Protein–RNA interactions for Protein: P80217

IFI35, Interferon-induced 35 kDa protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI35P80217 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
IFI35P80217 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
IFI35P80217 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
IFI35P80217 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
IFI35P80217 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
IFI35P80217 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
IFI35P80217 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
IFI35P80217 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
IFI35P80217 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
IFI35P80217 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
IFI35P80217 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
IFI35P80217 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
IFI35P80217 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
IFI35P80217 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
IFI35P80217 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
IFI35P80217 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
IFI35P80217 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
IFI35P80217 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
IFI35P80217 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
IFI35P80217 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
IFI35P80217 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
IFI35P80217 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
IFI35P80217 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
IFI35P80217 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
IFI35P80217 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
IFI35P80217 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
IFI35P80217 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
IFI35P80217 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
IFI35P80217 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
IFI35P80217 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
IFI35P80217 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
IFI35P80217 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
IFI35P80217 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
IFI35P80217 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
IFI35P80217 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
IFI35P80217 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
IFI35P80217 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
IFI35P80217 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
IFI35P80217 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
IFI35P80217 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
IFI35P80217 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
IFI35P80217 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
IFI35P80217 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
IFI35P80217 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
IFI35P80217 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
IFI35P80217 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
IFI35P80217 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
IFI35P80217 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
IFI35P80217 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
IFI35P80217 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
IFI35P80217 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
IFI35P80217 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
IFI35P80217 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
IFI35P80217 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
IFI35P80217 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
IFI35P80217 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
IFI35P80217 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
IFI35P80217 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
IFI35P80217 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
IFI35P80217 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
IFI35P80217 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
IFI35P80217 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
IFI35P80217 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
IFI35P80217 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
IFI35P80217 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
IFI35P80217 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
IFI35P80217 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
IFI35P80217 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
IFI35P80217 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
IFI35P80217 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
IFI35P80217 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
IFI35P80217 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
IFI35P80217 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
IFI35P80217 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
IFI35P80217 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
IFI35P80217 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
IFI35P80217 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
IFI35P80217 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
IFI35P80217 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
IFI35P80217 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
IFI35P80217 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
IFI35P80217 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
IFI35P80217 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
IFI35P80217 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
IFI35P80217 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
IFI35P80217 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
IFI35P80217 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
IFI35P80217 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
IFI35P80217 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
IFI35P80217 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
IFI35P80217 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
IFI35P80217 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
IFI35P80217 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
IFI35P80217 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
IFI35P80217 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
IFI35P80217 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
IFI35P80217 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
IFI35P80217 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
IFI35P80217 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
IFI35P80217 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms