Protein–RNA interactions for Protein: Q01064

PDE1B, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1BQ01064 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDE1BQ01064 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PDE1BQ01064 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PDE1BQ01064 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PDE1BQ01064 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PDE1BQ01064 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PDE1BQ01064 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
PDE1BQ01064 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PDE1BQ01064 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PDE1BQ01064 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PDE1BQ01064 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PDE1BQ01064 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDE1BQ01064 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDE1BQ01064 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PDE1BQ01064 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PDE1BQ01064 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PDE1BQ01064 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PDE1BQ01064 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PDE1BQ01064 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PDE1BQ01064 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PDE1BQ01064 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PDE1BQ01064 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PDE1BQ01064 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PDE1BQ01064 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PDE1BQ01064 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PDE1BQ01064 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PDE1BQ01064 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PDE1BQ01064 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PDE1BQ01064 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PDE1BQ01064 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PDE1BQ01064 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PDE1BQ01064 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PDE1BQ01064 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDE1BQ01064 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDE1BQ01064 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PDE1BQ01064 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PDE1BQ01064 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDE1BQ01064 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDE1BQ01064 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PDE1BQ01064 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PDE1BQ01064 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDE1BQ01064 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDE1BQ01064 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDE1BQ01064 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PDE1BQ01064 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PDE1BQ01064 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PDE1BQ01064 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PDE1BQ01064 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PDE1BQ01064 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PDE1BQ01064 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PDE1BQ01064 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PDE1BQ01064 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PDE1BQ01064 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PDE1BQ01064 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDE1BQ01064 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDE1BQ01064 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDE1BQ01064 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDE1BQ01064 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PDE1BQ01064 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PDE1BQ01064 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PDE1BQ01064 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PDE1BQ01064 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PDE1BQ01064 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PDE1BQ01064 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDE1BQ01064 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDE1BQ01064 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDE1BQ01064 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDE1BQ01064 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDE1BQ01064 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDE1BQ01064 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDE1BQ01064 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PDE1BQ01064 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDE1BQ01064 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDE1BQ01064 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PDE1BQ01064 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDE1BQ01064 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDE1BQ01064 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDE1BQ01064 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDE1BQ01064 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDE1BQ01064 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDE1BQ01064 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDE1BQ01064 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDE1BQ01064 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PDE1BQ01064 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDE1BQ01064 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDE1BQ01064 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDE1BQ01064 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDE1BQ01064 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDE1BQ01064 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PDE1BQ01064 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDE1BQ01064 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDE1BQ01064 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDE1BQ01064 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDE1BQ01064 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDE1BQ01064 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDE1BQ01064 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDE1BQ01064 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDE1BQ01064 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDE1BQ01064 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDE1BQ01064 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms