8.66□□□□□ -1.02
ATG33Q06485 ALG12YNR030W 1656 nt8.66□□□□□ -1.02
ATG33Q06485 ADH2YMR303C 1047 nt8.66□□□□□ -1.02
ATG33Q06485 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt8.65□□□□□ -1.02
ATG33Q06485 IMP2'YIL154C 1041 nt8.65□□□□□ -1.02
ATG33Q06485 YOR139CYOR139C 393 nt8.65□□□□□ -1.02
ATG33Q06485 FMT1YBL013W 1206 nt8.64□□□□□ -1.03
ATG33Q06485 YNL115CYNL115C 1935 nt8.62□□□□□ -1.03
ATG33Q06485 FUR4YBR021W 1902 nt8.62□□□□□ -1.03
ATG33Q06485 ERF2YLR246W 1080 nt8.62□□□□□ -1.03
ATG33Q06485 COG1YGL223C 1254 nt8.61□□□□□ -1.03
ATG33Q06485 MCH5YOR306C 1566 nt8.61□□□□□ -1.03
ATG33Q06485 YDR433WYDR433W 441 nt8.57□□□□□ -1.04
ATG33Q06485 ARO7YPR060C 771 nt8.57□□□□□ -1.04
ATG33Q06485 PUS2YGL063W 1113 nt8.56□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.5 ms