Protein–RNA interactions for Protein: P82912

MRPS11, 28S ribosomal protein S11, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS11P82912 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MRPS11P82912 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MRPS11P82912 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MRPS11P82912 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRPS11P82912 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MRPS11P82912 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MRPS11P82912 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MRPS11P82912 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MRPS11P82912 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MRPS11P82912 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MRPS11P82912 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPS11P82912 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPS11P82912 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRPS11P82912 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRPS11P82912 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPS11P82912 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPS11P82912 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRPS11P82912 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRPS11P82912 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRPS11P82912 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRPS11P82912 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MRPS11P82912 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPS11P82912 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPS11P82912 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRPS11P82912 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPS11P82912 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRPS11P82912 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRPS11P82912 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRPS11P82912 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRPS11P82912 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRPS11P82912 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRPS11P82912 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRPS11P82912 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRPS11P82912 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MRPS11P82912 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
MRPS11P82912 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MRPS11P82912 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPS11P82912 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPS11P82912 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPS11P82912 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPS11P82912 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPS11P82912 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRPS11P82912 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRPS11P82912 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRPS11P82912 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRPS11P82912 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRPS11P82912 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MRPS11P82912 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRPS11P82912 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPS11P82912 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPS11P82912 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRPS11P82912 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
MRPS11P82912 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPS11P82912 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRPS11P82912 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MRPS11P82912 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRPS11P82912 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRPS11P82912 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MRPS11P82912 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MRPS11P82912 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MRPS11P82912 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MRPS11P82912 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MRPS11P82912 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MRPS11P82912 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MRPS11P82912 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MRPS11P82912 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MRPS11P82912 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MRPS11P82912 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MRPS11P82912 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MRPS11P82912 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRPS11P82912 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRPS11P82912 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRPS11P82912 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MRPS11P82912 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MRPS11P82912 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MRPS11P82912 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MRPS11P82912 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRPS11P82912 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MRPS11P82912 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MRPS11P82912 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MRPS11P82912 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MRPS11P82912 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MRPS11P82912 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MRPS11P82912 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MRPS11P82912 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MRPS11P82912 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MRPS11P82912 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRPS11P82912 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MRPS11P82912 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MRPS11P82912 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MRPS11P82912 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRPS11P82912 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRPS11P82912 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MRPS11P82912 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MRPS11P82912 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MRPS11P82912 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MRPS11P82912 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MRPS11P82912 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MRPS11P82912 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MRPS11P82912 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms