Protein–RNA interactions for Protein: Q06410

ATG17, Autophagy-related protein 17, yeastyeast

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG17Q06410 YHL050CYHL050C 2094 nt11.75□□□□□ -0.53
ATG17Q06410 BOP3YNL042W 1191 nt11.73□□□□□ -0.53
ATG17Q06410 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.72□□□□□ -0.53
ATG17Q06410 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.72□□□□□ -0.53
ATG17Q06410 CCT6YDR188W 1641 nt11.71□□□□□ -0.53
ATG17Q06410 SRB2YHR041C 633 nt11.7□□□□□ -0.54
ATG17Q06410 GFD2YCL036W 1701 nt11.69□□□□□ -0.54
ATG17Q06410 RTS2YOR077W 699 nt11.65□□□□□ -0.54
ATG17Q06410 ART5YGR068C 1761 nt11.64□□□□□ -0.55
ATG17Q06410 RRT12YCR045C 1476 nt11.63□□□□□ -0.55
ATG17Q06410 PTK1YKL198C 1989 nt11.62□□□□□ -0.55
ATG17Q06410 YNL195CYNL195C 786 nt11.62□□□□□ -0.55
ATG17Q06410 LSM3YLR438C-A 270 nt11.6□□□□□ -0.55
ATG17Q06410 PET9YBL030C 957 nt11.58□□□□□ -0.56
ATG17Q06410 CUE1YMR264W 612 nt11.58□□□□□ -0.56
ATG17Q06410 BOR1YNL275W 1731 nt11.55□□□□□ -0.56
ATG17Q06410 YCH1YGR203W 447 nt11.47□□□□□ -0.57
ATG17Q06410 YIL100WYIL100W 354 nt11.47□□□□□ -0.57
ATG17Q06410 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11.46□□□□□ -0.57
ATG17Q06410 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11.46□□□□□ -0.57
ATG17Q06410 UME6YDR207C 2511 nt11.45□□□□□ -0.58
ATG17Q06410 WWM1YFL010C 636 nt11.44□□□□□ -0.58
ATG17Q06410 YFL054CYFL054C 1941 nt11.41□□□□□ -0.58
ATG17Q06410 NCP1YHR042W 2076 nt11.37□□□□□ -0.59
ATG17Q06410 PST2YDR032C 597 nt11.36□□□□□ -0.59
ATG17Q06410 SPT8YLR055C 1809 nt11.33□□□□□ -0.6
ATG17Q06410 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.31□□□□□ -0.6
ATG17Q06410 YLR236CYLR236C 324 nt11.31□□□□□ -0.6
ATG17Q06410 TIR4YOR009W 1464 nt11.31□□□□□ -0.6
ATG17Q06410 YMR057CYMR057C 372 nt11.29□□□□□ -0.6
ATG17Q06410 YGR021WYGR021W 873 nt11.18□□□□□ -0.62
ATG17Q06410 HSP60YLR259C 1719 nt11.15□□□□□ -0.63
ATG17Q06410 LCB1YMR296C 1677 nt11.1□□□□□ -0.63
ATG17Q06410 ALG12YNR030W 1656 nt11.1□□□□□ -0.63
ATG17Q06410 SWE1YJL187C 2460 nt11.09□□□□□ -0.63
ATG17Q06410 MCH5YOR306C 1566 nt11.09□□□□□ -0.63
ATG17Q06410 HOM6YJR139C 1080 nt11.06□□□□□ -0.64
ATG17Q06410 GLK1YCL040W 1503 nt11.01□□□□□ -0.65
ATG17Q06410 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.01□□□□□ -0.65
ATG17Q06410 SHU1YHL006C 453 nt10.94□□□□□ -0.66
ATG17Q06410 NPL3YDR432W 1245 nt10.92□□□□□ -0.66
ATG17Q06410 YJL152WYJL152W 360 nt10.92□□□□□ -0.66
ATG17Q06410 RKM5YLR137W 1104 nt10.9□□□□□ -0.66
ATG17Q06410 LYS4YDR234W 2082 nt10.86□□□□□ -0.67
ATG17Q06410 SIM1YIL123W 1431 nt10.86□□□□□ -0.67
ATG17Q06410 MNP1YGL068W 585 nt10.85□□□□□ -0.67
ATG17Q06410 DSK2YMR276W 1122 nt10.85□□□□□ -0.67
ATG17Q06410 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt10.83□□□□□ -0.68
ATG17Q06410 FUR4YBR021W 1902 nt10.82□□□□□ -0.68
ATG17Q06410 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt10.81□□□□□ -0.68
ATG17Q06410 BIO4YNR057C 714 nt10.81□□□□□ -0.68
ATG17Q06410 AAC1YMR056C 930 nt10.78□□□□□ -0.68
ATG17Q06410 NAR1YNL240C 1476 nt10.78□□□□□ -0.68
ATG17Q06410 PRP4YPR178W 1398 nt10.77□□□□□ -0.69
ATG17Q06410 FMP52YER004W 696 nt10.75□□□□□ -0.69
ATG17Q06410 YKL097CYKL097C 411 nt10.74□□□□□ -0.69
ATG17Q06410 PCM1YEL058W 1674 nt10.73□□□□□ -0.69
ATG17Q06410 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt10.73□□□□□ -0.69
ATG17Q06410 YEL076CYEL076C 651 nt10.73□□□□□ -0.69
ATG17Q06410 YLR464WYLR464W 651 nt10.73□□□□□ -0.69
ATG17Q06410 DPS1YLL018C 1674 nt10.69□□□□□ -0.7
ATG17Q06410 RRD1YIL153W 1182 nt10.68□□□□□ -0.7
ATG17Q06410 Q0182Q0182 405 nt10.67□□□□□ -0.7
ATG17Q06410 BMT6YLR063W 1098 nt10.65□□□□□ -0.7
ATG17Q06410 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.63□□□□□ -0.71
ATG17Q06410 ERF2YLR246W 1080 nt10.63□□□□□ -0.71
ATG17Q06410 CCA1YER168C 1641 nt10.59□□□□□ -0.71
ATG17Q06410 CRR1YLR213C 1269 nt10.59□□□□□ -0.71
ATG17Q06410 SNF6YHL025W 999 nt10.58□□□□□ -0.72
ATG17Q06410 RAX1YOR301W 1308 nt10.58□□□□□ -0.72
ATG17Q06410 BIO5YNR056C 1686 nt10.56□□□□□ -0.72
ATG17Q06410 CYT2YKL087C 675 nt10.55□□□□□ -0.72
ATG17Q06410 YKR005CYKR005C 1578 nt10.52□□□□□ -0.72
ATG17Q06410 ADH2YMR303C 1047 nt10.52□□□□□ -0.73
ATG17Q06410 CWP1YKL096W 720 nt10.51□□□□□ -0.73
ATG17Q06410 TCD2YKL027W 1344 nt10.51□□□□□ -0.73
ATG17Q06410 DED1YOR204W 1815 nt10.51□□□□□ -0.73
ATG17Q06410 HEM12YDR047W 1089 nt10.5□□□□□ -0.73
ATG17Q06410 GBP2YCL011C 1284 nt10.5□□□□□ -0.73
ATG17Q06410 PBP1YGR178C 2169 nt10.5□□□□□ -0.73
ATG17Q06410 SNF1YDR477W 1902 nt10.49□□□□□ -0.73
ATG17Q06410 FMT1YBL013W 1206 nt10.49□□□□□ -0.73
ATG17Q06410 IDH1YNL037C 1083 nt10.48□□□□□ -0.73
ATG17Q06410 YOL037CYOL037C 354 nt10.48□□□□□ -0.73
ATG17Q06410 CMP2YML057W 1815 nt10.47□□□□□ -0.73
ATG17Q06410 MIC10YCL057C-A 294 nt10.45□□□□□ -0.74
ATG17Q06410 WSC2YNL283C 1512 nt10.44□□□□□ -0.74
ATG17Q06410 RPM1RPM1 483 nt10.44□□□□□ -0.74
ATG17Q06410 IRC24YIR036C 792 nt10.43□□□□□ -0.74
ATG17Q06410 YGR259CYGR259C 441 nt10.41□□□□□ -0.74
ATG17Q06410 YIH1YCR059C 777 nt10.4□□□□□ -0.74
ATG17Q06410 SNG1YGR197C 1644 nt10.39□□□□□ -0.75
ATG17Q06410 YFL067WYFL067W 528 nt10.38□□□□□ -0.75
ATG17Q06410 YLL053CYLL053C 459 nt10.38□□□□□ -0.75
ATG17Q06410 ATF2YGR177C 1608 nt10.37□□□□□ -0.75
ATG17Q06410 YCL074WYCL074W 927 nt10.35□□□□□ -0.75
ATG17Q06410 YOR139CYOR139C 393 nt10.34□□□□□ -0.75
ATG17Q06410 RNQ1YCL028W 1218 nt10.33□□□□□ -0.76
ATG17Q06410 DUS1YML080W 1272 nt10.32□□□□□ -0.76
ATG17Q06410 WHI5YOR083W 888 nt10.32□□□□□ -0.76
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