Protein–RNA interactions for Protein: P67809

YBX1, Nuclease-sensitive element-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX1P67809 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
YBX1P67809 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
YBX1P67809 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
YBX1P67809 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
YBX1P67809 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
YBX1P67809 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
YBX1P67809 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
YBX1P67809 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
YBX1P67809 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
YBX1P67809 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
YBX1P67809 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
YBX1P67809 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
YBX1P67809 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
YBX1P67809 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
YBX1P67809 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
YBX1P67809 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
YBX1P67809 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
YBX1P67809 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
YBX1P67809 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
YBX1P67809 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
YBX1P67809 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
YBX1P67809 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
YBX1P67809 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
YBX1P67809 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
YBX1P67809 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
YBX1P67809 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
YBX1P67809 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
YBX1P67809 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
YBX1P67809 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
YBX1P67809 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
YBX1P67809 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
YBX1P67809 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
YBX1P67809 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
YBX1P67809 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
YBX1P67809 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
YBX1P67809 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
YBX1P67809 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
YBX1P67809 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
YBX1P67809 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
YBX1P67809 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
YBX1P67809 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
YBX1P67809 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
YBX1P67809 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
YBX1P67809 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
YBX1P67809 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
YBX1P67809 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
YBX1P67809 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
YBX1P67809 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
YBX1P67809 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
YBX1P67809 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
YBX1P67809 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
YBX1P67809 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
YBX1P67809 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
YBX1P67809 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
YBX1P67809 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
YBX1P67809 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
YBX1P67809 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
YBX1P67809 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
YBX1P67809 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
YBX1P67809 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
YBX1P67809 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
YBX1P67809 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
YBX1P67809 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
YBX1P67809 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
YBX1P67809 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
YBX1P67809 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
YBX1P67809 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
YBX1P67809 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
YBX1P67809 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
YBX1P67809 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
YBX1P67809 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
YBX1P67809 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
YBX1P67809 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
YBX1P67809 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
YBX1P67809 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
YBX1P67809 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
YBX1P67809 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
YBX1P67809 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
YBX1P67809 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
YBX1P67809 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
YBX1P67809 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
YBX1P67809 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
YBX1P67809 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
YBX1P67809 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
YBX1P67809 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
YBX1P67809 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
YBX1P67809 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
YBX1P67809 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
YBX1P67809 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
YBX1P67809 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
YBX1P67809 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
YBX1P67809 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
YBX1P67809 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
YBX1P67809 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
YBX1P67809 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
YBX1P67809 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
YBX1P67809 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
YBX1P67809 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
YBX1P67809 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
YBX1P67809 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 561.7 ms