Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHRNEQ04844 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHRNEQ04844 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHRNEQ04844 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHRNEQ04844 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHRNEQ04844 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHRNEQ04844 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHRNEQ04844 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHRNEQ04844 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHRNEQ04844 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHRNEQ04844 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHRNEQ04844 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHRNEQ04844 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHRNEQ04844 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHRNEQ04844 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHRNEQ04844 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHRNEQ04844 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHRNEQ04844 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHRNEQ04844 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHRNEQ04844 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHRNEQ04844 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHRNEQ04844 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHRNEQ04844 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHRNEQ04844 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CHRNEQ04844 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHRNEQ04844 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHRNEQ04844 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHRNEQ04844 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHRNEQ04844 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CHRNEQ04844 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHRNEQ04844 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHRNEQ04844 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHRNEQ04844 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHRNEQ04844 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHRNEQ04844 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHRNEQ04844 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHRNEQ04844 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHRNEQ04844 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHRNEQ04844 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CHRNEQ04844 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHRNEQ04844 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHRNEQ04844 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHRNEQ04844 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHRNEQ04844 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHRNEQ04844 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHRNEQ04844 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHRNEQ04844 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHRNEQ04844 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CHRNEQ04844 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CHRNEQ04844 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHRNEQ04844 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHRNEQ04844 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHRNEQ04844 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHRNEQ04844 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHRNEQ04844 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHRNEQ04844 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHRNEQ04844 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHRNEQ04844 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHRNEQ04844 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHRNEQ04844 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHRNEQ04844 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CHRNEQ04844 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHRNEQ04844 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHRNEQ04844 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHRNEQ04844 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHRNEQ04844 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHRNEQ04844 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHRNEQ04844 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHRNEQ04844 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHRNEQ04844 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHRNEQ04844 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHRNEQ04844 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHRNEQ04844 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHRNEQ04844 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHRNEQ04844 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHRNEQ04844 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHRNEQ04844 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHRNEQ04844 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHRNEQ04844 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHRNEQ04844 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHRNEQ04844 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHRNEQ04844 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHRNEQ04844 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHRNEQ04844 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHRNEQ04844 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHRNEQ04844 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHRNEQ04844 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHRNEQ04844 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHRNEQ04844 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHRNEQ04844 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHRNEQ04844 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHRNEQ04844 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHRNEQ04844 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHRNEQ04844 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHRNEQ04844 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CHRNEQ04844 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CHRNEQ04844 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHRNEQ04844 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHRNEQ04844 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHRNEQ04844 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms