Protein–RNA interactions for Protein: P62913

RPL11, 60S ribosomal protein L11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL11P62913 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL11P62913 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL11P62913 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL11P62913 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL11P62913 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL11P62913 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL11P62913 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL11P62913 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL11P62913 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL11P62913 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL11P62913 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL11P62913 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL11P62913 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL11P62913 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPL11P62913 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPL11P62913 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPL11P62913 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL11P62913 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPL11P62913 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPL11P62913 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPL11P62913 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL11P62913 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL11P62913 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL11P62913 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPL11P62913 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RPL11P62913 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPL11P62913 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPL11P62913 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL11P62913 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPL11P62913 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL11P62913 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL11P62913 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPL11P62913 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPL11P62913 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPL11P62913 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPL11P62913 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL11P62913 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPL11P62913 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPL11P62913 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPL11P62913 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPL11P62913 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL11P62913 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL11P62913 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL11P62913 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPL11P62913 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPL11P62913 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPL11P62913 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPL11P62913 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPL11P62913 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPL11P62913 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL11P62913 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL11P62913 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPL11P62913 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPL11P62913 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL11P62913 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL11P62913 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL11P62913 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPL11P62913 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL11P62913 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL11P62913 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL11P62913 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL11P62913 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL11P62913 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL11P62913 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL11P62913 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPL11P62913 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL11P62913 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL11P62913 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL11P62913 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL11P62913 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL11P62913 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL11P62913 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL11P62913 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL11P62913 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL11P62913 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL11P62913 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL11P62913 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL11P62913 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPL11P62913 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL11P62913 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL11P62913 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL11P62913 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPL11P62913 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPL11P62913 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPL11P62913 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPL11P62913 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RPL11P62913 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RPL11P62913 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RPL11P62913 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RPL11P62913 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RPL11P62913 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL11P62913 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL11P62913 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RPL11P62913 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RPL11P62913 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPL11P62913 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RPL11P62913 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RPL11P62913 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL11P62913 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL11P62913 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms