Protein–RNA interactions for Protein: Q04511

UFO1, Ubiquitin ligase complex F-box protein UFO1, yeastyeast

Predictions only

Length 668 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UFO1Q04511 ART5YGR068C 1761 nt12.84□□□□□ -0.35
UFO1Q04511 YMR090WYMR090W 684 nt12.83□□□□□ -0.36
UFO1Q04511 GFD2YCL036W 1701 nt12.82□□□□□ -0.36
UFO1Q04511 TIR4YOR009W 1464 nt12.8□□□□□ -0.36
UFO1Q04511 YBR220CYBR220C 1683 nt12.79□□□□□ -0.36
UFO1Q04511 IRC15YPL017C 1500 nt12.78□□□□□ -0.36
UFO1Q04511 BDF1YLR399C 2061 nt12.74□□□□□ -0.37
UFO1Q04511 PET9YBL030C 957 nt12.74□□□□□ -0.37
UFO1Q04511 SDH1YKL148C 1923 nt12.74□□□□□ -0.37
UFO1Q04511 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.73□□□□□ -0.37
UFO1Q04511 RTS2YOR077W 699 nt12.72□□□□□ -0.37
UFO1Q04511 YCH1YGR203W 447 nt12.68□□□□□ -0.38
UFO1Q04511 GIS3YLR094C 1509 nt12.67□□□□□ -0.38
UFO1Q04511 YLR281CYLR281C 468 nt12.66□□□□□ -0.38
UFO1Q04511 WHI5YOR083W 888 nt12.66□□□□□ -0.38
UFO1Q04511 YJL152WYJL152W 360 nt12.65□□□□□ -0.38
UFO1Q04511 SCC4YER147C 1875 nt12.64□□□□□ -0.39
UFO1Q04511 YMR057CYMR057C 372 nt12.64□□□□□ -0.39
UFO1Q04511 TAT1YBR069C 1860 nt12.59□□□□□ -0.39
UFO1Q04511 CUE1YMR264W 612 nt12.55□□□□□ -0.4
UFO1Q04511 FPS1YLL043W 2010 nt12.53□□□□□ -0.4
UFO1Q04511 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.5□□□□□ -0.41
UFO1Q04511 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.5□□□□□ -0.41
UFO1Q04511 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.5□□□□□ -0.41
UFO1Q04511 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.5□□□□□ -0.41
UFO1Q04511 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.5□□□□□ -0.41
UFO1Q04511 PUS2YGL063W 1113 nt12.48□□□□□ -0.41
UFO1Q04511 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.45□□□□□ -0.42
UFO1Q04511 YLR236CYLR236C 324 nt12.4□□□□□ -0.42
UFO1Q04511 YIL100WYIL100W 354 nt12.38□□□□□ -0.43
UFO1Q04511 DSK2YMR276W 1122 nt12.38□□□□□ -0.43
UFO1Q04511 IDH1YNL037C 1083 nt12.38□□□□□ -0.43
UFO1Q04511 YSC84YHR016C 1407 nt12.37□□□□□ -0.43
UFO1Q04511 YPR011CYPR011C 981 nt12.36□□□□□ -0.43
UFO1Q04511 IMP2'YIL154C 1041 nt12.32□□□□□ -0.44
UFO1Q04511 GBP2YCL011C 1284 nt12.31□□□□□ -0.44
UFO1Q04511 YHL050CYHL050C 2094 nt12.31□□□□□ -0.44
UFO1Q04511 RRT12YCR045C 1476 nt12.3□□□□□ -0.44
UFO1Q04511 SEC11YIR022W 504 nt12.3□□□□□ -0.44
UFO1Q04511 PCH2YBR186W 1695 nt12.28□□□□□ -0.44
UFO1Q04511 RRD1YIL153W 1182 nt12.26□□□□□ -0.45
UFO1Q04511 YNL195CYNL195C 786 nt12.24□□□□□ -0.45
UFO1Q04511 GUT2YIL155C 1950 nt12.23□□□□□ -0.45
UFO1Q04511 DED1YOR204W 1815 nt12.21□□□□□ -0.46
UFO1Q04511 YDR433WYDR433W 441 nt12.2□□□□□ -0.46
UFO1Q04511 FMP45YDL222C 930 nt12.19□□□□□ -0.46
UFO1Q04511 TCD2YKL027W 1344 nt12.18□□□□□ -0.46
UFO1Q04511 LPX1YOR084W 1164 nt12.17□□□□□ -0.46
UFO1Q04511 MXR2YCL033C 507 nt12.17□□□□□ -0.46
UFO1Q04511 ERV46YAL042W 1248 nt12.15□□□□□ -0.46
UFO1Q04511 FMT1YBL013W 1206 nt12.11□□□□□ -0.47
UFO1Q04511 PIB2YGL023C 1908 nt12.07□□□□□ -0.48
UFO1Q04511 FMP52YER004W 696 nt12.07□□□□□ -0.48
UFO1Q04511 YKR040CYKR040C 504 nt12.05□□□□□ -0.48
UFO1Q04511 RTF1YGL244W 1677 nt12□□□□□ -0.49
UFO1Q04511 MOT3YMR070W 1473 nt12□□□□□ -0.49
UFO1Q04511 SOR2YDL246C 1074 nt11.99□□□□□ -0.49
UFO1Q04511 SOR1YJR159W 1074 nt11.99□□□□□ -0.49
UFO1Q04511 PCM1YEL058W 1674 nt11.98□□□□□ -0.49
UFO1Q04511 CWP1YKL096W 720 nt11.98□□□□□ -0.49
UFO1Q04511 ADH2YMR303C 1047 nt11.98□□□□□ -0.49
UFO1Q04511 FRD1YEL047C 1413 nt11.96□□□□□ -0.49
UFO1Q04511 LCB1YMR296C 1677 nt11.95□□□□□ -0.5
UFO1Q04511 BOP3YNL042W 1191 nt11.95□□□□□ -0.5
UFO1Q04511 NCP1YHR042W 2076 nt11.95□□□□□ -0.5
UFO1Q04511 YCL042WYCL042W 360 nt11.93□□□□□ -0.5
UFO1Q04511 SNF6YHL025W 999 nt11.89□□□□□ -0.51
UFO1Q04511 SPP1YPL138C 1062 nt11.89□□□□□ -0.51
UFO1Q04511 SIM1YIL123W 1431 nt11.86□□□□□ -0.51
UFO1Q04511 PTK1YKL198C 1989 nt11.84□□□□□ -0.51
UFO1Q04511 BIO4YNR057C 714 nt11.83□□□□□ -0.52
UFO1Q04511 YIH1YCR059C 777 nt11.77□□□□□ -0.53
UFO1Q04511 RNQ1YCL028W 1218 nt11.73□□□□□ -0.53
UFO1Q04511 PTH1YHR189W 573 nt11.72□□□□□ -0.53
UFO1Q04511 DIC1YLR348C 897 nt11.71□□□□□ -0.53
UFO1Q04511 YLL053CYLL053C 459 nt11.69□□□□□ -0.54
UFO1Q04511 LYS4YDR234W 2082 nt11.68□□□□□ -0.54
UFO1Q04511 Q0182Q0182 405 nt11.64□□□□□ -0.55
UFO1Q04511 PAC11YDR488C 1602 nt11.64□□□□□ -0.55
UFO1Q04511 CRR1YLR213C 1269 nt11.62□□□□□ -0.55
UFO1Q04511 YLR235CYLR235C 399 nt11.62□□□□□ -0.55
UFO1Q04511 ERF2YLR246W 1080 nt11.62□□□□□ -0.55
UFO1Q04511 YFL054CYFL054C 1941 nt11.61□□□□□ -0.55
UFO1Q04511 MRPL8YJL063C 717 nt11.61□□□□□ -0.55
UFO1Q04511 FTR1YER145C 1215 nt11.59□□□□□ -0.55
UFO1Q04511 NVJ2YPR091C 2313 nt11.58□□□□□ -0.56
UFO1Q04511 ATF2YGR177C 1608 nt11.57□□□□□ -0.56
UFO1Q04511 RTG1YOL067C 534 nt11.57□□□□□ -0.56
UFO1Q04511 GAL1YBR020W 1587 nt11.56□□□□□ -0.56
UFO1Q04511 TIM23YNR017W 669 nt11.55□□□□□ -0.56
UFO1Q04511 TRM5YHR070W 1500 nt11.54□□□□□ -0.56
UFO1Q04511 YKL030WYKL030W 606 nt11.53□□□□□ -0.56
UFO1Q04511 SPT8YLR055C 1809 nt11.51□□□□□ -0.57
UFO1Q04511 YLR179CYLR179C 606 nt11.51□□□□□ -0.57
UFO1Q04511 MIC10YCL057C-A 294 nt11.51□□□□□ -0.57
UFO1Q04511 YFL067WYFL067W 528 nt11.48□□□□□ -0.57
UFO1Q04511 SNG1YGR197C 1644 nt11.47□□□□□ -0.57
UFO1Q04511 HEM12YDR047W 1089 nt11.47□□□□□ -0.57
UFO1Q04511 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.47□□□□□ -0.57
UFO1Q04511 YEL076CYEL076C 651 nt11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.7 ms