Protein–RNA interactions for Protein: Q04311

VMS1, Protein VMS1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 632 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VMS1Q04311 MOT3YMR070W 1473 nt13.91□□□□□ -0.18
VMS1Q04311 TAT1YBR069C 1860 nt13.88□□□□□ -0.19
VMS1Q04311 IRC15YPL017C 1500 nt13.85□□□□□ -0.19
VMS1Q04311 YMR090WYMR090W 684 nt13.83□□□□□ -0.2
VMS1Q04311 SDH1YKL148C 1923 nt13.82□□□□□ -0.2
VMS1Q04311 ART5YGR068C 1761 nt13.81□□□□□ -0.2
VMS1Q04311 GFD2YCL036W 1701 nt13.8□□□□□ -0.2
VMS1Q04311 YOR139CYOR139C 393 nt13.72□□□□□ -0.21
VMS1Q04311 GIS3YLR094C 1509 nt13.7□□□□□ -0.22
VMS1Q04311 TIR4YOR009W 1464 nt13.7□□□□□ -0.22
VMS1Q04311 NPL3YDR432W 1245 nt13.68□□□□□ -0.22
VMS1Q04311 PET9YBL030C 957 nt13.68□□□□□ -0.22
VMS1Q04311 SCC4YER147C 1875 nt13.67□□□□□ -0.22
VMS1Q04311 YOL037CYOL037C 354 nt13.66□□□□□ -0.22
VMS1Q04311 RTS2YOR077W 699 nt13.6□□□□□ -0.23
VMS1Q04311 YCH1YGR203W 447 nt13.59□□□□□ -0.23
VMS1Q04311 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt13.53□□□□□ -0.24
VMS1Q04311 YMR057CYMR057C 372 nt13.52□□□□□ -0.25
VMS1Q04311 CUE1YMR264W 612 nt13.51□□□□□ -0.25
VMS1Q04311 FPS1YLL043W 2010 nt13.49□□□□□ -0.25
VMS1Q04311 YLR281CYLR281C 468 nt13.43□□□□□ -0.26
VMS1Q04311 PCH2YBR186W 1695 nt13.4□□□□□ -0.26
VMS1Q04311 YHL050CYHL050C 2094 nt13.4□□□□□ -0.27
VMS1Q04311 WHI5YOR083W 888 nt13.39□□□□□ -0.27
VMS1Q04311 YSC84YHR016C 1407 nt13.39□□□□□ -0.27
VMS1Q04311 YJL152WYJL152W 360 nt13.38□□□□□ -0.27
VMS1Q04311 SEC11YIR022W 504 nt13.37□□□□□ -0.27
VMS1Q04311 GUT2YIL155C 1950 nt13.37□□□□□ -0.27
VMS1Q04311 RRT12YCR045C 1476 nt13.31□□□□□ -0.28
VMS1Q04311 PIB2YGL023C 1908 nt13.31□□□□□ -0.28
VMS1Q04311 PAC11YDR488C 1602 nt13.26□□□□□ -0.29
VMS1Q04311 YIL100WYIL100W 354 nt13.23□□□□□ -0.29
VMS1Q04311 YLR236CYLR236C 324 nt13.23□□□□□ -0.29
VMS1Q04311 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt13.22□□□□□ -0.29
VMS1Q04311 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt13.2□□□□□ -0.3
VMS1Q04311 IMT4tM(CAU)E 72 nt13.2□□□□□ -0.3
VMS1Q04311 IMT3tM(CAU)J3 72 nt13.2□□□□□ -0.3
VMS1Q04311 IMT1tM(CAU)O1 72 nt13.2□□□□□ -0.3
VMS1Q04311 IMT2tM(CAU)P 72 nt13.2□□□□□ -0.3
VMS1Q04311 RRD1YIL153W 1182 nt13.14□□□□□ -0.31
VMS1Q04311 YPR011CYPR011C 981 nt13.14□□□□□ -0.31
VMS1Q04311 PUS2YGL063W 1113 nt13.13□□□□□ -0.31
VMS1Q04311 DED1YOR204W 1815 nt13.11□□□□□ -0.31
VMS1Q04311 NVJ2YPR091C 2313 nt13.1□□□□□ -0.31
VMS1Q04311 YNL195CYNL195C 786 nt13.1□□□□□ -0.31
VMS1Q04311 IDH1YNL037C 1083 nt13.09□□□□□ -0.31
VMS1Q04311 NCP1YHR042W 2076 nt13.09□□□□□ -0.31
VMS1Q04311 DSK2YMR276W 1122 nt13.07□□□□□ -0.32
VMS1Q04311 RTF1YGL244W 1677 nt13.06□□□□□ -0.32
VMS1Q04311 GBP2YCL011C 1284 nt13.06□□□□□ -0.32
VMS1Q04311 IMP2'YIL154C 1041 nt13.05□□□□□ -0.32
VMS1Q04311 FMT1YBL013W 1206 nt13□□□□□ -0.33
VMS1Q04311 PTK1YKL198C 1989 nt12.98□□□□□ -0.33
VMS1Q04311 BOP3YNL042W 1191 nt12.97□□□□□ -0.33
VMS1Q04311 FMP45YDL222C 930 nt12.96□□□□□ -0.33
VMS1Q04311 TCD2YKL027W 1344 nt12.94□□□□□ -0.34
VMS1Q04311 FMP52YER004W 696 nt12.94□□□□□ -0.34
VMS1Q04311 LCB1YMR296C 1677 nt12.93□□□□□ -0.34
VMS1Q04311 ERV46YAL042W 1248 nt12.91□□□□□ -0.34
VMS1Q04311 MXR2YCL033C 507 nt12.91□□□□□ -0.34
VMS1Q04311 LPX1YOR084W 1164 nt12.88□□□□□ -0.35
VMS1Q04311 YDR433WYDR433W 441 nt12.87□□□□□ -0.35
VMS1Q04311 PCM1YEL058W 1674 nt12.86□□□□□ -0.35
VMS1Q04311 SOR2YDL246C 1074 nt12.82□□□□□ -0.36
VMS1Q04311 SOR1YJR159W 1074 nt12.82□□□□□ -0.36
VMS1Q04311 ADH2YMR303C 1047 nt12.81□□□□□ -0.36
VMS1Q04311 YKR040CYKR040C 504 nt12.79□□□□□ -0.36
VMS1Q04311 FRD1YEL047C 1413 nt12.77□□□□□ -0.37
VMS1Q04311 CWP1YKL096W 720 nt12.76□□□□□ -0.37
VMS1Q04311 LYS4YDR234W 2082 nt12.73□□□□□ -0.37
VMS1Q04311 BIO4YNR057C 714 nt12.7□□□□□ -0.38
VMS1Q04311 SIM1YIL123W 1431 nt12.7□□□□□ -0.38
VMS1Q04311 SNF6YHL025W 999 nt12.68□□□□□ -0.38
VMS1Q04311 YIH1YCR059C 777 nt12.63□□□□□ -0.39
VMS1Q04311 YCL042WYCL042W 360 nt12.63□□□□□ -0.39
VMS1Q04311 YFL054CYFL054C 1941 nt12.58□□□□□ -0.39
VMS1Q04311 SPT8YLR055C 1809 nt12.57□□□□□ -0.4
VMS1Q04311 SPP1YPL138C 1062 nt12.56□□□□□ -0.4
VMS1Q04311 RNQ1YCL028W 1218 nt12.56□□□□□ -0.4
VMS1Q04311 YLL053CYLL053C 459 nt12.52□□□□□ -0.41
VMS1Q04311 CRR1YLR213C 1269 nt12.5□□□□□ -0.41
VMS1Q04311 ERF2YLR246W 1080 nt12.47□□□□□ -0.41
VMS1Q04311 DIC1YLR348C 897 nt12.45□□□□□ -0.42
VMS1Q04311 ATF2YGR177C 1608 nt12.44□□□□□ -0.42
VMS1Q04311 FTR1YER145C 1215 nt12.42□□□□□ -0.42
VMS1Q04311 YJL225CYJL225C 5277 nt12.4□□□□□ -0.42
VMS1Q04311 MIC10YCL057C-A 294 nt12.38□□□□□ -0.43
VMS1Q04311 SWE1YJL187C 2460 nt12.38□□□□□ -0.43
VMS1Q04311 GAL1YBR020W 1587 nt12.38□□□□□ -0.43
VMS1Q04311 PTH1YHR189W 573 nt12.37□□□□□ -0.43
VMS1Q04311 TRM5YHR070W 1500 nt12.35□□□□□ -0.43
VMS1Q04311 SNG1YGR197C 1644 nt12.33□□□□□ -0.43
VMS1Q04311 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt12.32□□□□□ -0.44
VMS1Q04311 HEM12YDR047W 1089 nt12.3□□□□□ -0.44
VMS1Q04311 YFL067WYFL067W 528 nt12.3□□□□□ -0.44
VMS1Q04311 YLR235CYLR235C 399 nt12.3□□□□□ -0.44
VMS1Q04311 TIM23YNR017W 669 nt12.26□□□□□ -0.45
VMS1Q04311 ANP1YEL036C 1503 nt12.25□□□□□ -0.45
VMS1Q04311 RTG1YOL067C 534 nt12.24□□□□□ -0.45
VMS1Q04311 WSC2YNL283C 1512 nt12.23□□□□□ -0.45
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