Protein–RNA interactions for Protein: P61086

UBE2K, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2KP61086 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE2KP61086 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
UBE2KP61086 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE2KP61086 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE2KP61086 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE2KP61086 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE2KP61086 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE2KP61086 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE2KP61086 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE2KP61086 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE2KP61086 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE2KP61086 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE2KP61086 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE2KP61086 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE2KP61086 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE2KP61086 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE2KP61086 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE2KP61086 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE2KP61086 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE2KP61086 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE2KP61086 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE2KP61086 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE2KP61086 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE2KP61086 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE2KP61086 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE2KP61086 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE2KP61086 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE2KP61086 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE2KP61086 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
UBE2KP61086 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE2KP61086 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE2KP61086 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE2KP61086 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE2KP61086 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE2KP61086 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE2KP61086 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE2KP61086 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE2KP61086 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2KP61086 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2KP61086 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2KP61086 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE2KP61086 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE2KP61086 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE2KP61086 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE2KP61086 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE2KP61086 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE2KP61086 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE2KP61086 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE2KP61086 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2KP61086 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2KP61086 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE2KP61086 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE2KP61086 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE2KP61086 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE2KP61086 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE2KP61086 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE2KP61086 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE2KP61086 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE2KP61086 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE2KP61086 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE2KP61086 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
UBE2KP61086 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE2KP61086 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE2KP61086 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE2KP61086 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE2KP61086 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE2KP61086 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE2KP61086 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE2KP61086 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE2KP61086 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE2KP61086 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE2KP61086 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE2KP61086 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE2KP61086 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE2KP61086 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE2KP61086 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE2KP61086 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE2KP61086 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE2KP61086 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE2KP61086 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE2KP61086 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE2KP61086 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE2KP61086 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE2KP61086 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE2KP61086 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE2KP61086 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE2KP61086 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE2KP61086 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE2KP61086 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE2KP61086 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE2KP61086 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE2KP61086 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
UBE2KP61086 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE2KP61086 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE2KP61086 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE2KP61086 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE2KP61086 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE2KP61086 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE2KP61086 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE2KP61086 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms