Protein–RNA interactions for Protein: Q03761

TAF12, Transcription initiation factor TFIID subunit 12, yeastyeast

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TAF12Q03761 NPL3YDR432W 1245 nt12.2□□□□□ -0.46
TAF12Q03761 BDF1YLR399C 2061 nt12.14□□□□□ -0.47
TAF12Q03761 YDL221WYDL221W 552 nt12.14□□□□□ -0.47
TAF12Q03761 ART5YGR068C 1761 nt12.11□□□□□ -0.47
TAF12Q03761 GFD2YCL036W 1701 nt12.1□□□□□ -0.47
TAF12Q03761 YMR090WYMR090W 684 nt12.09□□□□□ -0.47
TAF12Q03761 TIR4YOR009W 1464 nt12.08□□□□□ -0.48
TAF12Q03761 YBR220CYBR220C 1683 nt12.06□□□□□ -0.48
TAF12Q03761 IRC15YPL017C 1500 nt12.06□□□□□ -0.48
TAF12Q03761 PET9YBL030C 957 nt12.05□□□□□ -0.48
TAF12Q03761 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.04□□□□□ -0.48
TAF12Q03761 SDH1YKL148C 1923 nt12.02□□□□□ -0.49
TAF12Q03761 YLR281CYLR281C 468 nt12.02□□□□□ -0.49
TAF12Q03761 FPS1YLL043W 2010 nt12.02□□□□□ -0.49
TAF12Q03761 YCH1YGR203W 447 nt12.01□□□□□ -0.49
TAF12Q03761 WHI5YOR083W 888 nt11.98□□□□□ -0.49
TAF12Q03761 GIS3YLR094C 1509 nt11.95□□□□□ -0.5
TAF12Q03761 TAT1YBR069C 1860 nt11.92□□□□□ -0.5
TAF12Q03761 RTS2YOR077W 699 nt11.92□□□□□ -0.5
TAF12Q03761 SCC4YER147C 1875 nt11.91□□□□□ -0.5
TAF12Q03761 YMR057CYMR057C 372 nt11.91□□□□□ -0.5
TAF12Q03761 YJL152WYJL152W 360 nt11.9□□□□□ -0.5
TAF12Q03761 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.88□□□□□ -0.51
TAF12Q03761 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.88□□□□□ -0.51
TAF12Q03761 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.88□□□□□ -0.51
TAF12Q03761 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.88□□□□□ -0.51
TAF12Q03761 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.88□□□□□ -0.51
TAF12Q03761 CUE1YMR264W 612 nt11.85□□□□□ -0.51
TAF12Q03761 PUS2YGL063W 1113 nt11.81□□□□□ -0.52
TAF12Q03761 IMP2'YIL154C 1041 nt11.73□□□□□ -0.53
TAF12Q03761 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.73□□□□□ -0.53
TAF12Q03761 DSK2YMR276W 1122 nt11.72□□□□□ -0.53
TAF12Q03761 YLR236CYLR236C 324 nt11.71□□□□□ -0.53
TAF12Q03761 YPR011CYPR011C 981 nt11.71□□□□□ -0.53
TAF12Q03761 IDH1YNL037C 1083 nt11.69□□□□□ -0.54
TAF12Q03761 YIL100WYIL100W 354 nt11.64□□□□□ -0.55
TAF12Q03761 YSC84YHR016C 1407 nt11.63□□□□□ -0.55
TAF12Q03761 SEC11YIR022W 504 nt11.62□□□□□ -0.55
TAF12Q03761 YHL050CYHL050C 2094 nt11.62□□□□□ -0.55
TAF12Q03761 GBP2YCL011C 1284 nt11.61□□□□□ -0.55
TAF12Q03761 RRD1YIL153W 1182 nt11.59□□□□□ -0.55
TAF12Q03761 PCH2YBR186W 1695 nt11.58□□□□□ -0.56
TAF12Q03761 RRT12YCR045C 1476 nt11.57□□□□□ -0.56
TAF12Q03761 DED1YOR204W 1815 nt11.56□□□□□ -0.56
TAF12Q03761 FMP45YDL222C 930 nt11.55□□□□□ -0.56
TAF12Q03761 ERV46YAL042W 1248 nt11.54□□□□□ -0.56
TAF12Q03761 GUT2YIL155C 1950 nt11.54□□□□□ -0.56
TAF12Q03761 YNL195CYNL195C 786 nt11.51□□□□□ -0.57
TAF12Q03761 TCD2YKL027W 1344 nt11.51□□□□□ -0.57
TAF12Q03761 LPX1YOR084W 1164 nt11.5□□□□□ -0.57
TAF12Q03761 YDR433WYDR433W 441 nt11.49□□□□□ -0.57
TAF12Q03761 MXR2YCL033C 507 nt11.47□□□□□ -0.57
TAF12Q03761 FMT1YBL013W 1206 nt11.46□□□□□ -0.57
TAF12Q03761 FMP52YER004W 696 nt11.44□□□□□ -0.58
TAF12Q03761 PIB2YGL023C 1908 nt11.43□□□□□ -0.58
TAF12Q03761 YKR040CYKR040C 504 nt11.43□□□□□ -0.58
TAF12Q03761 UME6YDR207C 2511 nt11.4□□□□□ -0.58
TAF12Q03761 SOR2YDL246C 1074 nt11.37□□□□□ -0.59
TAF12Q03761 SOR1YJR159W 1074 nt11.37□□□□□ -0.59
TAF12Q03761 Q0182Q0182 405 nt11.35□□□□□ -0.59
TAF12Q03761 FRD1YEL047C 1413 nt11.33□□□□□ -0.6
TAF12Q03761 NCP1YHR042W 2076 nt11.32□□□□□ -0.6
TAF12Q03761 MOT3YMR070W 1473 nt11.32□□□□□ -0.6
TAF12Q03761 PCM1YEL058W 1674 nt11.32□□□□□ -0.6
TAF12Q03761 RTF1YGL244W 1677 nt11.31□□□□□ -0.6
TAF12Q03761 ADH2YMR303C 1047 nt11.3□□□□□ -0.6
TAF12Q03761 CWP1YKL096W 720 nt11.28□□□□□ -0.6
TAF12Q03761 LCB1YMR296C 1677 nt11.27□□□□□ -0.6
TAF12Q03761 BOP3YNL042W 1191 nt11.27□□□□□ -0.61
TAF12Q03761 YCL042WYCL042W 360 nt11.26□□□□□ -0.61
TAF12Q03761 SPP1YPL138C 1062 nt11.23□□□□□ -0.61
TAF12Q03761 SNF6YHL025W 999 nt11.21□□□□□ -0.61
TAF12Q03761 PTK1YKL198C 1989 nt11.19□□□□□ -0.62
TAF12Q03761 BIO4YNR057C 714 nt11.16□□□□□ -0.62
TAF12Q03761 SIM1YIL123W 1431 nt11.16□□□□□ -0.62
TAF12Q03761 YIH1YCR059C 777 nt11.15□□□□□ -0.62
TAF12Q03761 RNQ1YCL028W 1218 nt11.11□□□□□ -0.63
TAF12Q03761 LYS4YDR234W 2082 nt11.07□□□□□ -0.64
TAF12Q03761 DIC1YLR348C 897 nt11.05□□□□□ -0.64
TAF12Q03761 YLL053CYLL053C 459 nt11.04□□□□□ -0.64
TAF12Q03761 PTH1YHR189W 573 nt11.03□□□□□ -0.64
TAF12Q03761 YLR235CYLR235C 399 nt11.01□□□□□ -0.65
TAF12Q03761 RTG1YOL067C 534 nt11.01□□□□□ -0.65
TAF12Q03761 YJL225CYJL225C 5277 nt10.99□□□□□ -0.65
TAF12Q03761 CRR1YLR213C 1269 nt10.98□□□□□ -0.65
TAF12Q03761 ERF2YLR246W 1080 nt10.98□□□□□ -0.65
TAF12Q03761 FTR1YER145C 1215 nt10.96□□□□□ -0.65
TAF12Q03761 ATF2YGR177C 1608 nt10.93□□□□□ -0.66
TAF12Q03761 GAL1YBR020W 1587 nt10.92□□□□□ -0.66
TAF12Q03761 YKL030WYKL030W 606 nt10.92□□□□□ -0.66
TAF12Q03761 TIM23YNR017W 669 nt10.92□□□□□ -0.66
TAF12Q03761 YFL054CYFL054C 1941 nt10.92□□□□□ -0.66
TAF12Q03761 TRM5YHR070W 1500 nt10.89□□□□□ -0.67
TAF12Q03761 SPT8YLR055C 1809 nt10.86□□□□□ -0.67
TAF12Q03761 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt10.86□□□□□ -0.67
TAF12Q03761 YEL076CYEL076C 651 nt10.86□□□□□ -0.67
TAF12Q03761 YFL067WYFL067W 528 nt10.86□□□□□ -0.67
TAF12Q03761 MRPL8YJL063C 717 nt10.86□□□□□ -0.67
TAF12Q03761 YLR179CYLR179C 606 nt10.86□□□□□ -0.67
TAF12Q03761 YLR464WYLR464W 651 nt10.86□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.2 ms